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2017 年度 実績報告書

新規分析法を用いたモービリウイルス感染後のアセチル化ネットワークの包括的解析

研究課題

研究課題/領域番号 16H02587
研究機関東京大学

研究代表者

甲斐 知恵子  東京大学, 医科学研究所, 教授 (10167330)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2020-03-31
キーワードウイルス / アセチル化 / 脱アセチル化 / 遺伝子発現制御
研究実績の概要

我々はこれまでに麻疹ウイルスを含むモービリウイルス属が上皮系細胞でハウスキーピング遺伝子群の広範な発現低下を引き起こすことを発見し、この現象に宿主蛋白のアセチル化修飾状態の大きな変動が関与することを示唆する結果を得た。本研究課題では、モービリウイルス感染後の細胞のアセチル化の全動態を、近年確立された網羅的・定量的アセチローム解析により明らかにし、さらに宿主遺伝子発現変動とウイルス増殖との関与を明らかにすることを目標とする。
1)モービリウイルス感染後の上皮系細胞の定量的アセチローム解析・・・前年度の予備試験により定量的アセチローム解析のための条件検討を決定した。本年度は研究協力者が転出しそれに伴い自作サンプルの至適条件の決定に時間を費やしたが、年度内にサンプル調製を終え、解析に供することができた。
2)hMOFによるハウスキーピング遺伝子群発現制御・・・hMOF分子によるハウスキーピング遺伝子群の発現制御機構を検索することとした。本年度は、抗hMOF抗体を用いたChIP-seqの条件検討を行い、さらにhMOFと高分子複合体を形成する複数のサブユニットに対する抗体でも同様にChIP-seqを行うこととした。
3)ヒストンアセチル化変動の感染後宿主遺伝子群発現制御への関与・・・麻疹ウイルス感染時に起こるヒストンの特異的なリジン残基のアセチル化修飾の低下機序と宿主転写動態への実際の関与について検索を行った。特に本年度は、麻疹ウイルス感染によるhMOFの分解メカニズムを探索し、分解とヒストンアセチル化の減少との関連付けをより明白にした。
4)脱アセチル化酵素阻害剤のウイルス増殖能抑制効果・・・前年度に発見した、脱アセチル化酵素の一つに対する特異的阻害剤が麻疹ウイルスの増殖を著しく抑制する現象において、当該阻害剤がウイルス増殖過程のどのステップを阻害するかを新たに検索した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

1)麻疹ウイルス感染後の定量的アセチローム解析に関しては、前年度に細胞培養からウイルス感染までの条件を確立したため、続く質量分析用試料作製を研究協力者が分担して行う予定であった。しかし研究協力者の転出に伴い、試料作製の条件検討を自ら行うこととなったため研究に遅延が生じた。幸い年度内に自作サンプルの作製を終え、質量分析に供することができた。
2)hMOFによる遺伝子発現制御機構については、すでに報告実績のある市販抗体(抗hMOF抗体および関連分子の抗体)を用いてChIP-seqのサンプル作製を行い、外注企業へサンプルの一部を提供しバリデーションを行った。その結果、ChIPによるDNA濃縮が検出されず、他メーカーの抗体で再度試験することとなった。引き続き至適条件の検討を行っている。
3)ウイルス感染後のhMOFの分解機序について検索を行い、その結果、麻疹ウイルス感染後に脱アセチル化酵素の1つの発現が上昇し、それによりhMOF自身のアセチル化リジン残基の脱アセチル化が起こることでユビキチン経路による分解を受けること、およびそれによりヒストン特異的リジン残基のアセチル化が実際に低下するという、一連のメカニズムを解明することができた。
4)興味深いことに、前年度の解析の中で、アセチル化酵素の一つの特異的阻害剤の添加により麻疹ウイルスの増殖が著しく抑制されることが明らかになった。これまで報告のない現象であり、全く知られていない増殖抑制機序によるものと考えられることから、このメカニズムに関して研究を進めた結果、ウイルスゲノム複製には影響せず、ウイルス膜蛋白と細胞膜の融合過程に影響を及ぼすことが明らかになった。

今後の研究の推進方策

これからの研究の方向性については、1)-3)に特段の変更はない。特に、安定同位体ラベル法を用いた定量的アセチローム解析のサンプル提供を終えることができた事から、解析結果が得られた際は、アセチル化の増加および減少蛋白群に分け、それぞれの群にどのような蛋白が多く含まれるかをgene ontology解析により明らかにする。得られた結果を細胞で実際に反映する試験系を構築し、アセチローム解析の評価を行う。これら一連のデータは、ウイルス感染後のアセチル化動態の継時的変化として初めての成果になると考えられる。
また、hMOFによる遺伝子発現制御は、これまでの報告からhMOFを含む複数の分子からなる複合体形成が重要であると考えられるため、引き続きChIP-seq解析を行い、麻疹ウイルス感染後の宿主遺伝子発現に関与する分子の同定を試みる。さらに、感染後のhMOFの分解にアセチル化とユビキチン化の関連が示されたことから、この現象が宿主細胞だけでなくウイルス自身の感染-増殖にどのように関与するか検索を進める。
前年度見出された脱アセチル化酵素の阻害によるウイルス増殖の抑制に関しては、研究項目を新たに立てて解析を進めることとした。特に、この抑制効果がウイルスと細胞膜の融合に関わることが示されたことから、細胞膜蛋白とウイルス膜蛋白のアセチル化の変化を中心に解析を進め、この現象に関与する蛋白を同定する。

  • 研究成果

    (31件)

すべて 2017

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 1件、 査読あり 6件) 学会発表 (25件) (うち国際学会 13件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] FANTOM5 CAGE profiles of human and mouse samples2017

    • 著者名/発表者名
      Noguchi, S. et al.
    • 雑誌名

      Scientific Data

      巻: 4 ページ: 170112~170112

    • DOI

      10.1038/sdata.2017.112

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] The P gene of rodent brain-adapted measles virus plays a critical role in neurovirulence2017

    • 著者名/発表者名
      Arai Tetsuro、Terao-Muto Yuri、Uchida Shotaro、Lin Che、Honda Tomoyuki、Takenaka Akiko、Ikeda Fusako、Sato Hiroki、Yoneda Misako、Kai Chieko
    • 雑誌名

      Journal of General Virology

      巻: 98 ページ: 1620~1629

    • DOI

      10.1099/jgv.0.000842

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Gene end-like sequences within the 3′ non-coding region of the Nipah virus genome attenuate viral gene transcription2017

    • 著者名/発表者名
      Sugai Akihiro、Sato Hiroki、Yoneda Misako、Kai Chieko
    • 雑誌名

      Virology

      巻: 508 ページ: 36~44

    • DOI

      10.1016/j.virol.2017.05.004

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Efficacy of recombinant measles virus expressing highly pathogenic avian influenza virus (HPAIV) antigen against HPAIV infection in monkeys2017

    • 著者名/発表者名
      Fujiyuki Tomoko、Horie Ryo、Yoneda Misako、Kuraishi Takeshi、Yasui Fumihiko、Kwon Hyun-jeong、Munekata Keisuke、Ikeda Fusako、Hoshi Miho、Kiso Yuri、Omi Mio、Sato Hiroki、Kida Hiroshi、Hattori Shosaku、Kohara Michinori、Kai Chieko
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 7 ページ: 12017

    • DOI

      10.1038/s41598-017-08326-x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nipah and Hendra Virus Nucleoproteins Inhibit Nuclear Accumulation of Signal Transducer and Activator of Transcription 1 (STAT1) and STAT2 by Interfering with Their Complex Formation2017

    • 著者名/発表者名
      Sugai Akihiro、Sato Hiroki、Takayama Ikuyo、Yoneda Misako、Kai Chieko
    • 雑誌名

      Journal of Virology

      巻: 91 ページ: e01136-17

    • DOI

      10.1128/JVI.01136-17

    • 査読あり
  • [雑誌論文] An integrated expression atlas of miRNAs and their promoters in human and mouse2017

    • 著者名/発表者名
      de Rie D., et al.
    • 雑誌名

      Nature Biotechnology

      巻: 35 ページ: 872~878

    • DOI

      10.1038/nbt.3947

    • 査読あり
  • [学会発表] 未成熟雌リスザル卵胞内卵子の体外成熟とICSIによる胚盤胞作出2017

    • 著者名/発表者名
      渡辺真一、三浦恵、西萌香、横田伸一、服部正策、松本浩道、福井えみ子、日下部健、桑波田暁子、越知正憲、中潟直己、木曾康郎、甲斐知惠子、吉澤緑
    • 学会等名
      第58回日本卵子学会
  • [学会発表] 免疫系ヒト化マウスを用いた麻疹ウイルスの小動物感染モデル2017

    • 著者名/発表者名
      中西友子、米田美佐子、藤幸知子、雨貝陽介、斉藤泉、甲斐知惠子
    • 学会等名
      第64回日本実験動物学会
  • [学会発表] 東京大学医科学研究所実験動物センターにおける胚操作・生物遺伝資源バンクの活動状況2017

    • 著者名/発表者名
      星美穂、峯岸容子、宮川敦士、金子哲也、米田美佐子、甲斐知惠子
    • 学会等名
      第64回日本実験動物学会
  • [学会発表] An oncolytic measles virus as a novel promising tool for cancer therapy.2017

    • 著者名/発表者名
      Kai C
    • 学会等名
      Global Summit on Oncology & Cancer
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Nipah virus V protein is important for virus replication in porcine myeloid cells.2017

    • 著者名/発表者名
      Casey G., Yoneda M., Kai C and Weingartl H
    • 学会等名
      American Society for Virology-2017 Annual Meeting
    • 国際学会
  • [学会発表] A recombinant measles virus blind to SLAM shows anti-tumor activity against triple negative breast cancer cell lines.2017

    • 著者名/発表者名
      Fujiyuki T., Amagai Y., Shoji K., Sugai A., Awano M., Sato H., Yoneda, M. and Kai C.
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies (IUMS) 2017
    • 国際学会
  • [学会発表] Analysis of transcriptional regulatory network triggered by morbillivirus infection.2017

    • 著者名/発表者名
      Sato H., Yoneda M.,Nakamura T., Ikeda F., Kawai J., Hayashizaki Y. and Kai C.
    • 学会等名
      IUMS 2017
    • 国際学会
  • [学会発表] Muscle atrophy and stress responses in skeletal muscle expressing measles virus nucleocapsid protein.2017

    • 著者名/発表者名
      Kwon H-J., Watanabe Y., Nakanishi T., Honda T., Sato H., Nakae S., Ogonuki N., Ogura A., Yoneda M. and Kai C.
    • 学会等名
      IUMS 2017
    • 国際学会
  • [学会発表] Nucleocapsid protein of Nipah virus downregulates interferon stimulated genes by inhibiting the nuclea accumulation of STATs.2017

    • 著者名/発表者名
      Sugai A., Sato H., Takayama I., Yoneda M. and Kai C.
    • 学会等名
      IUMS 2017
    • 国際学会
  • [学会発表] Nipah virus C protein inhibits inflammatory cytokine induction by interacting with protein phosphatase 2A inhibitor.2017

    • 著者名/発表者名
      Horie R., Uchida S., Sato H., Kai C. and Yoneda M.
    • 学会等名
      IUMS 2017
    • 国際学会
  • [学会発表] The highly conserved tryptophan residue in V ptorein plays a critical role in neurovirulence of meales virus.2017

    • 著者名/発表者名
      Uchida S., Arai T., Sato H., Kai C. and Yoneda M.
    • 学会等名
      IUMS 2017
    • 国際学会
  • [学会発表] Utilization of humanized mice as a small animal model for measles virus infection.2017

    • 著者名/発表者名
      Nakanishi T., Yoneda M., Fujiyuki T., Amagai Y., Saito I. and Kai C.
    • 学会等名
      IUMS 2017
    • 国際学会
  • [学会発表] 正常免疫腫瘍移植モデルを用いた組換え麻疹ウイルスの治療効果および免疫の影響2017

    • 著者名/発表者名
      庄司紘一郎、藤幸知子、雨貝陽介、佐藤宏樹、米田美佐子、○甲斐知惠子
    • 学会等名
      第160回日本獣医学会学術集会
  • [学会発表] Raf1/MAPK経路の活性化は腫瘍溶解性麻疹ウイルスrMV-SLAMblindのイヌ細胞での増殖を促進する2017

    • 著者名/発表者名
      庄司紘一郎、藤幸知子、佐藤宏樹、米田美佐子、甲斐知惠子
    • 学会等名
      第160回日本獣医学会学術集会
  • [学会発表] Oncolytic measles virus, rMV-SLAMblind is efficient in tumor grafted immunocompitent mouse model.2017

    • 著者名/発表者名
      Kai C.
    • 学会等名
      第76回日本癌学会学術総会
    • 招待講演
  • [学会発表] 組換え麻疹ウイルスのスキルス胃癌細胞株に対する抗腫瘍効果2017

    • 著者名/発表者名
      Fujiyuki T, Shoji K, Sugai A, Yamaguchi H, Yanagihara K, Sato H, Yoneda M, Kai C.
    • 学会等名
      第76回日本癌学会学術集会
  • [学会発表] 正常免疫マウス腫瘍モデルを用いた組換え麻疹ウイルスの抗腫瘍効果に対する抗体の影響2017

    • 著者名/発表者名
      庄司紘一郎、雨貝陽介、藤幸知子、米田美佐子、甲斐知惠子
    • 学会等名
      第76回日本癌学会学術集会
  • [学会発表] Conparison of photoreceptor cells of the squirrel monkey and owl monkey.2017

    • 著者名/発表者名
      Yonetsu S., Kusakabe T., Yoshida Y., Yokota S., Hattori S., Kai C., Kano K. and Kiso Y.
    • 学会等名
      6th Asian Conference of Veterinary Anatomy
    • 国際学会
  • [学会発表] Development of oncolytic measles virus, rMV-SLAMblind.2017

    • 著者名/発表者名
      Kai C, ○Fujiyuki T, Shoji K, Sato H, Yoneda M.
    • 学会等名
      XXVth European Society of Gene & Cell Therapy
    • 国際学会
  • [学会発表] An oncolytic recombinant measles virus is a candidate of a novel therapeutic agent for triple negative breast cancer.2017

    • 著者名/発表者名
      Fujiyuki T, Amagai Y, Shoji K, Sugai A, Awano M, Sato H, Yoneda M, ○Kai C.
    • 学会等名
      XXVth European Society of Gene & Cell Therapy
    • 国際学会
  • [学会発表] 腫瘍溶解性麻疹ウイルスのイヌ細胞での増殖に対するRaf/MAPK経路の活性化の寄与2017

    • 著者名/発表者名
      庄司紘一郎、藤幸知子、佐藤宏樹、米田美佐子、甲斐知惠子
    • 学会等名
      第65回日本ウイルス学会学術集会
  • [学会発表] Role of UBXN1, a novel host protein interacting with measles virus V tprotein, in neuropathogenicity.2017

    • 著者名/発表者名
      内田翔太郎、新井哲郎、佐藤宏樹、甲斐知惠子、米田美佐子
    • 学会等名
      第65回日本ウイルス学会学術集会
  • [学会発表] Nucleocapsid protein of Nipah virus suppresses host interferon responses by interfering with STAT complex formation.2017

    • 著者名/発表者名
      菅井亮宏、佐藤宏樹、高山郁代、米田美佐子、甲斐知惠子
    • 学会等名
      第65回日本ウイルス学会学術集会
  • [学会発表] Immune inducibility of recombinant measles virus vaccines against Nipah virus infection in hamsters.2017

    • 著者名/発表者名
      林策、甲斐知惠子、米田美佐子
    • 学会等名
      第65回日本ウイルス学会学術集会
  • [学会発表] Oncolytic virotherapy with a recombinant measles virus for refractory breast cancer.2017

    • 著者名/発表者名
      Fujiyuki T, Amagai Y, Shoji K, Sugai A, Awano M, Sato H, Yoneda M, Kai C.
    • 学会等名
      第12回研究所ネットワーク国際シンポジウム
    • 国際学会

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公開日: 2019-12-27  

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