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感染症流行モデルにQuasi-species理論を導入し，ウイルスの塩基配列，感染者数，人の集団免疫の時間変化を表す数理モデルを提案した。粒子フィルタを用いて提案モデルにH1N1亜型のインフルエンザウイルスの塩基配列と感染者数の観測データをあてはめ，ウイルスの変異と流行規模を予測する手法を開発した。100,000粒子を用いて１カ月ごとにデータ同化を行い，6カ月後のウイルスのヘマグルチニン分子上のアミノ酸置換を予測した。その結果，本手法により，6カ月後のアミノ酸置換を，適合率79%，再現率53%で予測できることを明らかにした。
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