本研究で得られたメチル化シトシン選択性を有するDNA結合ユニットを利用することで、メチル化状態に依存したゲノム改変や転写調節が実現する。すなわち、正常細胞には影響を及ぼさず、メチル化機構に異常をきたしたガン細胞のみに作用するといった、副作用の少ない遺伝子標的治療への応用も期待される。また、本システムを利用して、従来の網羅的なメチル化解析に続くステップである「個々のメチル化の意義」に答えることで、エピゲノムの重要性が示唆されている発ガン、発生、分化、体内時計のメカニズム解明や創薬標的の決定、未だ萌芽的なRNAメチル化研究の推進に貢献すると期待される。
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