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2018 年度 実績報告書

MEMSとDNA融合プロセスによる光電気複合型ナノポアセンサデバイスの基盤構築

研究課題

研究課題/領域番号 16H03841
研究機関京都大学

研究代表者

田畑 修  京都大学, 工学研究科, 教授 (20288624)

研究分担者 菅野 公二  神戸大学, 工学研究科, 准教授 (20372568)
川合 健太郎  大阪大学, 工学研究科, 助教 (90514464)
研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
キーワードナノポアセンシング / DNA / MEMS
研究実績の概要

DNAナノ構造に直径30nmの金ナノ粒子を2個結合し、DNAナノ構造を分解することによってシリコン基板上への二量体形成に成功した。基板上にランダム配置した金ナノ粒子二量体によるSERS分子検出を実施した結果、検体分子に由来するSERSシグナルの高感度検出に成功した。金ナノ粒子二量体のナノポア近傍への固定に向け、DNAナノ構造の固定化を実施した結果、56%の高い固定化率を達成した。直径5nmの金ナノ粒子を成長させDNAナノ構造の形状に沿った大粒径金ナノ粒子の二量体を形成した結果、5%以下の収率で所望の二量体が形成されることを確認した。
金ナノ粒子二量体を用いたSERSによる光学的DNA塩基識別に関して、8鎖長DNAオリゴマー内に含まれる単一のアデニンからラマンピークを得るとともに、ラマンシフトのばらつきから空間分解能について検証した。電気的DNA検出・識別実現のため、ナノギャップを有する金配線を作製し、DNAオリゴマー分散溶液を滴下した際のトンネル電流時間変化から16鎖長DNAオリゴマーの検出に成功した。高いレーザ光強度で検出確率が向上することを明らかにした。
銅媒基板上へCVD成膜させたグラフェンを間接転写法によりた異方性ウェットエッチングした酸化膜付シリコン基板に転写し、スピンコート法により塗布した金ナノ粒子をマーカーとしてフォーカス調整とドーズ量を最適化したHeイオンビームを用い、あらかじめ設定した描画シーケンスにより任意の間隔と孔径を持ったグラフェンナノポアアレイを作製した。作製したナノポア基板の両面に銀/塩化銀電極を挿入したDNA溶液チャンバーを接続して電圧を印加し、パッチクランプアンプによる微小電流測定によりDNAセンシングを行った。迅速な熱交換が可能なマイクロ流路を用い、従来のDNAナノ構造体作製法に比べ最大20倍のアニール時間の短縮と歩留まりの改善を実現した。

現在までの達成度 (段落)

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2019 2018 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 4件、 招待講演 3件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] AFMリソグラフィで作製したナノ領域へのDNAオリガミの特異的固定2019

    • 著者名/発表者名
      山下直輝, 朴 晟洙, 馬 志鵬, 川合 健太郎, 平井 義和, 土屋 智由, 田畑 修
    • 雑誌名

      電気学会論文誌E(センサ・マイクロマシン部門誌)

      巻: 139-E ページ: 95-102

    • DOI

      https://doi.org/10.1541/ieejsmas.139.95

    • 査読あり
  • [雑誌論文] リンカーによる三角形DNAオリガミ二量体形成における支配要因の解明2018

    • 著者名/発表者名
      稲垣達也, 朴晟洙, 山下直輝, 馬志鵬, 川合健太郎, 平井義和, 土屋智由, 田畑修
    • 雑誌名

      電気学会論文誌E(センサ・マイクロマシン部門誌)

      巻: 138-E ページ: 171-177

    • DOI

      https://doi.org/10.1541/ieejsmas.138.171

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nanopore Fabrication of Two-Dimensional Materials on SiO2 Membranes Using He Ion Microscopy2018

    • 著者名/発表者名
      T. Hayashi, K. Arima, N. Yamashita, S. Park, Z. Ma, O. Tabata, K. Kawai
    • 雑誌名

      IEEE Transactions on Nanotechnology

      巻: 17 ページ: 727-730

    • DOI

      10.1109/TNANO.2018.2840721

    • 査読あり
  • [学会発表] Surface-Enhanced Raman Spectroscopy of DNA Bases Using Gold Nanoparticle Dimer Array2018

    • 著者名/発表者名
      Katsunari Maruoka, Kohei Ikegami, Akio Uesugi, Koji Sugano, Yoshitada Isono
    • 学会等名
      31st International Microprocesses and Nanotechnology Conference (MNC2018)
    • 国際学会
  • [学会発表] Si薄膜被覆金ナノグレーティング構造の近赤外域光吸収スペクトル偏光依存性2018

    • 著者名/発表者名
      新居直之, 上杉晃生, 菅野公二, 磯野吉正
    • 学会等名
      第34回「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム
  • [学会発表] MEMS & NEMS - Past, Present and Future -2018

    • 著者名/発表者名
      OSAMU Tabata
    • 学会等名
      The 1st IEEE International Conference on Micro/Nano Sensors for AI, Healthcare, and Robotics
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Micro/Nano Sensor - Present and Future -2018

    • 著者名/発表者名
      OSAMU Tabata
    • 学会等名
      1st Internationale Symposium on Micro/Nano Sensors for Healthcare and Smart City
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Nanopore Fabrication and DNA sensing on Two-Dimensional Materials using Helium Ion Microscopy2018

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Kawai, Takumi Hayashi, Kenta Arima, Kazuya Yamamura, Osamu Tabata
    • 学会等名
      The 13th Annual IEEE International Conference on Nano/Micro Engineered and Molecular Systems (IEEE-NEMS 2018)
    • 国際学会
  • [学会発表] Effect of Temperature Distribution in Microtube and Microfluidic Channel for DNA Origami Assembly2018

    • 著者名/発表者名
      K. Hara, T. Inagaki, N. Yamashita, K. Arima, K. Yamamura, O. Tabata, K. Kawai
    • 学会等名
      The 22nd International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences (MicroTAS 2018)
    • 招待講演
  • [学会発表] マイクロ流路を用いたDNA自己組織ナノ構造体の高速作製2018

    • 著者名/発表者名
      原 啓太、稲垣 達也、山下 直輝、有馬 健太、山村 和也、田畑 修、川合 健太郎
    • 学会等名
      第35回「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム
  • [学会発表] 三次元DNAオリガミ構造作製におけるアニール条件及びDNA濃度比の影響2018

    • 著者名/発表者名
      中村亮太、原 啓太、有馬 健太、山村 和也、田畑 修、川合 健太郎
    • 学会等名
      第35回「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム
  • [備考] Control of Gold Nano Dimer Structure

    • URL

      http://www.nms.me.kyoto-u.ac.jp/en/2018/06/nanodimer/

  • [備考] Creating Gold Nanoparticle Dimers

    • URL

      http://www.nms.me.kyoto-u.ac.jp/en/2017/04/sacrifitialdnaorigami/

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公開日: 2019-12-27  

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