18000種類以上の組換えタンパク質を用いて、ゲノムワイドなタンパク質絶対定量であるin vitro proteome assisted MRM for protein absolute quantification(iMPAQT)法を確立した(Nature Methods, 2017)。さらに、試料調製や導入法を改良することで高感度化し、少数細胞プロテオーム解析を実現可能とした。また、細胞周期制御因子p57を新規がん幹細胞マーカーとして同定し、これを指標にがん幹細胞を濃縮する手法を確立した。最終的にこれらを組み合わせたマルチオミクス解析によってがん幹細胞の分子シグニチャの同定を行なった。
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