• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2017 年度 実績報告書

繁殖時期の多様化による広域分布種の種内分化機構

研究課題

研究課題/領域番号 16H04831
研究機関京都大学

研究代表者

瀬戸口 浩彰  京都大学, 地球環境学堂, 教授 (70206647)

研究分担者 川口 正代司  基礎生物学研究所, 共生システム研究部門, 教授 (30260508)
研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
キーワード開花 / 繁殖成長 / 栄養成長 / 生殖前隔離 / 環境相互作用 / ミヤコグサ / ハマダイコン
研究実績の概要

同一植物における開花時期の違いは、種内における生殖前隔離をもたらし、これが世代を重ねることによって種分化をもたらすことが想定される。本年度の研究では、マメ科ミヤコグサを用いて、主に日長を主とする複合要因で開花時期が制御される機構について、アブラナ科ハマダイコンを対象にして、低温要求性(春化)が主な開花制御要因となっている機構について解析を進めた。ミヤコグサの開花時期の種内多型に関わる研究では、沖縄本島において日本列島の分布域を網羅する132系統の共通圃場実験を行った。これまでに得られている愛知県岡崎市と宮崎県におけるデータに加え、より極端な環境での開花時期多型を記録することができた。沖縄での開花所要日数データを加えた全ゲノム関連解析では、複数の形質データを用いる解析モデルにより、既知の開花遺伝子を含む有力な候補遺伝子を検出した。これまでに得られていた開花時期多型データに加えて、沖縄での形質データを用いることで解析力を上げることができ、より明瞭に候補遺伝子を得ることができた。ハマダイコンでの研究では、前年度までに春化による開花制御に関わる遺伝子がFLC-A と COL-5 であることがわかったために、春化を必要とする北方系統と、必要としない南方系統を対象にしてqRT-PCRでそれぞれの発現を解析した。なお、ハマダイコンにおいてFLC-Aは開花促進を、COL-5は開花抑制の機能をもっている。春化を施す処理の解析の結果、 北方系統ではFLC-Aだけが一定量発現する事で開花が促進されているのに対して、南方系統ではFLC-A と COL- 5 の両方が発現しつつ、かつFLC-Aの発現量が極めて高いレベルにあることがわかった。このように、拮抗的な二つの遺伝子が、南北系統間では発現様式を変えていることが明らかになった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

前年度の天候不順によるミヤコグサの屋外育成(沖縄県糸満市における農地)が今年度は順調に出来、播種から開花開始所要日数のデータを多くの系統と個体において計測することが出来た。これによって、開花に関する適応的な遺伝子座の推定を行いやすくなった。また、圃場の環境データも微細に取ることが出来たので、開花に関わる環境要因についても詳細なデータを取得することが出来た。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最後年度であるために、今後に新たな研究費目において継続を行いたい。とくに、本研究と並行して仙台で進められていた研究結果との融合も計る計画である。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2019 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (2件)

  • [国際共同研究] オーフス大学(デンマーク)

    • 国名
      デンマーク
    • 外国機関名
      オーフス大学
  • [雑誌論文] Comparative chloroplast genomics of series Sakawanum in genus Asarum (Aristolochiaceae) to develop single nucleotide polymorphisms (SNPs) and simple sequence repeat (SSR) markers2019

    • 著者名/発表者名
      Takahashi, D., Sakaguchi,S., Isagi, Y., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Journal of Forest Research

      巻: - ページ: -

    • DOI

      10.1080/13416979.2018.1518649

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Postglacial East Asian origin of the alpine shrub Phyllodoce aleutica in Beringia2018

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, H., Yakubov, V., Barkalov, V., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Journal of Biogeography

      巻: 45 ページ: 1260-1274

    • DOI

      10.1111/jbi.13230

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Genetic structure of the clonal herb Tanakaea radicans (Saxifragaceae) at multiple spatial scales, revealed by nuclear and mitochondrial microsatellite markers2018

    • 著者名/発表者名
      Sakaguchii, S., Takahashi, D., Setoguchi, H., Isagi, Y.
    • 雑誌名

      Plant Species Biology

      巻: 33 ページ: : 81-87

    • DOI

      10.1111/1442-1984.12196

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Genetic diversity of Saxifraga acerifolia and S. fortune based on nuclear and chloroplast microsatellite markers2018

    • 著者名/発表者名
      Magota, K., Sakaguchi, S., Akai, K., Isagi, Y., Setoguchi, H.
    • 雑誌名

      Bulletin of the National Science Museum of Nature and Science, Series B.

      巻: 44 ページ: 85-96

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Approximate Bayesian computation analysis of EST associated microsatellites indicates that the broadleaved evergreen tree Castanopsis sieboldii survived the Last Glacial Maximum in multiple refugia in Japan2018

    • 著者名/発表者名
      Aoki, K., Tamaki, I., Nakao, K., Ueno, S.,Kamijo, T., Setoguchi, H., Murakami, N., Kato, M., Tsumura, Y.
    • 雑誌名

      Heredity

      巻: 122 ページ: 326-340

    • DOI

      10.1038/s41437-018-0123-9

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Detecting loci contributing local adaptation through flowering time in Lotus japonicus in Japan2017

    • 著者名/発表者名
      若林智美,田中幸子,Stig U. Andersen,佐藤修正,川口正代司,瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      日本植物分類学会第16回大会
  • [学会発表] Genome-wide association study for differences of flowering time variation under two conditions in Lotus japonicus in Japan2017

    • 著者名/発表者名
      若林智美、Stig U.Andersen、佐藤修正、川口正代司、瀬戸口浩彰
    • 学会等名
      全ゲノム関連解析によるミヤコグサの地域適応遺伝子の探索. 日本生態学会 第64回大会

URL: 

公開日: 2021-01-27  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi