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2018 年度 実績報告書

転写装置の新規機能とネットワーク解析による生存戦略の再評価

研究課題

研究課題/領域番号 16H04903
研究機関東京農業大学

研究代表者

吉川 博文  東京農業大学, 生命科学部, 教授 (50175676)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
キーワードRNAポリメラーゼ / コア酵素 / 転写開始機構 / プロモーター認識 / 緊縮応答 / 異種遺伝子発現 / 枯草菌 / 耐熱化
研究実績の概要

本研究を通じて転写装置の特にコアポリメラーゼの新規機能を解析してきたが、異なる目標から出発した2つの研究が、最終的にプロモーターの認識嗜好性に、シグマ因子ではなくコア酵素が重要な働きをしているという新しい知見に集約された点が最大の成果である。第1の研究は、緊縮応答の解析において、アラーモン(p)ppGppの合成能を欠失させた株のアミノ酸飢餓時における増殖能を回復させたRNAPコア酵素の抑圧変異が転写開始点ヌクレオチドA/Gの認識嗜好性を変化させたという結果である。
この研究は、生育回復効果がメチオニン(Met)の添加によって打ち消されるという不可思議な現象に直面し、この謎を解明すべく取り組んだところ、Metの代謝産物であるS-Adenosyl Methionine(SAM)がGTP生合成経路の酵素GuaBのCBS domainに結合してGTP生合成を活性化させたために、アミノ酸飢餓への適応性を阻害したことが明らかになった。この結果は、緊縮応答だけに留まらず、GTPレベルの量的制御という機構が、さまざま環境変化への適応に必須であることを再認識させることとなり、そこに新たにMet代謝が関与しているという、細菌におけるグローバルなヌクレオチド制御機構を明らかにすることに繋がった。
第2の研究は、枯草菌における異種遺伝子発現の複雑な転写制御系解析の中で、特に大腸菌シグマAによって認識されるが、同じコンセンサス配列を持ちながら枯草菌シグマAには認識されないlacUV5プロモーターを対象とし、枯草菌RNAポリメラーゼ変異株を探索した結果、コア酵素の変異によって認識できるようになった株を取得した結果である。この変異はコア酵素のDNA認識部位の近傍にあり、プロモーター認識能に変化を与えた可能性がある。これらの結果より、コアのプロモーター認識機構という新たな制御系を見出した。

現在までの達成度 (段落)

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2020 2019

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Novel (p)ppGpp0 suppressor mutations reveal an unexpected link between methionine catabolism and GTP synthesis in Bacillus subtilis.2020

    • 著者名/発表者名
      Osaka N, Kanesaki Y, Watanabe M, Watanabe S, Chibazakura T, Takada H, Yoshikawa H, Asai K.
    • 雑誌名

      Mol Microbiol.

      巻: 113 ページ: 1155-1169

    • DOI

      10.1111/mmi.14484.

    • 査読あり
  • [学会発表] 枯草菌を用いた遺伝子重複と変異による転写装置の機能分化の解析2020

    • 著者名/発表者名
      石垣 媛菜、吉川 博文、朝井 計
    • 学会等名
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
  • [学会発表] 枯草菌細胞内におけるシアノバクテリアRNAポリメラーゼの構築2020

    • 著者名/発表者名
      佐藤 龍一、美田 知也、渡辺 智、兼崎 友、板谷 光泰、吉川 博文、朝井 計
    • 学会等名
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
  • [学会発表] メチオニン代謝が関与するGTP生合成の新規な制御機構の解析2019

    • 著者名/発表者名
      大坂夏木、高田啓、兼崎友、門屋亨介、田口精一、渡辺智、千葉櫻拓、吉川博文、朝井計
    • 学会等名
      第13回日本ゲノム微生物学会年会
  • [学会発表] IS 256Bsu1 のCRISPR/dCas9 システムによるtransposase発現抑制系の開発2019

    • 著者名/発表者名
      片野 亘、徳山 麻里、朝井 計、吉川 博文
    • 学会等名
      第13回日本ゲノム微生物学会年会
  • [学会発表] 枯草菌2-オキソグルタル酸脱水素酵素複合体の遷移期に おける機能解析2019

    • 著者名/発表者名
      山口将司,吉川博文,朝井 計
    • 学会等名
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [学会発表] 枯草菌を用いた分子シャペロンによる変異緩衝作用につ いての検証2019

    • 著者名/発表者名
      加納啓吾,北村夏美,法花津匠,大塚まみ,武井若紗, 小菅是子,朝井 計,吉川博文
    • 学会等名
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [学会発表] メチオニン代謝が関与するGTP生合成の新規な制御機構の解析2019

    • 著者名/発表者名
      大坂夏木、高田啓、兼崎友、門屋亨介、田口精一、渡辺智、千葉櫻拓、吉川博文、朝井計
    • 学会等名
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [学会発表] 枯草菌RNAP のiNTP に対する嗜好性の解析2019

    • 著者名/発表者名
      渡辺愛美,円谷優佑,大坂夏木,吉川博文, 朝井 計,兼崎 友
    • 学会等名
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [学会発表] 合成生物シアノバチルスにおける合成ゲノム再起動計画2019

    • 著者名/発表者名
      渡辺 智,朝井 計,赤沼元気,千葉櫻拓,河村富士夫,板谷光泰,吉川博文
    • 学会等名
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [学会発表] CRISPR/dCas9 システムを用いたIS 256Bsu1 trasposase の枯草菌168 株への影響の解析2019

    • 著者名/発表者名
      片野 亘,徳山麻里,吉川博文,朝井 計
    • 学会等名
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [学会発表] Characterization of novel suppressor mutations of Bacillus subtilis (p)ppGpp0 strain not involved in GTP biosynthesis.2019

    • 著者名/発表者名
      Natsuki Osaka, Hiraku Takada, Yu Kanesaki, Ryosuke Kadoya, Seiichi Taguchi, Satoru Watanabe, Taku Chibazakura, Hirofumi Yoshikawa, Kei Asai
    • 学会等名
      20th International Conference on Bacilli and Gram-Positive Bacteria.
    • 国際学会
  • [学会発表] Novel regulatory mechanism of Methionine metabolism involved in GTP biosynthesis.2019

    • 著者名/発表者名
      大坂夏木、高田啓、兼崎友、門屋亨介、田口精一、渡辺智、千葉櫻拓、吉川博文、朝井計
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会

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公開日: 2021-01-27  

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