研究課題
本研究計画では核内構造体の一つであり、転写および、スプライシングに密接に関連したnuclear specklesがDNA二重鎖切断(DSB)修復に及ぼす影響を明らかにすることを目的とした。そのために、nuclear specklesを構成する因子を対象としたsiRNAライブラリーとDSB修復のうち相同組換え修復(HR)を定量的に検出するDirect-Repeat GFPアッセイにより、HRに関与するnuclear speckles因子を複数同定した。これらのうち、脱ユビキチン化酵素であるUSP42について解析を進め、USP42はlow-complexity domainを介してnuclear specklesへ局在し、このnuclear specklesへの局在がHR促進、とくにDNA-end resectionに重要であることを明らかにした。さらに、USP42をベイトとした質量分析によりUSP42と相互作用する因子としてDNA-RNAヘリカーゼであるDHX9を同定し、DHX9がUSP42と同一経路上でHRに機能すること、両者がDSBに伴って発生するDNA-RNAハイブリッド構造(R-loop)の解消に促進的に機能することを示した。さらに、HRに重要な役割を果たすタンパク質であるBRCA1のDSB部位への動員にもUSP42および、DHX9が必要とされることを見出した。また、DHX9とBRCA1がDNAあるいはRNA依存的に相互作用することを明らかにした。
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
すべて 2020 2019
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bioRxiv
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https://doi.org/10.1101/776823