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2017 年度 実績報告書

Comprehensive analysis of splicing regulation and splicing quantitative trait loci (sQTL) in brains of major psychoses

研究課題

研究課題/領域番号 16H06254
研究機関横浜市立大学

研究代表者

高田 篤  横浜市立大学, 医学部, 講師 (90643693)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2020-03-31
キーワード選択的スプライシング / ゲノム / 統合失調症
研究実績の概要

H29年度までの研究において、脳内で選択的スプライシングと有意に関連する量的形質座位(splicing quantitative trait loci: sQTL)を網羅的に同定し、そのリソースを作成した。さらに、ゲノムワイド関連解析(genome-wide association study: GWAS)で統合失調症等と関連を認めた座位では有意にsQTLが多いこと、統合失調症とゲノムワイドな有意水準で関連する108の座位のうち4つで、関連SNPが脳sQTLとして働いていることを明らかにした(Takata et al., Nature Communications 2017)。上述の、脳神経系でsQTLとして働く統合失調症関連SNPのうち一部については、iPS細胞由来神経細胞を用いた、他グループからの独立した研究でも同様の所見が確認された。また、スプライスサイト近傍のエクソン領域の変異を含めて、自閉スペクトラム症患者で認めるde novo変異の統合的バイオインフォマティクス解析(ゲノムデータと遺伝子発現データ等の複合的解析)を行い、その結果を報告した(Takata et al., Cell Reports 2018)。統合失調症群と健常群で選択的スプラインイベントを比較した解析では、多重検定の補正を超えて有意な差を認めるイベントは同定されなかった。深部イントロンに存在し、選択的スプライシングに影響を及ぼすことによって疾患リスクに関与する変異について、RNA-seqを用いた予備的検討を行った。

現在までの達成度
現在までの達成度

2: おおむね順調に進展している

理由

当初の予定通り、統合失調症群と健常群で選択的スプラインイベントを比較した解析を行ったが、多重検定の補正を超えて有意な差を認めるイベントは同定されなかった。また関連プロジェクトとして、自閉スペクトラム症患者のゲノムデータを、遺伝子発現データ等と複合的に解析し、その成果を学術誌に報告した。

今後の研究の推進方策

GWASで疾患との関連を認めるゲノム領域に絞るなど合理的な方法で検定仮説を減らし、精神神経疾患の病態に関与する可能性がある選択的スプライシングイベントの同定を目指す。また、昨年度に予備的解析を行った、深部イントロンに存在し、選択的スプライシングに影響を及ぼすことによって疾患リスクに関与する変異の同定及び実験的証明を目指す。さらに、選択的スプライシングに関与する稀な変異の同定を目指して、全ゲノムシーケンスデータを用いた予備的解析を行うことを計画している。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2018 2017 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Integrative Analyses of De Novo Mutations Provide Deeper Biological Insights into Autism Spectrum Disorder2018

    • 著者名/発表者名
      Takata A.、Miyake N.、Tsurusaki Y. et al.
    • 雑誌名

      Cell Rep

      巻: 22 ページ: 734-747

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2017.12.074

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 【基礎研究で活躍する精神科医の魂はいずこに宿るか?】 ゲノム研究でDisorderをDiseaseにする試み2017

    • 著者名/発表者名
      高田 篤
    • 雑誌名

      日本生物学的精神医学会誌

      巻: 28 ページ: 140-143

  • [雑誌論文] 【精神医学研究の発展可能性に関する長期展望:臨床への還元の視点とともに】 ゲノム研究発展の長期展望2017

    • 著者名/発表者名
      高田 篤、吉川 武男
    • 雑誌名

      精神科

      巻: 30 ページ: 206-212

  • [雑誌論文] 【自閉スペクトラム症(ASD)研究の動向】 自閉スペクトラム症のゲノム研究 Exome, whole genome and beyond2017

    • 著者名/発表者名
      高田 篤、松本 直通
    • 雑誌名

      分子精神医学

      巻: 17 ページ: 17254-260

  • [学会発表] Integrative genetic analysis of neuropsychiatric disorders2017

    • 著者名/発表者名
      高田 篤
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会
  • [学会発表] 最先端の遺伝研究が解き明かすゲノム因性精神神経発達障害2017

    • 著者名/発表者名
      高田 篤
    • 学会等名
      第113回 日本精神神経学会学術総会
  • [備考] De novo変異の統合的ビッグデータ解析により 自閉スペクトラム症の新たな生物学的知見を獲得

    • URL

      https://www.yokohama-cu.ac.jp/amedrc/news/20180117Matsumoto.html

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公開日: 2018-12-17  

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