融合遺伝子に注目した卵巣癌の病態解明と新しい治療戦略の構築

2018 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 16H06267
• 研究機関: 新潟大学
• 研究代表者: 吉原 弘祐 新潟大学, 医歯学系, 研究准教授 (40547535)
• 研究期間 (年度): 2016-04-01 – 2019-03-31
• キーワード: 融合遺伝子 / トランスレーショナルリサーチ / ゲノム医学 / 卵巣癌

研究実績の概要

申請者の所属する施設にすでに保管され、インフォームドコンセントにより同意の得られている婦人科癌症例の凍結癌組織より、Invitrogen 社のTRIzol を用いてtotal RNA を抽出、品質を確認後、Illumina 社のTruSeq RNA サンプル調整キットを用い、ライブラリー作成後Illumina HiSeq2500でペアエンドRNA シークエンス(100bp)を実施した。卵巣明細胞癌57症例のRNAシークエンスデータを用いて、卵巣明細胞癌の融合遺伝子リストを作成した。融合遺伝子の中でキナーゼ融合遺伝子など治療標的になるものを抽出したところ、10症例（17.5%）で少なくとも一つは治療標的融合遺伝子を有していることを明らかにした。また融合遺伝子のneoantigenとしての意義を検討するために、INTEGRATEを実施した。その結果、18症例（31.6%）で少なくとも一つはneoantigenになりうる融合遺伝子を有していることを突き止めた。卵巣明細胞癌20症例の全エクソンシークエンスの結果から、各症例における遺伝子変異頻度は他の癌腫と比較して高くなく、卵巣明細胞癌においては遺伝子変異だけでなく融合遺伝子がneoantigen発生メカニズムとして重要であることが示唆された。
また、卵巣肉腫に対する全エクソンシークエンス ＋ RNAシークエンスによるゲノム・トランスクリプトーム解析を行い、ドライバー遺伝子候補として、NUTM1融合遺伝子・PRUNE遺伝子変異を同定し、NUT1-associated tumorであることを報告した。

現在までの達成度 (段落)

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [雑誌論文] Concurrent isolated retroperitoneal HGSC and STIC defined by somatic mutation analysis: a case report (2019)
  • 著者名/発表者名: Suda Kazuaki、Nakaoka Hirofumi、Hata Chihiro、Yahata Natsumi、Isobe Masanori、Kameyama Hitoshi、Wakai Toshifumi、Motoyama Teiichi、Inoue Ituro、Yoshihara Kosuke、Enomoto Takayuki
  • 雑誌名: Diagnostic Pathology 巻: 14 ページ: 17
  • DOI: 10.1186/s13000-019-0795-3
• [雑誌論文] Novel MXD4-NUTM1 fusion transcript identified in primary ovarian undifferentiated small round cell sarcoma (2018)
  • 著者名/発表者名: Tamura Ryo、Nakaoka Hirofumi、Yoshihara Kosuke、Mori Yutaro、Yachida Nozomi、Nishikawa Nobumichi、Motoyama Teiichi、Okuda Shujiro、Inoue Ituro、Enomoto Takayuki
  • 雑誌名: Genes, Chromosomes and Cancer 巻: 57 ページ: 557～563
  • DOI: 10.1002/gcc.22668
• [雑誌論文] Clonal Expansion and Diversification of Cancer-Associated Mutations in Endometriosis and Normal Endometrium (2018)
  • 著者名/発表者名: Suda Kazuaki、Nakaoka Hirofumi、Yoshihara Kosuke、Ishiguro Tatsuya、Tamura Ryo、Mori Yutaro、Yamawaki Kaoru、Adachi Sosuke、Takahashi Tomoko、Kase Hiroaki、Tanaka Kenichi、Yamamoto Tadashi、Motoyama Teiichi、Inoue Ituro、Enomoto Takayuki
  • 雑誌名: Cell Reports 巻: 24 ページ: 1777～1789
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2018.07.037
• [雑誌論文] The Safety and Effectiveness of Abdominal Radical Trachelectomy for Early-Stage Cervical Cancer During Pregnancy (2018)
  • 著者名/発表者名: Yoshihara Kosuke、Ishiguro Tatsuya、Chihara Makoto、Shima Eiri、Adachi Sosuke、Isobe Masanori、Haino Kazufumi、Yamaguchi Masayuki、Sekine Masayuki、Kashima Katsunori、Takakuwa Koichi、Nishikawa Nobumichi、Enomoto Takayuki
  • 雑誌名: International Journal of Gynecologic Cancer 巻: 28 ページ: 782～787
  • DOI: 10.1097/IGC.0000000000001218
• [雑誌論文] Novel therapeutic strategy for cervical cancer harboring FGFR3-TACC3 fusions (2018)
  • 著者名/発表者名: Tamura R, Yoshihara K, Saito T, Ishimura R, Martinez-Ledesma JE, Xin H, Ishiguro T, Mori Y, Yamawaki K, Suda K, Sato S, Itamochi H, Motoyama T, Aoki Y, Okuda S, Casingal CR, Nakaoka H, Inoue I, Verhaak RGW, Komatsu M, Enomoto T
  • 雑誌名: Oncogenesis 巻: 7 ページ: 4~4
  • DOI: 10.1038/s41389-017-0018-2
• [雑誌論文] The impact of stromal Hic-5 on the tumorigenesis of colorectal cancer through lysyl oxidase induction and stromal remodeling (2018)
  • 著者名/発表者名: Omoto Tomokatsu、Kim-Kaneyama Joo-ri、Lei Xiao-Feng、Orimo Akira、Ohnishi Koji、Yoshihara Kosuke、Miyauchi Aya、Li Shuo、Gao Lin、Umemoto Takahiro、Tanaka Junichi、Nakahara Kenta、Takeya Motohiro、Ishida Fumio、Kudo Shin-ei、Haraguchi Shogo、Miyazaki Takuro、Miyazaki Akira
  • 雑誌名: Oncogene 巻: 37 ページ: 1205～1219
  • DOI: 10.1038/s41388-017-0033-y
• [雑誌論文] TumorFusions: an integrative resource for cancer-associated transcript fusions (2018)
  • 著者名/発表者名: Hu Xin、Wang Qianghu、Tang Ming、Barthel Floris、Amin Samirkumar、Yoshihara Kosuke、Lang Frederick M、Martinez-Ledesma Emmanuel、Lee Soo Hyun、Zheng Siyuan、Verhaak Roel G W
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 46 ページ: D1144～D1149
  • DOI: 10.1093/nar/gkx1018
• [学会発表] The first nationwide Japanese multicenter study: Characterizing the cross-sectional approach to ovarian cancer genetic testing of BRCA (CHARLOTTE) (2019)
  • 著者名/発表者名: Kosuke Yoshihara, Takayuki Enomotoa, Daisuke Aoki, Yoh Watanabe, Junzo Kigawa, Nobuhiro Takeshima, Keita Fujikawa, Kana Hattori, Hitoshi Tsuda, Toru Sugiyama
  • 学会等名: Society of Gynecologic Oncology 50th annual meeting
  • 国際学会
• [学会発表] オミックスデータ解析から婦人科悪性腫瘍の起源を探る (2019)
  • 著者名/発表者名: 吉原弘祐
  • 学会等名: 第71回日本産科婦人科学会学術講演会
  • 招待講演
• [学会発表] 遺伝子発現プロファイルに基づいた卵巣癌の予後予測モデルの構築 (2018)
  • 著者名/発表者名: 吉原弘祐、榎本隆之、日本漿液性卵巣癌研究グループ
  • 学会等名: 第6回婦人科がんバイオマーカー研究会
• [学会発表] Integrated analysis of genomic and transcriptomic data in ovarian clear cell carcinoma (2018)
  • 著者名/発表者名: Kosuke Yoshihara
  • 学会等名: 日韓台シンポジウム
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 卵巣癌における相同組換え修復異常 (2018)
  • 著者名/発表者名: 吉原弘祐
  • 学会等名: 第135回関東連合産科婦人科学会学術集会
  • 招待講演
• [学会発表] 婦人科癌ゲノミクスの現状と課題 (2018)
  • 著者名/発表者名: 吉原弘祐
  • 学会等名: JSAWI 2018 annual symposium
  • 招待講演
• [学会発表] Somatic mutations on cancer-associated genes in endometriosis and normal uterine endometrium (2018)
  • 著者名/発表者名: Kosuke Yoshihara
  • 学会等名: International Gynecologic Cancer Society 2018
  • 国際学会 / 招待講演