生命科学連携推進協議会

2017 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 16H06297
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 今井 浩三 東京大学, 医科学研究所, 客員教授
• 研究期間 (年度): 2016 – 2021
• キーワード: 生命科学連携推進協議会 / コホート・生体試料支援 / 先端バイオイメージング支援 / 先端モデル動物支援 / 先進ゲノム解析研究推進 / 各プラットフォーム間の連携

研究実績の概要

生命科学分野を中心とした学術研究支援基盤として、全国の生命科学研究に関する科研費に係る個々の研究課題へ、技術支援・リソース支援・技術相談等を提供する4つのプラットフォーム(コホート・生体試料/先端バイオイメージング/先端モデル動物/先進ゲノム解析研究)が形成された。本生命科学連携推進協議会は、これらの4つのプラットフォームの中に示した70を超える支援機能を有する全国の48大学・24研究機関が、密に連携できるように総括班を中心に活動した。
本支援事業のさらなる周知の必要性から、日本分子生物学会と日本生化学会の合同年会への4プラットフォーム合同出展を共催し、説明や個別相談に積極的に対応するとともに、支援ニーズにより合ったプラットフォームの紹介等にも尽力した。また、ホームページにウェブパンフレットを公開したほか、支援説明会・シンポジウムや市民公開講座を主催および共催にて行った。さらに、支援に係る経費の一部徴収に関しては、実務的な課題に関する議論を進める一方、所管課である学術研究助成課にご指導いただき、支援対象者の意見を聞き取るため、対面および配布・回収の方法によるアンケートを複数回実施した。
また、「社会との接点活動」班では、市民公開シンポジウムを中心として、生命科学研究に伴う研究倫理の問題について市民の方々への情報発信と様々な疑問にお答えする機会を提供した。また、本年度も我が国を代表する生命科学研究者による「外部評価委員会」を開催し、有益な助言を得ることができた。さらに本年度は、生命科学系支援プラットフォームが将来的にも実効性のある支援を提供できる持続可能な基盤であるために必要な課題等を討議する、将来検討部会を組織した。
運営面では、総括班(幹事および各プラットフォームの代表とで計l6名)が支援機能を横断しつつ取りまとめ、事務局機能を担う東京大学医科学研究所を中心として、討論を重ね引き続き機動性を確保した支援を提供している。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

・4つのプラットフォームが一堂に会して、全国の研究者に対して支援説明会ならびに成果シンポジウムを開催した。さらに、パネルディスカッションにおいて、4つのプラットフォーム関係者とシンポジスト(支援を受けている研究者)から得られた興味深い意見交換を開催し、その記録を本協議会のHPに公開した。
・総括班会議を開催し、問題点を吟味して、今後の展開も議論した。そのほかにもメール審議を複数回開催して、プラットフォーム間の連携ならびに調整を図った。さらに、各プラットフォームで展開している広報体制や、学会との関係構築も情報交換することができている。
・支援機能をさらに高めるために、研究支援分担者が先進性の高い海外の支援実態を現地調査するとともに、その成果をHP上に公開した。
・コーディネータが内外の連絡・調整機能を担いながら、支援対象者の利便性を高めている。
・支援に係る経費の一部徴収に関しては、部会長を中心に、各プラットフォームからの委員で数度の部会を開催し、実務的な課題を解決する議論を進めるとともに、支援対象者からの意見聴取を開始した。
・生命科学研究に伴う研究倫理の問題については、「社会との接点活動」班が、本年度は大阪で市民公開シンポジウムを開催したところ、多数の市民が参加した。引き続き議論の場を提供している。
・我が国を代表する生命科学者からなる外部評価委員会を実施して、有益で建設的な助言を得た。
・将来検討部会を組織し、今後数年間の方向性を議論する体制ができた。

今後の研究の推進方策

①総括班会議 年1～2回
1. これまでに外部評価委員会、将来検討部会等で抽出された課題を解決するための施策の検討
2. 各プラットフォーム・各支援機関との調整
3. 課金、知的財産、契約に関する考え方の調整(規程作成部会 年1～2回)
4. コーディネータを通じての支援実態の把握及び助言、各地域性を考慮した支援に関する課題解決
5. 市民公開シンポジウム等の広報・利用者拡大の方策検討
6. 支援の持続性・発展性の確保(将来検討部会 年1～2回)
②各プラットフォームとの連携構築 年2回程度
③説明会・成果シンポジウム 年1回程度
1. 科研費による研究全体の実質化に貢献するべく、最先端研究のみならず、若手研究者も含めて多様なニーズへの「支援」も推進できるよう、実りある説明会・成果シンポジウムならびにパネルデスカッションを実施するとともに、アンケート等を通じた要望の聞き取りを継続する。
2. このほか、各プラットフォームの境を越えた支援・研究内容のシンポジウムを共催することで、実質的な連携の強化を図る。
3. 市民を対象としたシンポジウムやセミナーについても費用対効果を検証しながらトータルの参加者数の拡大を目指し、国民に支えられ国民に資する、研究及び研究支援についての理解醸成を継続する。

研究成果

• [雑誌論文] Retrograde signaling from progranulin to Sortl counteracts synapse elimination in the developing cerebellum (2018)
  • 著者名/発表者名: Uesaka N, Abe M, Konno K, Yamazaki M, Sakoori K, Watanabe T, Kao T-H, Mikuni T, Watanabe M, Sakimura K, Kano M.
  • 雑誌名: Neuron 巻: 97 ページ: 796-805
  • DOI: 10.1016/j.neuron.2018.01.018
  • 査読あり
• [雑誌論文] Intracellular calcium signal at the leading edge regulates mesodermal sheet migration during Xenopus gastrulation. (2018)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, K., Yamamoto, T. S, and Ueno, N.
  • 雑誌名: Sci. Reports 巻: 8 ページ: 2433
  • DOI: 10.1038/s41598-018-20747-w
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The effect of forced expression of mutated K-RAS gene on gastrointestinal cancer cell lines and the IGF-1R targeting therapy. (2017)
  • 著者名/発表者名: Matsunaga Y, Adachi Y, Sasaki Y, Koide H, Motoya M, Nosho K, Takagi H, Yamamoto H, Sasaki S, Arimura Y, Tokino T, Carbone DP, Imai K, Shinomura Y.
  • 雑誌名: Mol Carcinog 巻: 56 号: 2 ページ: 515-526
  • DOI: 10.1002/mc.22513
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Cancer transitional care for terminally ill cancer patients can reduce the number of emergency admissions and emergency department visits. (2017)
  • 著者名/発表者名: Shimada N, Ishiki H, Iwase S, Chiba T, Fujiwara N, Watanabe A, Kinkawa J, Nojima M, Tojo A, Imai K.
  • 雑誌名: American Journal of Hospice & Palliative Medicine 巻: 34 号: 9 ページ: 831-837
  • DOI: 10.1177/1049909116658641
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Silencing PRDM14 expression by an innovative RNAi therapy inhibits stemness, tumorigenicity, and metastasis of breast cancer. (2017)
  • 著者名/発表者名: Taniguchi H, Hoshino D, Moriya C, Zembutsu H, Nishiyama N, Yamamoto H, Kataoka K, Imai K.
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 8 号: 29 ページ: 46856-46874
  • DOI: 10.18632/oncotarget
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] HEGl is a novel mucin-like membrane protein that serves as a diagnostic and therapeutic target for malignant mesothelioma. (2017)
  • 著者名/発表者名: Tsuji S, Washimi K, Kageyama T, Yamashita M, Matsuura R, Yokose T, Kamada Y, Hayashi H, Morohoshi T, Tsuura Y, Yusa T, Sato T, Togayachi A, Narimatsu H, Nagasaki T, Nakamoto K, Moriwaki Y, Misawa H, Hiroshima K, Miyagi Y, Imai K.
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 7 ページ: 45768
  • DOI: 10.1038/srep45768
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Inhibition of PRDM14 expression in pancreatic cancer suppresses cancer stem-like properties and liver metastasis in mice. (2017)
  • 著者名/発表者名: Moriya C, Taniguchi H, Imai K.
  • 雑誌名: Carcinogenesis 巻: 38 号: 6 ページ: 638-648
  • DOI: 10.1093/carcin/bgx040
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Establishment of a refined culture method for rat colon organoids. (2017)
  • 著者名/発表者名: Isshiki H, Arimura Y, Nagaishi K, Kawakami K, Onodera K, Yamashita K, Naishiro Y, Fujimiya M, Imai K, Shinomura Y.
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 489 号: 3 ページ: 305-311
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2017.05.142
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The effect of forced expression of mutated K-RAS gene on gastrointestinal cancer cell lines and the IGF-IR targeting therapy. (2017)
  • 著者名/発表者名: Matsunaga Y, Adachi Y, Sasaki Y, Koide H, Motoya M, Nosho K, Takagi H, Yamamoto H, Sasaki S, Arimura Y, Tokino T, Carbone DP, Imai K, Shinomura Y.
  • 雑誌名: Mol Carcinog. 巻: 56 号: 2 ページ: 515-526
  • DOI: 10.1002/mc.22513
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Retrograde BDNF to TrkB signaling promotes synapse elimination in the developing cerebellum (2017)
  • 著者名/発表者名: Choo M, Miyazaki T, Yamazaki M, Kawamura M, Nakazawa T, Zhang J, Tanimura A, Uesaka N, Watanabe M, Sakimura K, Kano M.
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 8 ページ: 195
  • DOI: 10.1038/s41467-017-00260-w
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Decreased KPNB1 Expression is Induced by PLK1 Inhibition and Leads to Apoptosis in Lung Adenocarcinoma (2017)
  • 著者名/発表者名: Sekimoto N, Suzuki Y, Sugano S.
  • 雑誌名: J Cancer. 巻: 8 ページ: 4125-4140
  • DOI: 10.7150/jca.21802
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Combinatory use of distinct single-cell RNA-seq analytical platforms reveals the heterogeneous transcriptome response. (2017)
  • 著者名/発表者名: Kashima Y, Suzuki A, Liu Y, Hosokawa M, Matsunaga H, Shirai M, Arikawa K, Sugano S, Suzuki Y., et al
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 8 ページ: 3482
  • DOI: 10.1038/s41598-018-21161-y
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Distinct intracellular Ca2+ dynamics regulate apical constriction and differentially contribute to neural tube closure. (2017)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, M., Sato, M., Koyama, H., Hara, Y., Hayashi, K., Yasue, N., Imamura H., Fujimori, T., Nagai, T. Camphbell, R. E. and Ueno, N.
  • 雑誌名: Development 巻: 144 ページ: 1307-1316
  • DOI: 10.1242/dev.141952
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Genes coding for cyclin-dependent kinase inhibitors are fragile in Xenopus. (2017)
  • 著者名/発表者名: Tanaka, T., Ochi, H., Takahashi, S., Ueno, N., and Taira, M.
  • 雑誌名: Dev. Biol. 巻: 426 号: 2 ページ: 291-300
  • DOI: 10.1016/j.ydbio.2016.06.019
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Modeling alveolar soft part sarcoma unveils novel mechanisms of metastasis. (2017)
  • 著者名/発表者名: Tanaka M, Homme M, Yamazaki Y, Shimizu R, Takazawa Y, Nakamura T.
  • 雑誌名: Cancer Res 巻: 77 ページ: 897-904
  • DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-16-2486
  • 査読あり
• [雑誌論文] CIC-DUX4 induces small round cell sarcomas distinct from Ewing sarcoma (2017)
  • 著者名/発表者名: Yoshimoto T, Tanaka M, Homme M, Yamazaki Y, Takazawa Y, Antonescu CR, Nakamura T
  • 雑誌名: Cancer Res 巻: 77 ページ: 2927-2937
  • DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-16-3351
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] The use of an optimized chimeric envelope glycoprotein enhances the efficiency of retrograde gene transfer of a pseudotyped lentiviral vector in the primate brain. (2017)
  • 著者名/発表者名: Tanabe S, *Inoue K, Tsuge H, Uezono S, Nagaya K, Fijiwara M, Kato S, Kobayashi K, *Takada M
  • 雑誌名: Neurosci Res 巻: 120 ページ: 45-52
  • DOI: 10.1016/j.neures.2017.02.007
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] High-speed and scalable whole-brain imaging in rodents and primates. (2017)
  • 著者名/発表者名: Seiriki K, Takada M, Hashimoto H, et al.
  • 雑誌名: Neuron 巻: 94 ページ: 1085-1100
  • DOI: 10.1016/j.neuron.2017.05.017
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] 日本の疾患コホートとしてのバイオバンクジャパンの取組 (2017)
  • 著者名/発表者名: 村上善則
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 35 号: 17 ページ: 2861-2866
• [雑誌論文] Homovanillic acid and 5-hydroxyindole acetic acid as biomarkers for dementia with Lewy bodies and coincident Alzheimer's disease : An autopsy-confirmed study. (2017)
  • 著者名/発表者名: Morimoto S, Takao M, Hatsuta H, Nishina Y, Komiya T, Sengoku R, Nakano Y, Uchino A, Sumikura H, Saito Y, Kanemaru K, Murayama S
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 12 号: 2 ページ: e0171524
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0171524
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Neuron-specific methylome analysis reveals epigenetic regulation and tau-related dysfunction of BRCA1 in Alzheimer's disease. (2017)
  • 著者名/発表者名: Mano T, Tsuji S, Ushijima T, Murayama S, Hasegawa M, Iwata A, et al.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A. 巻: 114 号: 45 ページ: E9645-E9654
  • DOI: 10.1073/pnas.1707151114
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] HEG1 is a Novel Mucin-like Membrane Protein That is Useful for the Diagnosis of Malignant Mesothelioma. (2018)
  • 著者名/発表者名: Hiroshima K, Miyagi Y, Tsuji S, Imai K.
  • 学会等名: USCAP 2018 Annual Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] Mechanisms of activity-dependent synapse elimination in the developing cerebellum (2018)
  • 著者名/発表者名: Kano M.
  • 学会等名: The 8th Brain Research Institute International Symposium
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Multiple phases of activity-dependent synapse elimination in the developing cerebellum (2018)
  • 著者名/発表者名: Kano M.
  • 学会等名: The 4th Symposium of NEUROSCIENCE NETWORK IN KOBE
  • 招待講演
• [学会発表] 個別化医療とゲノム診療 (2018)
  • 著者名/発表者名: 村上善則
  • 学会等名: 新潟大学医歯薬学総合病院生命科学センター遺伝子医療セミナー
  • 招待講演
• [学会発表] ゲノム医療基礎研究成果によるオーダーメイド医療の実現へ向けた取り組み (2018)
  • 著者名/発表者名: 村上善則
  • 学会等名: ゲノム医療基礎研究成果によるオーダーメイド医療の実現へ向けた取り組み
  • 招待講演
• [学会発表] Molecular, cellular, and circuit mechanisms of developmental synapse elimination in the cerebellum (2017)
  • 著者名/発表者名: Kano M.
  • 学会等名: Gordon Research Conference on Cerebellum
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] BDNF to TrkB signaling regulated by mGlul promotes climbing fiber synapse elimination in the developing cerebellum (2017)
  • 著者名/発表者名: Kano M.
  • 学会等名: 9th International Meeting on Metabotropic Glutamate Receptors
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] A Novel Membrane Invagination Controls Oriented Cell Division in Ascidian Embryo. (2017)
  • 著者名/発表者名: Ueno N.
  • 学会等名: 18th International Congress of Developmental Biology
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] The molecular function of ASPSCR1-TFE3 in alveolar soft part sarcoma (2017)
  • 著者名/発表者名: Tanaka M, Nakamura T.
  • 学会等名: AACR Special Conference on Advances in Sarcomas : From basic science to clinical translation
  • 国際学会
• [学会発表] 骨軟部肉腫のGDAモデル : がんの生物学と治療法評価系としての重要性 (2017)
  • 著者名/発表者名: 中村卓郎
  • 学会等名: 第76回日本癌学会学術総会
  • 招待講演
• [学会発表] ゲノム医療実現に向けたオーダーメイド医療の実現化ブログラムの取り組みと病理組織バンキングの構築 (2017)
  • 著者名/発表者名: 村上善則、湯地晃一郎、松田浩一
  • 学会等名: 第11回ゲノム病理標準化センター講習会
  • 招待講演
• [学会発表] ゲノム医科学研究を支える基盤としてのバイオバンクジャパン (2017)
  • 著者名/発表者名: 村上善則、平田真、湯地晃一郎、松田浩一
  • 学会等名: 第62回日本人類遺伝学会シンポジウム「我が国のバイオバンクジャパンやコホートの現状とその将来」
  • 招待講演
• [学会発表] ゲノム解析に基づくがん研究と臨床応用 (2017)
  • 著者名/発表者名: 村上善則
  • 学会等名: ゲノム解析に基づくがん研究と臨床応用
  • 招待講演
• [学会発表] アルツハイマー病の神経病理診断基準 (2017)
  • 著者名/発表者名: 村山繁雄
  • 学会等名: 第58回日本神経病理学会総会学術研究会
• [学会発表] Pathogenic mechanism on propagation of alpha-synuclein, a pathological point of view. (2017)
  • 著者名/発表者名: Murayama S, Saito Y.
  • 学会等名: 第60回日本神経化学会大会
• [学会発表] プリオン病の神経病理Update. (2017)
  • 著者名/発表者名: 村山繁雄
  • 学会等名: 第35回日本神経治療学会総会
• [学会発表] 「Alzheimer's disease : phenotypic variability and its molecular backgrounds」 Neuropathological variations in Alzheimer's disease. (2017)
  • 著者名/発表者名: 村山繁雄
  • 学会等名: 第36回日本認知症学会NINPRO-JSDR2017 Joint International Symposium
• [備考] コホート・生体試料支援プラットフォームホームページ
  • URL: http://cohort.umin.jp/
• [備考] 先端バイオイメージング支援プラットフォームホームページ
  • URL: http://www.nibb.ac.jp/abis/
• [備考] 先端モデル動物支援プラットフォームホームページ
  • URL: http://model.umin.jp/
• [備考] 生命科学連携推進協議会ホームページ
  • URL: http://mos-jp.com/platform2/index.html
• [備考] 東京大学医科学研究所 学術研究基盤支援室ホームページ
  • URL: http://www.academicsupport.jp/
• [備考] 先進ゲノム解析研究推進プラットフォームホームページ
  • URL: https://www.genome-scj.jp/