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2016 年度 実績報告書

環境変化応答性人工蛋白質ナノブロック開発と自己組織化ナノ構造形成ダイナミクス解析

研究課題

研究課題/領域番号 16H06837
研究機関信州大学

研究代表者

小林 直也  信州大学, 繊維学部, アソシエイト研究員 (60781945)

研究期間 (年度) 2016-08-26 – 2018-03-31
キーワード人工蛋白質 / 蛋白質ナノブロック / 自己組織化 / 環境応答 / ダイナミクス解析
研究実績の概要

本研究は、人工蛋白質の環境変化に応答した会合状態及び構造の変化を詳細に調べることにより、ダイナミックに構造変化する環境変化応答性人工蛋白質を設計開発すること、さらにそれらの環境変化応答性人工蛋白質を蛋白質ナノブロックとして応用し、自己組織化ナノ構造形成のダイナミクスを解析することを目的とする。特に、pH変化に応答する人工蛋白質や蛋白質ナノブロックの設計開発及び解析に取り組むことにより、環境変化に応答するナノ構造空間の創製及び制御を目指す。
平成28 年度 は 人工蛋白質のpH 変化に対する応答性を調べるため、低pH条件・中性pH条件・高pH条件のそれぞれの溶媒条件に調整した人工蛋白質についてゲルろ過クロマトグラフィー(SEC)、小角X線散乱(SAXS)、円偏光二色性(CD)スペクトル解析、熱変性解析、超遠心分析(AUC)を行った。その結果、低pH条件において、ゲルろ過溶出体積が大幅に変化し、変性中点温度の低下を確認した。一方で、CDスペクトルの形状と強度には低pH条件と中性pH条件の間で大きな変化が見られず、SAXSとAUCによる分子量解析からも会合状態に変化は見られなかった。
この人工蛋白質を蛋白質ナノブロックの構成要素として応用し、形成されるナノ構造体のpH変化に対する応答性をnative PAGEとゲルろ過クロマトグラフィーにより調べた。その結果、低pH条件から中性pH条件へと溶媒条件を変化させることにより、ナノ構造体が再構成されることを確認した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

平成28年度は研究実施計画の通り「環境変化応答性人工蛋白質の設計開発」を実施し、pH環境変化に応答してナノ構造体を再構成させることができる人工蛋白質及び人工蛋白質ナノブロックの開発に成功した。

今後の研究の推進方策

平成29 年度は、研究実施計画の「 (2) 人工蛋白質ナノブロック自己組織化ナノ構造形成のダイナミクス解析」として、会合平衡状態にある人工蛋白質のpH変化に応答した分子形状変化を詳細に調べるため、ゲルろ過-小角X線散乱(SEC-SAXS)解析を行う。さらに、円偏光二色性スペクトル実験による蛋白質二次構造解析を行い、SEC-SAXSの結果を組み合わせることで、環境変化応答性人工蛋白質のpH変化応答性構造形成ダイナミクスを達成する。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2017 2016

すべて 雑誌論文 (4件) (うちオープンアクセス 4件、 査読あり 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 4件、 招待講演 5件)

  • [雑誌論文] Design and construction of self-assembling supramolecular protein complexes using artificial and fusion proteins as nanoscale building blocks.2017

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi, N., Arai, R.
    • 雑誌名

      Curr. Opin. Biotech.

      巻: 46 ページ: 57-65

    • DOI

      10.1016/j.copbio.2017.01.001

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 二量体形成新規人工タンパク質を用いたタンパク質ナノブロック開発による自己組織化ナノ構造複合体の創製2016

    • 著者名/発表者名
      小林直也,新井亮一
    • 雑誌名

      分子研レターズ

      巻: 73 ページ: 30-31

    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] 人工蛋白質で「かたち」をつくろう―ブロック遊びしようよ!―2016

    • 著者名/発表者名
      小林直也,新井亮一
    • 雑誌名

      生物工学会誌

      巻: 94 ページ: 270

    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] バイナリーパターン配列デザインによるデノボ蛋白質の創出と蛋白質ナノブロックによる超分子複合体の創生2016

    • 著者名/発表者名
      小林直也,木村尚弥,新井亮一
    • 雑誌名

      生物工学会誌

      巻: 94 ページ: 485-488

    • オープンアクセス
  • [学会発表] pH-dependent structural transition of self-assembling nanostructures constructed from protein nanobuilding blocks using a dimeric de novo protein2017

    • 著者名/発表者名
      Naoya Kobayashi, Takuya Sengoku, Takaaki Sato, Ryoichi Arai
    • 学会等名
      Okazaki Conference 2017 on Grand Challenges in Small-angle Scattering
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • 年月日
      2017-03-18 – 2017-03-20
    • 国際学会
  • [学会発表] Self-assembling supramolecular nanostructures created from de novo protein nanobuilding blocks2017

    • 著者名/発表者名
      Naoya Kimura, Naoya Kobayashi, Ryoichi Arai
    • 学会等名
      Okazaki Conference 2017 on Grand Challenges in Small-angle Scattering, Okazaki
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • 年月日
      2017-03-18 – 2017-03-20
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] タンパク質ナノブロックによる動的秩序構造形成2017

    • 著者名/発表者名
      木村尚弥、小林直也、新井亮一
    • 学会等名
      日本化学会第97春季年会
    • 発表場所
      慶應義塾大学日吉キャンパス(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2017-03-16 – 2017-03-19
    • 招待講演
  • [学会発表] Dynamical Ordering Nanostructures Constructed from Protein Nanobuilding Blocks2017

    • 著者名/発表者名
      Naoya Kimura, Naoya Kobayashi, Ryoichi Arai
    • 学会等名
      The 5th International Symposium of Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
    • 発表場所
      東京大学(東京都目黒区)
    • 年月日
      2017-01-21 – 2017-01-22
    • 国際学会
  • [学会発表] 人工蛋白質ナノブロックによる多様な自己組織化超分子ナノ構造複合体:ネオバイオ超分子の創生を目指して2016

    • 著者名/発表者名
      小林直也、木村尚弥、新井亮一
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2016-11-30 – 2016-12-02
    • 招待講演
  • [学会発表] 人工タンパク質をブロックに見立てた超分子ナノ構造複合体の設計構築2016

    • 著者名/発表者名
      小林直也、木村尚弥、新井亮一
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25 – 2016-11-27
    • 招待講演
  • [学会発表] De Novo Protein Nano-Building Block Approach for “Synthetic Structural Biology” to Create Artificial Supramolecular Protein Complexes2016

    • 著者名/発表者名
      Ryoichi Arai, Naoya Kimura, Naoya Kobayashi, Michael H. Hecht
    • 学会等名
      THE 42nd NAITO CONFERENCE ON In the Vanguard of Structural Biology: Revolutionizing Life Sciences
    • 発表場所
      シャトレーゼ ガトーキングダム サッポロ(北海道札幌市)
    • 年月日
      2016-10-04 – 2016-10-07
    • 国際学会
  • [学会発表] 蛋白質ナノブロック用超安定化人工蛋白質SUWA (Super WA20)の特性解析及び構造解析2016

    • 著者名/発表者名
      木村尚弥、小林直也、新井亮一
    • 学会等名
      第68回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      富山国際会議場・ANAクラウンプラザホテル(富山県富山市)
    • 年月日
      2016-09-28 – 2016-09-30
  • [学会発表] Self-assembling supramolecular nano-architectures created from de novo protein nano-building blocks2016

    • 著者名/発表者名
      Naoya Kimura, Naoya Kobayashi, Ryoichi Arai
    • 学会等名
      第68回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      富山国際会議場・ANAクラウンプラザホテル(富山県富山市)
    • 年月日
      2016-09-28 – 2016-09-30
    • 招待講演

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公開日: 2018-01-16  

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