研究課題/領域番号 |
16K00397
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
研究分野 |
生命・健康・医療情報学
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研究機関 | 鹿児島大学 (2018) 長崎大学 (2016-2017) |
研究代表者 |
石川 岳志 鹿児島大学, 理工学域工学系, 教授 (80505909)
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研究分担者 |
野口 博司 日本薬科大学, 薬学部, 教授 (60126141)
竹内 二士夫 東京聖栄大学, 公私立大学の部局等, 教授 (70154979)
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研究期間 (年度) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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キーワード | ヒト主要組織適合抗原 / ベーチェット病 / エピトープ予測 / 結合親和性予測 / ドッキング計算 / フラグメント分子軌道法 |
研究成果の概要 |
本研究ではヒト白血球型抗原(HLA)とペプチド断片との結合親和性をコンピュータで予測する方法を開発した。既存の方法は実験で得られた親和性のデータベースを利用するのに対し、我々の方法はHLAの構造情報のみから親和性を予測する。したがって、実験例の少ないHLAアレルに対しても予測可能となることが大きな特徴である。また、ベーチェット病(BD)の抗原ペプチドの候補と考えられている「AAAAAIFVI」の相対的な結合親和性が、BDと相関のあるHLA-B*51では高く、相関の無いHLA-B*52では低いという計算結果が得られた。これは、AAAAAIFVIがBDの抗原ペプチドであることを支持する結果である。
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自由記述の分野 |
計算化学
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研究成果の学術的意義や社会的意義 |
本研究で開発したHLAとペプチド断片の結合親和性の予測法は、特定のHLAに結合するペプチドの網羅的探索に利用可能であり、他のHLA関連疾患への応用も期待される。例えば、リウマチや糖尿病といった生活習慣病、様々な自己免疫疾患、癌などもHLAと有意な相関を示すことが知られている。さらに、ウイルス感染における免疫応答の個人差や、抗原提示を利用したペプチドワクチンの開発などにおいても、HLAとペプチドの親和性が重要な意味を担っている。今後、結合親和性の予測精度を向上させることができれば、これらを含む様々な医学・薬学研究に貢献することが期待される。
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