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2018 年度 実績報告書

脂質膜を介した生体超分子構造形成機構の解析に資する固体NMR測定法開発と適用

研究課題

研究課題/領域番号 16K05858
研究機関分子科学研究所

研究代表者

西村 勝之  分子科学研究所, 物質分子科学研究領域, 准教授 (00334631)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
キーワード固体NMR / アミロイドβ / オリゴマー / 脂質膜 / 構造解析
研究実績の概要

本研究は、脂質二重膜との相互作用により特定構造を取り、分子間で会合して複合体を形成し、その機能を発現する膜表在性タンパク質、および、脂質結合ペプチドの立体構造解析に有効な固体核磁気共鳴(NMR)分光法の開発を行う。また、固体NMR分光法を用いて、当該試料の典型的な解析対象となる脂質膜上で誘起されるアミロイド線維、およびその線維化前の会合中間体の立体構造解析に適用し、線維形成機構の解明を行うことを目的としている。
本年度は、昨年度に続き、GM1含有脂質二重膜に結合したアミロイドβ(1-40)に関して、数種のアミノ酸種選択的、および残基特異的13C、15N全標識試料を調製して、13C同種核相関2次元固体NMR測定を行い、より信頼性の高い信号帰属を実現した。得られた化学シフト値に基づく二次構造解析により、分断されたβシート構造を持つことが判明した。さらに、スピンラベルをC末端に導入した非標識Aβ(1-40)を含有した試料でParamagnetic Relaxation Enhancement(PRE)による相関信号の消失および減少を検出し、C末端と近い残基を特定することに成功した。これらの情報に基づき、分子間配座を含めた分子構造の構築を行っている。
また、15N-13C異種核2次元相関NMRに必要なDouble Cross Polarization(DCP)法の改良を試み、既存の測定法で複数の因子に関して各条件最適化を行うことにより大幅な感度向上を実現した。さらに、既報の改良型測定法に関して、特定条件下では性能が大幅に低下することを確認し、これを改善する手法の理論的検討を行った。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2019 2018

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Effective Synthesis and Their Copolymerization of Fluorine-Containing Phenanthrene with Hydroxyl Group2019

    • 著者名/発表者名
      S. Kataoka, H. Fukumoto, T. Kawasaki-Takasuka, T. Yamazaki, K. Nishimura, T. Agou, T. Kubota
    • 雑誌名

      Journal Fluorine Chemistry

      巻: 218 ページ: 84-89

    • DOI

      10.1016/j.jfluchem.2018.11.017

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Quantitative Analysis of Solid-State Homonuclear Correlation Spectra of Antiparallel β-sheet Alanine Tetramer2018

    • 著者名/発表者名
      A. Naito, K. Okushita, K. Nishimura, G. S. Boutis, A. Aoki, T. Asakura
    • 雑誌名

      Journal of Physical Chemistry B

      巻: 122 ページ: 2715-2724

    • DOI

      10.1021./acs.jpcb.7b11126

    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] 固体NMR法によるGM1ガングリオシド膜上におけるアミロイドβの構造解析2019

    • 著者名/発表者名
      矢木真穂,西村勝之, 加藤晃一
    • 学会等名
      日本薬学会第139年会
  • [学会発表] 固体 NMR 法を用いたガングリオシド膜上におけるアミロイドβの構造解析2018

    • 著者名/発表者名
      矢木真穂,加藤晃一,西村勝之
    • 学会等名
      第57回 NMR討論会

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公開日: 2019-12-27  

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