マイクロサテライト不安定性を呈する大腸癌のゲノム・エピゲノム解析

2018 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 16K07143
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 田中 敏明 東京大学, 医学部附属病院, 講師 (30647540)
• 研究分担者: 渡邉 聡明 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (80210920) [辞退] ; 石原 聡一郎 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (00376443) ; 山口 博紀 東京大学, 医学部附属病院, 登録研究員 (20376445) [辞退] ; 河津 正人 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, ユニット長 (20401078) ; 野澤 宏彰 東京大学, 医学部附属病院, 准教授 (80529173) ; 川合 一茂 東京大学, 医学部附属病院, 講師 (80571942) ; 畑 啓介 東京大学, 医学部附属病院, 特任講師 (60526755)
• 研究期間 (年度): 2016-04-01 – 2019-03-31
• キーワード: マイクロサテライト不安定性 / 大腸がん / 免疫染色

研究実績の概要

1) さらに19例を追加し、次世代シーケンサーを用いた全エクソン解析を行った。ミスマッチ修復遺伝子の生殖細胞系列変異を有するリンチ症候群随伴大腸腫瘍とミスマッチ修復遺伝子の体細胞変異を有するいわゆるリンチ様大腸腫瘍の変異プロファイルが類似し、それらはMLH1メチル化大腸癌とは変異プロファイルが異なることが明らかとなった。KRAS、APC、TCF7L2変異はリンチ症候群随伴またはリンチ様大腸癌により多く、BRAF、RNF43変異はMLH1メチル化大腸癌により多く認めた。リンチ様大腸癌はMLH1メチル化大腸がんと比べて若年発症であることが示された。また、TP53変異や、NTRK1、NTRK3、RET、BRAFの融合遺伝子が複数の症例で認められた。
2) 全エクソン解析で同定された候補遺伝子変異について遺伝子発現ベクターを作成し、細胞生物学的な実験(ルシフェラーゼアッセイ、3T3細胞を用いたトランスフォーメーションアッセイ、ヌードマウスを用いた造腫瘍能の検討)を行った。ERBB2(L755S）およびERBB2(L841I)が発がんドライバー変異であることが示された。
3) DNAミスマッチ修復蛋白の免疫染色を行い、MSH2欠損腫瘍では、MSH2およびMSH6の免疫染色が陰性であり、MLH1とPMS2の免疫染色が陽性であることを確認した。また、シーケンスによる変異情報と対比することにより変異が妥当であるということが示された。

研究成果

• [雑誌論文] Differential regulation of CpG island methylation within divergent and unidirectional promoters in colorectal cancer (2019)
  • 著者名/発表者名: Namba Shinichi、Sato Kazuhito、Kojima Shinya、Ueno Toshihide、Yamamoto Yoko、Tanaka Yosuke、Inoue Satoshi、Nagae Genta、Iinuma Hisae、Hazama Shoichi、Ishihara Soichiro、Aburatani Hiroyuki、Mano Hiroyuki、Kawazu Masahito
  • 雑誌名: Cancer Science 巻: 110 ページ: 1096～1104
  • DOI: 10.1111/cas.13937
• [雑誌論文] Fusion Kinases Identified by Genomic Analyses of Sporadic Microsatellite Instability?High Colorectal Cancers (2018)
  • 著者名/発表者名: Sato Kazuhito、Kawazu Masahito、Yamamoto Yoko、Ueno Toshihide、Kojima Shinya、Nagae Genta、Abe Hiroyuki、Soda Manabu、Oga Takafumi、Kohsaka Shinji、Sai Eirin、Yamashita Yoshihiro、Iinuma Hisae、Fukayama Masashi、Aburatani Hiroyuki、Watanabe Toshiaki、Mano Hiroyuki
  • 雑誌名: Clinical Cancer Research 巻: 25 ページ: 378～389
  • DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-18-1574