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2018 年度 実績報告書

LINE1配列のストランド特異的分布とMARを介したクロマチン制御機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 16K07196
研究機関金沢大学

研究代表者

堀家 慎一  金沢大学, 学際科学実験センター, 准教授 (40448311)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
キーワードゲノムインプリンティング / LINE1配列 / MAR結合タンパク質
研究実績の概要

我々は,親由来の明らかなヒト15番染色体を1本保持したマウスニューロン様細胞株F12を樹立し,15q11-q13領域のゲノムインプリンティング制御メカニズムの解明に取り組んできた。興味深いことに,15q11-q13領域に関してはLINE1配列がDNAストランド特異的高密度分布をとることが見出されている。そこで,我々はこのLINE1配列のストランド特異的高密度分布を示す領域のBACをプローブにDNA-FISH解析を行った結果,神経細胞でのみ父片アレル特異的にクロマチンが大きく広がった脱凝集構造をとることを見出した。また,LINE1配列のストランド特異的高密度分布を示す領域内のMAR(PWS-IC)を欠失させると,本来凝集している母方アレルにおいてもクロマチン脱凝集構造が出現するなど,LINE1配列がMARを介した染色体ドメインレベルのクロマチン構造形成に寄与している可能性が示唆された。そこで,本研究で我々はCRISPR/Cas9システムを用いてMAR結合タンパク質,Satb1の欠損細胞株を樹立した。Satb1欠損F12細胞にて,15q11-q13領域のクロマチン脱凝集状態を解析した所,正常細胞株と比較し脱凝集が小さくなっていることが明らかとなった。一方,Satb1を強制発現させたF12細胞では,クロマチン脱凝集状態が正常に比べ大きく広がっていることを見出した。このことから,15q11-q13領域のクロマチン脱凝集の構築には,MAR結合タンパク質,Satb1が大きく関わっていることが明らかとなった。また,興味深いことに,Satb1の欠損細胞株において,15q11-q13領域のMAGEL2/NDNの発現が低下していることが明らかとなった。現在我々は,クロマチン脱凝集の縮小が,染色体ドメインレベルの遺伝子発現制御に影響を与えている可能性を考えている。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2018

すべて 雑誌論文 (1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] プラダー・ウィリー/アンジェルマン症候群責任遺伝子座におけるノンコーディングRNA2018

    • 著者名/発表者名
      目黒牧子, 堀家慎一
    • 雑誌名

      遺伝子医学

      巻: 8 ページ: 93-97

  • [学会発表] The spliced lncRNA SNORD116HG is essential for the high order chromatin dynamics of the MAGEL2 and NDN locus over long distance.2018

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一,赤木佐千代,岡田源作,Dag H. Yasui, Janine M. LaSalle,目黒牧子
    • 学会等名
      JAJ RNA 2018
    • 国際学会
  • [学会発表] The spliced lncRNA SNORD116HG is essential for the high order chromatin dynamics of the MAGEL2 and NDN locus over long distance.2018

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一,赤木佐千代,岡田源作,Dag H. Yasui, Janine M. LaSalle,目黒牧子
    • 学会等名
      The American Society of Human Genetics annual meeting 2018
    • 国際学会
  • [学会発表] The spliced lncRNA SNORD116HG is essential for the high order chromatin dynamics of the MAGEL2 and NDN locus over long distance.2018

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一,赤木佐千代,岡田源作,Dag H. Yasui, Janine M. LaSalle,目黒牧子
    • 学会等名
      日本遺伝学会第90回大会
  • [学会発表] プラダーウィリ症候群の発症機序におけるSNORD116HGの役割2018

    • 著者名/発表者名
      堀家慎一,赤木佐千代,岡田源作,Dag H. Yasui, Janine M. LaSalle,目黒牧子
    • 学会等名
      第41回日本神経科学大会
    • 招待講演
  • [学会発表] 核内足場クロマチン構造を介したncRNA, SNORD116HGの作動機序の解明2018

    • 著者名/発表者名
      目黒牧子,赤木佐千代,岡田源作,Janine M. LaSalle,堀家慎一
    • 学会等名
      第12回日本エピジェネティクス研究会

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公開日: 2019-12-27  

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