米国 DOE Joint Genome Institute(JGI)Genome Portalで公開されているAscomycota/Pezizomycotina(299ゲノム)、Basidiomycota/Agaricomycotina(176)を含む623の菌類ゲノムの解析を行い、リボソーム・ペプチド(RiP)前駆体候補遺伝子、ustYaホモログ遺伝子の予測を行った。また、RiP前駆体候補遺伝子の近傍(2万bp以内)の遺伝子のドメイン予測による機能解析やRiP前駆体遺伝子産物のシグナルペプチドを除くアミノ酸組成の解析も行った。 RiP前駆体候補遺伝子等の予測結果の概要のウェブサイトを構築した。
|