2019 年度研究成果報告書

既知フォールドの再配線による新規フォールド予測法の開発

研究課題

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研究課題/領域番号	16K07315
研究種目	基盤研究(C)
配分区分	基金
応募区分	一般
研究分野	生物物理学
研究機関	名古屋大学
研究代表者	千見寺浄慈名古屋大学, 工学研究科, 助教 (10420366)
研究期間 (年度)	2016-04-01 – 2020-03-31
キーワード	タンパク質
研究成果の概要	タンパク質のアミノ酸配列とその天然構造の関係を理解することは、遺伝暗号解読問題として興味深いばかりでなく、医学的な応用という観点でも重要である。本研究では新規フォールドを持つタンパク質に対しても立体構造予測が可能な手法の一つである既知構造の再配線という手法に着目した。再配線を行う際に最も重要なことは、物理的に許される再配線と許されないものを見分けることであるが、これまではこれを見分ける基準がなかった。本研究で、局所構造のルールのフラストレーションがこの基準になる事がわかった。この結果は立体構造予測ばかりでなく、合理的デザインにおける目標構造をする際にも役に立つ。
自由記述の分野	生物物理
研究成果の学術的意義や社会的意義	タンパク質の天然構造をそのアミノ酸配列のみから予測したり（立体構造予測）、逆に望みの立体構造を持つアミノ酸配列を予測すること（デザイン）は、遺伝暗号解読問題として興味深いばかりでなく、医学的な応用という観点でも重要である。立体構造予測とデザインの両方を行う際に、どのような構造がタンパク質の天然構造になりうるのかを把握しておくことは問題を解く上で本質的に重要である。本研究では立体構造予測の研究を通して、これまで知られていなかった天然構造の条件の一つを明らかにする事が出来た。