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2017 年度 実施状況報告書

葉断面からの再生をモデルとした種子植物の栄養繁殖の分子メカニズムの研究

研究課題

研究課題/領域番号 16K07408
研究機関京都産業大学

研究代表者

木村 成介  京都産業大学, 総合生命科学部, 教授 (40339122)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
キーワード栄養繁殖 / 植物 / 不定芽 / 再生
研究実績の概要

植物の繁殖様式の中でも、葉、茎、根のような栄養器官から次の世代の植物個体が生じることで繁殖する方法を栄養繁殖という。北米原産の半水生のアブラナ科植物R. aquaticaは、自然界において、水の流れなどでちぎれた葉の断面から新しい個体を再生することで栄養繁殖をしている。本研究は、この葉の断面からの栄養繁殖(再生)のメカニズムを遺伝子レベルで明らかにすることを目的としている。
これまでの研究で、再生のメカニズムを分子レベルで明らかにするために経時的なトランスクリプトーム解析をすすめてきた。当該年度については、別プロジェクトにおいて、R. aquaticaのゲノム解読をおこなったので、ドラフトゲノム配列を参照配列とした網羅的解析を実施した。
R. aquaticaの栄養繁殖は、葉片の先端部側の断面からは再生せず、基部側の断面からのみ再生するという特徴がある。そこで、基部側と先端部側で比較トランスクリプトーム解析をおこなったところ、基部側でのみ再生に関わる遺伝子群の発現が誘導されていることがわかった。また、切断後初期の段階ではオーキシン応答性の遺伝子の発現が顕著に上昇していた。オーキシンの内生量を測定したところ、R. aquaticaでは、葉の切断後に基部側でIAA-Aspなどの蓄積がみられた。シロイヌナズナでは同様の蓄積は観察されなかった。これらの結果から、R. aquaticaでは、葉の切断後に極性輸送で基部側にオーキシンが輸送されて蓄積することが再生のトリガーになっていると考えられた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

R. aquaticaのゲノム配列情報を整備することができたことから、より精密な発現解析ができるようになった。また、当初予定にはなかったオーキシンの定量解析をおこなうことで、オーキシンの極性輸送が再生に関与していることを明らかにすることができた。また、成熟葉の断面からは再生することがないシロイヌナズナとのトランスクリプトーム解析も行い、現在データの解析をすすめている。さらに、再生過程におけるDNAのメチル化の変動を解析するために、バイサルファイトシークエンスを実施している。
計画が予定より早く進行している点に加え、当初計画には含まれていなかった先の内容の研究に着手できているという点で、当初計画よりも進展していると考えている。

今後の研究の推進方策

これまでに実施した大規模なトランスクリプトーム解析により栄養繁殖に関わる遺伝子ネットワークが明らかになりつつある。今後は、同定された遺伝子の機能解析をすすめる。葉片からの再生の過程については、現在、経時的な全ゲノムバイサルファイトシークエンス解析を勧めている。今後、得られた結果の解析をすすめ、分化した組織からの植物体再生のプロセスにおけるDNAメチル化の変動について知見を得たい。

次年度使用額が生じた理由

年度末に名古屋大学との共同研究打ち合わせを予定していたが延期となったため、旅費が必要なくなった。次年度に打ち合わせを延期するため、その分を繰り越した。

  • 研究成果

    (12件)

すべて 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 3件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [国際共同研究] Warwick University(英国)

    • 国名
      英国
    • 外国機関名
      Warwick University
  • [雑誌論文] Comparative transcriptomics with self-organizing map reveals cryptic photosynthetic differences between two accessions of North American Lake cress2018

    • 著者名/発表者名
      Nakayama Hokuto、Sakamoto Tomoaki、Okegawa Yuki、Kaminoyama Kaori、Fujie Manabu、Ichihashi Yasunori、Kurata Tetsuya、Motohashi Ken、Al-Shehbaz Ihsan、Sinha Neelima、Kimura Seisuke
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 8 ページ: 1~15

    • DOI

      10.1038/s41598-018-21646-w

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Chemical hijacking of auxin signaling with an engineered auxin?TIR1 pair2018

    • 著者名/発表者名
      Uchida Naoyuki、Takahashi Koji、Iwasaki Rie、Yamada Ryotaro、Yoshimura Masahiko、Endo Takaho A、Kimura Seisuke、Zhang Hua、Nomoto Mika、Tada Yasuomi、Kinoshita Toshinori、Itami Kenichiro、Hagihara Shinya、Torii Keiko U
    • 雑誌名

      Nature Chemical Biology

      巻: 14 ページ: 299~305

    • DOI

      10.1038/nchembio.2555

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Increased Phosphorylation of Ser-Gln Sites on SUPPRESSOR OF GAMMA RESPONSE1 Strengthens the DNA Damage Response inArabidopsis thaliana2017

    • 著者名/発表者名
      Yoshiyama Kaoru Okamoto、Kaminoyama Kaori、Sakamoto Tomoaki、Kimura Seisuke
    • 雑誌名

      The Plant Cell

      巻: 29 ページ: 3255~3268

    • DOI

      10.1105/tpc.17.00267

    • 査読あり
  • [雑誌論文] How Do Plants and Phytohormones Accomplish Heterophylly, Leaf Phenotypic Plasticity, in Response to Environmental Cues2017

    • 著者名/発表者名
      Nakayama Hokuto、Sinha Neelima R.、Kimura Seisuke
    • 雑誌名

      Frontiers in Plant Science

      巻: 8 ページ: 1~7

    • DOI

      10.3389/fpls.2017.01717

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Asymmetries in leaf branch are associated with differential speeds along growth axes: A theoretical prediction2017

    • 著者名/発表者名
      Akiko Nakamasu, Nobuhiko J. Suematsu, Seisuke Kimura
    • 雑誌名

      Developmental Dynamics

      巻: 246 ページ: 981-991

    • DOI

      10.1002/DVDY.24587

    • 査読あり
  • [学会発表] Adaptation of plants to aquatic environments: Studies on vegetative propagation in semi-aquatic plant, Rorippa aquatica2018

    • 著者名/発表者名
      Seisuke Kimura
    • 学会等名
      第59回日本植物生理学会年会シンポジウム「Amazing Development -Revealing Unusual Developmental Phenomena in Plants 植物が見せるユニークな発生および成長様式を読み解く」
    • 招待講演
  • [学会発表] Rorippa aquaticaの栄養繁殖を正誤する遺伝子群の探索2018

    • 著者名/発表者名
      天野瑠美、中山北斗、桃井理沙、郡司玄、竹林裕美子、桶川友季、本橋健、 笠原博幸、Ali Ferjani、木村成介
    • 学会等名
      第59回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] Exploration of genes regulating vegetative propagation in Rorippa aquatica2017

    • 著者名/発表者名
      Rumi Amano, Hokuto Nakayama, Risa Momoi, Shizuka Gunji, Yumiko Takebayashi, Yuki Okegawa, Ken Motohashi, Hiroyuki Kasahara, Ali Ferjani, Seisuke Kimura
    • 学会等名
      Taiwan-Japan Plant Biology 2017
    • 国際学会
  • [学会発表] Rorippa aquaticaの栄養繁殖を制御する遺伝子群の探索2017

    • 著者名/発表者名
      天野瑠美、中山北斗、桃井理沙、郡司玄、竹林裕美子、 笠原博幸、Ali Ferjani、木村成介
    • 学会等名
      日本植物学会第81回大会
  • [学会発表] Rorippa aquaticaにおける栄養繁殖とオーキシンの関係の解析2017

    • 著者名/発表者名
      桃井理沙、天野瑠美、中山北斗、小島美紀子、竹林裕美子、榊原均、木村成介
    • 学会等名
      日本植物学会第81回大会
  • [学会発表] Rorippa aquaticaの栄養繁殖を制御する遺伝子群の探索2017

    • 著者名/発表者名
      天野瑠美、中山北斗、桃井理沙、郡司玄、竹林裕美子、 笠原博幸、Ali Ferjani、木村成介
    • 学会等名
      日本植物形態学会第29回大会

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公開日: 2018-12-17   更新日: 2022-02-22  

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