研究課題/領域番号 |
16K07479
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研究機関 | 三重大学 |
研究代表者 |
北村 淳一 三重大学, 生物資源学研究科, リサーチフェロー (00432360)
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研究分担者 |
小北 智之 福井県立大学, 海洋生物資源学部, 准教授 (60372835)
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研究期間 (年度) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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キーワード | 適応進化 / 繁殖形質 / 生態ゲノミクス / 繁殖戦略 / トランスクリプトーム |
研究実績の概要 |
祖先系統や近縁系統には認められない新奇形質の獲得は,当該系統のさまざまなレベルでの多様性創出に大きな貢献をしたと予想される.本研究は,淡水性二枚貝類への繁殖寄生と関連して,産卵管という新奇形質を獲得したタナゴ亜科魚類をモデル系として,新奇形質の適応的多様化機構を明らかにしようとするというものである.平成28年度は,亜種間に顕著な産卵管長の変異が認められるタビラ類をモデル系とした研究を展開した.大型貝類に産卵し,長い産卵管長を保有する亜種(キタノアカヒレタビラ)と小型貝類に産卵し,短い産卵管長を保有する亜種(アカヒレタビラ)を対象とし,産卵管で発現する遺伝子群のカタログ化を行った.両亜種から伸長段階が異なる産卵管を採取し,抽出・精製したRNAを用いて,cDNAライブラリーを作成し,Illumina社の次世代シーケンサーによるRNA-seqを行った.シーケンスデータをアセンブルし,得られたコンティグを元に,発現遺伝子群をリストアップした.今後,このコンティグをリファレンス配列として,両亜種間で発現量変異を示す遺伝子群を検出する予定である.
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
産卵官長変異の遺伝基盤を探索するためのトランスクリプトーム解析を行ったが,ウェットの実験自体は既に終了している.今後得られたデータを用いて,詳細なバイオインフォマティックス解析を行う必要があるが,現段階では予定通りで進捗していると考えている.
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今後の研究の推進方策 |
平成28年度に得られたデータを用いて,詳細なバイオインフォマティックス解析を行い,産卵官長が異なる亜種間で発現量変異を示す遺伝子群を検出していく予定である.
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次年度使用額が生じた理由 |
昨年度、野外でのサンプル採集が効率的に進んだことで、調査に関係する旅費や消耗品費が次年度に持ち越すことができたため。
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次年度使用額の使用計画 |
次年度、行動解析用の高性能パソコンを購入する計画のために予算を使用したい。
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