研究課題
イチゴの染色体マーカーの開発、ゲノム組成の解明を目的として、野生二倍体イチゴFragaria vescaのBACクローンを用いて、BAC-FISH法により、染色体を識別するための染色体マーカーを開発し、八倍体栽培イチゴのゲノム組成を明らかにしてきた。最終年度に行った研究は以下の通りである。１）2種の二倍体イチゴFragaria vescaとF. iinumaeを用いて、BAC-FISH法により新規の染色体マーカーの開発を目指した。多くの植物ゲノム中の主要な反復配列である45S rDNAはイチゴでは、染色体上でのその位置や大きさは明らかになっていなかった。そこで、本研究では45S rDNAとともに新たに11のBACクローンを染色体上に位置付けることを試みた。その結果、F. iinumaeにおいて45S rDNAの４つの大きなシグナルと２つの小さなシグナルが観察された。また、新たに３つのBACクローンを染色体上に位置付けることができた。２）BACクローンを八倍体栽培イチゴFragaria Xananassaの染色体上に位置付けることにより、八倍体ゲノムにおける染色体変異を明らかにすることができる。起源となった二倍体イチゴの染色体がそのまま倍化したのであれば、BACシグナルは８個観察されるはずである。今回二倍体イチゴF. vescaの第１染色体から第７染色体までのそれぞれに位置することがわかっているBACクローン７つを用いて八倍体栽培イチゴにFISHを行ったところ、６～14個のシグナルが観察された。このことから、八倍体栽培イチゴが形成される過程で、染色体構造の変化が生じたことが示唆される。３）これらの実験を実施する上で、前中期染色体の集積が必須である。このため、大量に根端細胞を採取することのできるメロン種子を用いて、前中期染色体集積のための実験を行い、その結果をイチゴに適用した。
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すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 3件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (1件) (うち国際学会 1件)
Chromosome Science
巻: 21 ページ: 印刷中
Molecular Cytogenetics
巻: 11 ページ: 32
https://doi.org/10.1186/s13039-018-0380-6
