| 研究課題/領域番号 |
16K08780
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| 研究機関 | 宮崎大学 |
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研究代表者 |
井口 純 宮崎大学, 農学部, 准教授 (00437948)
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| 研究期間 (年度) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| キーワード | 大腸菌 / O抗原 |
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| 研究実績の概要 |
抗原変化の遺伝学的な組換えメカニズムの解明を目指して、ゲノム比較解析を行った。これまでの参考株を用いた解析で多種類のO群が密集することが確認されているST（Sequence type）10に注目し、ST10に属する異なるO群の20株についてドラフトゲノムをMiseqシステムにより取得した。一部にO抗原合成遺伝子領域およびその近傍にギャップが存在したため、ロングPCRとショットガンライブラリーによる配列決定を行い、ギャップを埋める作業を行った。現在、O抗原合成遺伝子領域およびその近傍の詳細な比較解析を実施している。さらに、他研究で使用した腸管毒素原性大腸菌のドラフトゲノム（約360株）の情報も参考にしながら、ST10またはその近縁に属する菌株の情報を加えた領域比較およびbackbone領域を用いた詳細な進化系統解析を実施している。
また、「O抗原糖鎖の機能性検証」の準備研究として、健康なヒトから分離される大腸菌のO群分布を調査した。菌株は大阪市立環境科学研究所の協力により積極的疫学調査などで分離された健康人由来大腸菌約400株（1個人から最大3株）を収集し、我々がこれまでの開発したほぼ全てのO群を判定出来るPCR法（E. coli O-genotyping PCR）を用いて判定したところ、Og1、Og21、OgGp10（O13/O129/O135）、OgGp15（O89/O101/O162）などが主要O群であることが明らかとなった。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
研究実施計画に掲げた「抗原変化の遺伝学的な組換えメカニズムの解明」のゲノム解析と、「O抗原糖鎖の機能性検証」の準備研究である健康なヒトから分離される大腸菌のO群調査が概ね実施できた為。
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| 今後の研究の推進方策 |
抗原変化の遺伝学的な組換えメカニズムの解明では、ゲノム情報をもとにO抗原合成遺伝子領域組換えへの関与が予想される遺伝子のスクリーニングを実施し、その機能性や作用などの解明に取り組む。さらに、O抗原糖鎖の機能性の検証では、病原性大腸菌の主要なO群（O157、O26、O169など）とヒト常在性大腸菌の主要なO群（O1、O21、O13、O162）についてLPS-O抗原の精製を行い、免疫細胞などを用いた機能性評価に取り組む。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
ほぼ計画通りに使用した。
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| 次年度使用額の使用計画 |
本研究で使用する消耗品（試薬類など）に充てる。
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