| 研究課題/領域番号 |
16K08984
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| 研究機関 | 国立研究開発法人理化学研究所 |
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研究代表者 |
山中 康成 国立研究開発法人理化学研究所, 予防医療・診断技術開発プログラム, マネージャー (90402859)
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| 研究期間 (年度) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| キーワード | アンチセンスRNA |
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| 研究実績の概要 |
エピゲノム制御に関わる疾患アンチセンスRNAを同定し、そのRNA定量検査法を開発するため、クロマチン関連蛋白質HMGB2と結合するアンチセンスRNAの同定を試みた。
予備実験としてすでに行っていたCross-linking immunoprecipitation(CLIP)ではRNAの収量が極めて少ないことが明らかになり、今後代替策としてRNA immunoprecipitation(RIP)を行う方針とし、現在その沈降条件を検討中である。一方で、脳脊髄液(CSF)ではRNAが安定して存在することに着目し、疾患関連CSFの収集に向けて医療機関と協議を開始した。
今後は、RIPの条件検討を進め、HMGB2と結合するアンチセンスRNAを同定していく。また、臨床検体を確保するため、医療機関との協議をさらに進める。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
予備実験としてすでに行っていたCross-linking immunoprecipitation(CLIP)ではRNAの収量が極めて少ないことが明らかになり、今後代替策としてRNA immunoprecipitation(RIP)を行う方針とし、現在その沈降条件を検討中である。一方で、脳脊髄液(CSF)ではRNAが安定して存在することに着目し、疾患関連CSFの収集に向けて医療機関と協議を開始した。
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| 今後の研究の推進方策 |
RIPの条件検討を進め、HMGB2と結合するアンチセンスRNAを同定していく。また、臨床検体を確保するため、医療機関との協議をさらに進める。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
CLIPを用いた解析でRNAの収量が極めて少ないことが明らかになり、その代替策の検討に時間を要したため。
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| 次年度使用額の使用計画 |
今後RIPを用いた解析方法を確立し、臨床検体の収集についてさらに協議を進める。
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