• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2018 年度 実績報告書

網羅的エクソーム解析を利用した稀少肺疾患の責任遺伝子同定に向けて

研究課題

研究課題/領域番号 16K09557
研究機関東京医科歯科大学

研究代表者

瀬戸口 靖弘  東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 特任教授 (90206649)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
キーワードPPFE / 特発性間質性肺炎 / エクソーム解析 / ゲノム / 遺伝子 / テロメア / サーファクタント / 細胞接着因子
研究実績の概要

特発性間質性肺炎(IIP)136名のうち家族性間質性肺炎(FIP)47名、孤発性特発性間質性肺炎(SIP)89名について臨床情報と末梢血DNAについて匿名化データベースを作成し、これまで明らかになっているサーフファクタント関連遺伝子(SP-C,ABC-A3)についてrare variantの有無をまずサンガー法で確認を行った。また、これら遺伝子のrare variantが同定されなかったFIP、診断時年齢が45歳以下のIIP、IIPの中でも希少間質性肺炎とされるPPFE (pleuraparenchymal fibroelastosis) については、次世代シークエンサーを用いた網羅的エクソーム解析を行った。以上の研究の結果で2018年度に明らかになった点は、以下の通りである。1) 家族性間質性肺炎では、57%(47名中27名)にrare variantを認め、その中で85%は、SP-A1,SP-A2, SP-C, ABC-A3遺伝子のサーファクタント関連遺伝子であった。一例は、テロメア関連遺伝子TERTのrare variantを有していた。2)PPFEについては、9症例を調べることができた。7症例は、rare variant を有し、残り2症例は、著しい低頻度のncRNAの変異を有していた。Rare variantを有した遺伝子は、細胞接着に関わる2つの遺伝子とテロメア関連のRTEL1遺伝子であった。3)Sporadic特発性間質性肺炎で診断時年齢45歳以下の若年発症症例では、RTEL1遺伝子のrare variantであった。以上の結果から家族性間質性肺炎のほとんどは、サーファクタント関連遺伝子変異が、またPPFEにおいては、テロメア関連遺伝子変異或いはその遺伝子の転写後制御に関わるRNA変異、細胞接着関連遺伝子が病態形成に関わっている可能性が示唆された。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2018

すべて 学会発表 (4件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件) 図書 (3件)

  • [学会発表] 成人発症特発性間質性肺炎における発症責任遺伝子同定と臨床的、画像的、呼吸生理学的特徴2018

    • 著者名/発表者名
      瀬戸口靖弘
    • 学会等名
      第58回日本呼吸器学会学術講演会
  • [学会発表] 特発性間質性肺炎の成因に関する責任遺伝子同定から遺伝性間質性肺炎へ2018

    • 著者名/発表者名
      瀬戸口靖弘
    • 学会等名
      第58回日本呼吸器学会学術講演会 教育講演
    • 招待講演
  • [学会発表] Clinical, Pulmonary Physiological and Genetic Characteristics in Adult-Onset Familial Interstitial Pneumonia (FIP)2018

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Setoguchi
    • 学会等名
      American Thoracic Society International Conference 2018
    • 国際学会
  • [学会発表] Fatal cases of pulmonary alveolar proteinosis: a nationwide surveillance in Japan2018

    • 著者名/発表者名
      Y Inoue, E Yamaguchi, Y Setoguchi
    • 学会等名
      European Respiratory Society International Conference 2018
    • 国際学会
  • [図書] 画像から学ぶびまん性肺疾患(家族性間質性肺炎)2018

    • 著者名/発表者名
      瀬戸口靖弘
    • 総ページ数
      310
    • 出版者
      克誠堂
    • ISBN
      978-4-7719-0498-9
  • [図書] 間質性肺炎・肺線維症と類縁疾患2018

    • 著者名/発表者名
      瀬戸口靖弘 片柳真司
    • 総ページ数
      375
    • 出版者
      中山書店
    • ISBN
      978-4-521-74528-2
  • [図書] 多因子遺伝性疾患研究と遺伝カウンセリング2018

    • 著者名/発表者名
      瀬戸口靖弘
    • 総ページ数
      292
    • 出版者
      メディカルドゥ
    • ISBN
      978-4-944157-26-6

URL: 

公開日: 2019-12-27  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi