次世代シーケンサーを用いた新規パーキンソン病原因遺伝子の単離

2017 年度 実施状況報告書

• 研究課題/領域番号: 16K09678
• 研究機関: 順天堂大学
• 研究代表者: 西岡 健弥 順天堂大学, 医学部, 准教授 (40348933)
• 研究期間 (年度): 2016-04-01 – 2019-03-31
• キーワード: 遺伝子 / パーキンソン病 / 次世代シーケンサー

研究実績の概要

常染色体優性遺伝形式を呈する家族性パーキンソン病にて同一家系内に濃厚な集積を認める一家系に注目した。既知の遺伝子であるSNCA, LRRK2, PINK1, DJ1が無いことを確認した上で、次世代シーケンサーを用いた解析を施行している。この家系は同一家系内に４名おり、３名についてDNAを回収した。次世代シーケンサーによる解析後、CLC Genomic workbenchを用いて、11万程度のSNPsやindelを同定し、この中からnon-synonymous exonic variants、frequency < 0.01、heterozygous variantsの条件で絞り込みをかけた。これにより病的遺伝子変異が疑われる46遺伝子を同定した。その後46の変異についてすべてSanger sequnecingを施行し、実際に存在することを確認した。現在、当院のDNA bankに保管されている常染色体優性遺伝形式を呈するproband 50名の遺伝子に対して、ion PGM(Thermo Fisher Scientific)によるhigh through put解析を行いスクリーニグを施行した。現在はそのデータの解析中である。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

上記の内容で研究を進めている。現在のところ比較的順調に推移している。

今後の研究の推進方策

原因遺伝子を同定した後は、細胞培養実験や動物モデルにて解析を行い、病的なものかどうかの確認、細胞内での発現動向、コードする蛋白質の機能解析を行っていく。

研究成果

• [国際共同研究] University of British Columbia(Canada)
  • 国名: カナダ
  • 外国機関名: University of British Columbia
• [雑誌論文] COQ2 variants in Parkinson's disease and multiple system atrophy. (2018)
  • 著者名/発表者名: Mikasa M, Kanai K, Li Y, Yoshino H, Mogushi K, Hayashida A, Ikeda A, Kawajiri S, Okuma Y, Kashihara K, Sato T, Kondo H, Funayama M, Nishioka K, Hattori N.
  • 雑誌名: Journal of Neural Transmission 巻: 125 ページ: 937-958
  • DOI: 10.1007/s00702-018-1885-1
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic analysis of TMEM230 in Japanese patients with familial Parkinson's disease. (2018)
  • 著者名/発表者名: Conedera SA, Li Y, Funayama M, Yoshino H, Nishioka K, Hattori N.
  • 雑誌名: Parkinsonism and related disorders 巻: 48 ページ: 107-108
  • DOI: 10.1016/j.parkreldis.2017.12.020.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association between abnormal nocturnal blood pressure profile and dementia in Parkinson's disease. (2018)
  • 著者名/発表者名: Tanaka R, Shimo Y, Yamashiro K, Ogawa T, Nishioka K, Oyama G, Umemura A, Hattori N.
  • 雑誌名: Parkinsonism and Related Disorders 巻: 46 ページ: 24-29
  • DOI: 10.1016/j.parkreldis.2017.10.014.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Marked reduction in striatal dopamine transporter uptake during the early stage of motor symptoms in patients with the MAPT N279K mutation (2018)
  • 著者名/発表者名: Takeshige H, Nakayama S, Nishioka K, Li Y, Motoi Y, Hattori N.
  • 雑誌名: Internal Medicine 巻: in press ページ: in press
  • DOI: in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNAJC12 and dopa-responsive nonprogressive parkinsonism. (2017)
  • 著者名/発表者名: Straniero L, Guella I, Cilia R, Parkkinen L, Rimoldi V, Young A, Asselta R, Sold, G, Sossi V, Stoessl AJ, Priori A, Nishioka K, Hattori N, Follett J, Rajput A, Blau N, Pezzoli G, Farrer MJ, Goldwurm S, Rajput AH, Duga S.
  • 雑誌名: Annals of Neurology 巻: 82 ページ: 640-646
  • DOI: 10.1002/ana.25048.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Homozygous alpha-synuclein p.A53V in familial Parkinson's disease. (2017)
  • 著者名/発表者名: Yoshino H, Hirano M, Stoessl AJ, Imamichi Y, Ikeda A, Li Y, Funayama M, Yamada I, Nakamura Y, Sossi V, Farrer MJ, Nishioka K, Hattori N.
  • 雑誌名: Neurobiology of Aging 巻: 57 ページ: :248.e7-248.e12
  • DOI: 10.1016/j.neurobiolaging.2017.05.022.
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel mutation of CHCHD2 p.R8H in a sporadic case of Parkinson's disease. (2017)
  • 著者名/発表者名: Ikeda A, Matsushima T, Daida K, Nakajima S, Conedera S, Li Y, Yoshino H, Oyama G, Funayama M, Nishioka K, Hattori N.
  • 雑誌名: Parkinsonism and Related Diosorders 巻: 34 ページ: 66-68
  • DOI: 10.1016/j.parkreldis.2016.10.018
  • 査読あり
• [雑誌論文] CSF1R Mutation p.G589R and the Distribution Pattern of Brain Calcification. (2017)
  • 著者名/発表者名: Daida K, Nishioka K, Li Y, Nakajima S, Tanaka R, Hattori N.
  • 雑誌名: Internal Medicine 巻: 15 ページ: 2507-2512
  • DOI: 10.2169/internalmedicine.8462-16.
  • 査読あり
• [学会発表] HOMOZYGOUS ALPHA-SYNUCLEIN A53V IN FAMILIAL PARKINSON'S DISEASE (2017)
  • 著者名/発表者名: Kenya Nishioka, Makito Hirano, A. Jon Stoessl, Hiroyo Yoshino, Yoko Imamichi, Aya Ikeda, Yuanzhe Li, Manabu Funayama, Ikuko Yamada, Yusaku Nakamura, Vesna Sossi, Matthew J. Farrer, Nobutaka Hattori.
  • 学会等名: The XXIII World Congress of Neurology
  • 国際学会
• [学会発表] The correlation of CHCHD2 mutations and alpha-synculein in the brain pathology and fly models (2017)
  • 著者名/発表者名: Kenya Nishioka, Aya Ikeda, Masashi Takanashi, Hiroyo Yoshino, Yuanzhe Li, Manabu Funayama, Yuzuru Imai, Nobutaka Hattori.
  • 学会等名: Genetic Epidemiology of Parkinson’s disease
  • 国際学会
• [学会発表] Missense mutations and multiplications of alpha-synuclein in familial Parkinson’s disease; genotype-phenotype correlation (2017)
  • 著者名/発表者名: Kenya Nishioka, Hiroyo Yoshino, Yuanzhe Li, Manabu Funayama, Tara Candido, A. Jon Stoessl, Matthew J Farrer, Nobutaka Hattori.
  • 学会等名: The American Society of Human Genetics
  • 国際学会
• [図書] Parkinson病のゲノム医療 (2017)
  • 著者名/発表者名: 西岡健弥 李元哲 吉野浩代 服部信孝
  • 総ページ数: ｀６
  • 出版者: 科学評論社
  • ISBN: 0386-9709
• [備考] 順天堂大学 研究者情報ベース
  • URL: https://www.juntendo.ac.jp/graduate/kenkyudb/maintenance.html?MID=1762