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本研究の目的は、「細菌性肺炎・中耳炎の主要起炎菌である肺炎球菌に対するアンチセンス療法（ペプチド核酸：Peptide Nucleic Acid 【PNA】）の開発」に向けた基礎研究である。
実際には①肺炎球菌のPNAに対する感受性測定、②PNAが常在菌叢には影響を及ぼさな
いこと、③すべての肺炎球菌莢膜型をカバーすること、④バイオフィルム内の肺炎球菌にも効果があること、⑤PNA耐性メカニズムを解明すること、などを3年かけて研究した。
PNA基礎配列や膜貫通性ペプチドの組み合わせなどに改良を加え、合計26種類のPNAを設計し①肺炎球菌のPNAに対する感受性測定を行った。その結果、抗菌作用の高いPNA（RFR-acpP-PNA2S）を同定できた（MIC 5μmol/L）。当該PNAは実験標準株4株に対して同等の抗菌作用を示した。
続いてRFR-acpP-PNA2Sを用いた④のバイオフィルム実験を行った。ヒト気道上皮細胞(H292 cell)をベースとしたバイオフィルム作成後に、PNAを曝露させその抗バイオフィルム作用を測定した。しかし、RFR-acpP-PNA2S濃度を40μmol/Lまで上げても抗バイオフィルム作用を認めなかった。
上記に並行して⑤PNA耐性メカニズムを解明するために、PNA存在下で継代培養し耐性を誘導した株を分離した（MIC 20μmol/L）。耐性株と親株とのゲノム比較で責任遺伝子を推定し、ノックアウト株を作製する予定であったが、シークエンス結果には有意な変異を認めず、当該耐性株は遺伝子発現量の差異による耐性化と判断した。
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