研究課題
次世代シークエンサー(NGS)を用いて大腸癌リンパ節転移に関与する遺伝子を突き止め、既存の診断法、治療法よりも精度の高い大腸癌診断マーカー、リンパ節転移予測マーカーを開発し、臨床応用につなげることが本研究の目的である。遺伝子の転写開始点を網羅的に解析するCAGE法(cap analysis of gene expression法)が開発され、ヒトの18万を超える転写開始点と、それに由来する転写産物の発現量の網羅的解析が行われている(FANTOM5プロジェクト)。我々はこのCAGE法を用いて、転移を伴う大腸がん症例の癌組織における網羅的発現解析を行った。これをもとに本研究では大腸癌のリンパ節転移の有無によるmRNA 発現の有意な差異を特定した。さらにRNA 発現が転移特異的に有意に上昇する遺伝子群また発現低下する遺伝子群を選抜・探索した。その結果、リンパ節転移マーカーの候補遺伝子を特定し、有効性の確認を進めつつある。本研究において特定した遺伝子をリンパ節転移のマーカーとして使用し実用化することにより、大腸癌の治療法の選択や、転移の予測・早期検出が可能になる。また新たな診断法、分類、指標開発、創薬への進展が期待できる。
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