臨床検体を用いたプロテオミクスによる転移性骨腫瘍の分子背景の解明と新規治療法開発

2018 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 16K10880
• 研究機関: 国立研究開発法人国立がん研究センター
• 研究代表者: 近藤 格 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 分野長 (30284061)
• 研究分担者: 穴澤 卯圭 東京歯科大学, 歯学部, 教授 (20245525) ; 菊田 一貴 東京歯科大学, 歯学部, 非常勤講師 (30383798) ; 多田 裕司 千葉大学, 大学院医学研究院, 特任教授 (50344990) ; 川井 章 国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 科長 (90252965)
• 研究期間 (年度): 2016-04-01 – 2019-03-31
• キーワード: 転移性骨腫瘍 / プロテオーム解析 / バイオマーカー

研究実績の概要

転移性骨腫瘍の病態の理解に基づいてバイオマーカーを開発するためにプロテオーム解析を行った。多様な分子背景をもつ腫瘍が骨に転移した結果できる転移性骨腫瘍は、多彩な分子背景を有している。転移しやすい腫瘍細胞が骨に生着する過程ではさまざまな選択バイアスがかかり、さらに、骨で増殖する際にも分子背景は修飾を受けることになる。オミクス解析によって、原発腫瘍が異なる転移性骨腫瘍において、どのような遺伝子が発現しているかを網羅的に調べることで、病態の理解を進めることができる。これまでの研究経過としては、主に蛍光二次元電気泳動法（2D-DIGE法）を用いてプロテオーム解析を行い、転移性骨腫瘍で高い発現レベルを示すタンパク質を同定し、バイオマーカーとしての有用性を調べるために、血液中での存在を確認した。2018年度は、異なる原発腫瘍組織に由来する転移性骨腫瘍において、どのようなタンパク質が発現しているかについて比較解析を行った。使用したサンプルは、肺がん、乳がん、骨髄腫、腎がん、悪性リンパ腫の転移性骨腫瘍組織である。質量分析装置を用い2800種類のタンパク質を定量的に調べ、それぞれの腫瘍組織のプロテオーム解析を行った。主成分分析による解析では、プロテオーム像は原発腫瘍にしたがってそれぞれに異なることがわかった。

研究成果

• [国際共同研究] HudsonAlpha Institute for Biotechnology(米国)
  • 国名: 米国
  • 外国機関名: HudsonAlpha Institute for Biotechnology
• [雑誌論文] Cancer biomarker development and two-dimensional difference gel electrophoresis (2D-DIGE) (2019)
  • 著者名/発表者名: Kondo T
  • 雑誌名: Biochim Biophys Acta Proteins Proteom 巻: 1867 ページ: 2
  • DOI: 10.1016/j.bbapap.2018.07.002
  • 査読あり
• [雑誌論文] Decorin as a prognostic biomarker in patients with malignant peripheral nerve sheath tumors. (2019)
  • 著者名/発表者名: Jia X, Chen C, Chen L, Yu C, Kondo T
  • 雑誌名: Oncol Lett. 巻: 17(3) ページ: 3517-3522
  • DOI: 10.3892/ol.2019.9959
  • 査読あり
• [雑誌論文] Calreticulin as A Novel Potential Metastasis-Associated Protein in Myxoid Liposarcoma, as Revealed by Two-Dimensional Difference Gel Electrophoresis. Proteomes. (2019)
  • 著者名/発表者名: Tajima T, Kito F, Yoshida A, Kawai A, Kondo T.
  • 雑誌名: Proteomes 巻: 7(2) ページ: E13
  • DOI: 10.3390/proteomes7020013
  • 査読あり
• [雑誌論文] A serum microRNA classifier for the diagnosis of sarcomas of various histological subtypes. (2019)
  • 著者名/発表者名: Asano N, Matsuzaki J, Ichikawa M, Kawauchi J, Takizawa S, Aoki Y, Sakamoto H, Yoshida A, Kobayashi E, Tanzawa Y, Nakayama R, Morioka H, Matsumoto M, Nakamura M, Kondo T, Kato K, Tsuchiya N, Kawai A, Ochiya T.
  • 雑誌名: Nat Commun 巻: 10(1) ページ: 1299
  • DOI: 10.1038/s41467-019-09143-8
  • 査読あり
• [雑誌論文] Screening of a growth inhibitor library of sarcoma cell lines to identify potent anti-cancer drugs. (2019)
  • 著者名/発表者名: Qiao Z, Kondo T
  • 雑誌名: J Electrophoresis 巻: 63 ページ: 1-7
  • 査読あり
• [雑誌論文] HDAC2 regulates site-specific acetylation of MDM2 and its ubiquitination signaling in tumor suppression. (2019)
  • 著者名/発表者名: Patel N, Wang J, Shiozawa K, Jones KB, Zhang Y, Prokop JW, Davenport GG, Nihira NT, Hao Z, Wong D, Brandsmeier L, Meadows SK, Sampaio AV, Werff RV, Endo M, Capecchi MR, McNagny KM, Mak TW, Nielsen TO, Underhill TM, Myers RM, Kondo T, Su L.
  • 雑誌名: iSci 巻: Feb 15 ページ: --
  • DOI: 10.1016/j.isci.2019.02.0082
  • 査読あり
• [雑誌論文] Current Status of Proteomics in Ewing's Sarcoma (2018)
  • 著者名/発表者名: Kondo T
  • 雑誌名: Proteomics Clin Appl 巻: e1700130 ページ: e1700130
  • DOI: 10.1002/prca.201700130
  • 査読あり
• [雑誌論文] Meta-analysis of global gene-expression profiles identify molecular signatures for histological subtypes of sarcomas (2018)
  • 著者名/発表者名: Qiao Z, Parlayan C, Saito S, Kondo T
  • 雑誌名: J Electrophoresis 巻: 62 ページ: 21-29
  • DOI: 10.2198/jelectroph. 62.21
  • 査読あり
• [雑誌論文] Pazopanib-induced changes in protein expression signatures of extracellular vesicles in synovial sarcoma. (2018)
  • 著者名/発表者名: Shiozawa K, Yoshioka Y, Qiao Z, Shuting J, Ochiya T, Kondo T
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 巻: 506(3) ページ: 723-730
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2018.10.012
• [学会発表] What we can learn from biomarker study; prior probability, patient-derived cancer model, and proteogenomics (2019)
  • 著者名/発表者名: Tadashi Kondo
  • 学会等名: 19th KHUPO Annual International Proteomics Conference
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] プロテオゲノミクスソフトウェアMutated Nucleotide and Amino-acid sequence Generator(MuNAGe) の開発 (2018)
  • 著者名/発表者名: 服部恵美・塩澤久美子・近藤格
  • 学会等名: 第41回日本分子生物学会年会
• [学会発表] 希少がん・肉腫の研究―プロテオーム解析によるバイオマーカーの開発から患者由来がんモデルの樹立までー (2018)
  • 著者名/発表者名: 近藤格
  • 学会等名: 第33回日本整形外科学会基礎学術集会
  • 招待講演
• [学会発表] Novel proteogenomics software to generate sample-specific database: MuNAGe, Mutated Nucleotides and Amino-acid sequence Generator (2018)
  • 著者名/発表者名: 近藤格、服部恵美
  • 学会等名: International Proteogenome Workshop
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Rare cancer research (2018)
  • 著者名/発表者名: Tadashi Kondo
  • 学会等名: The 2018 Upper Extremity Tumor Treatment and Hand Surgery Advanced Technique Workshop
  • 招待講演
• [学会発表] Novel software for Protegenomics; Mutated Nucleotides and Amino-Acids Generator (MuNAGe). (2018)
  • 著者名/発表者名: Emi Hattori, Tadashi Kondo
  • 学会等名: The Connective Tissue Oncology Society 2018 Annual Meeting.
  • 国際学会
• [学会発表] Mutated Nucleotide and Amino-acid sequence Generator (MuNAGe): novel proteogenomics software to generate sample-specific database. (2018)
  • 著者名/発表者名: Emi Hattori, Kumiko Shiozawa, Tadashi Kondo.
  • 学会等名: 17th Human Proteome Organisation World Congress
  • 国際学会
• [学会発表] Sarcoma research toward novel clinical application. (2018)
  • 著者名/発表者名: Tadashi Kondo.
  • 学会等名: The 12th NCC International Symposium
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Rare cancer research. (2018)
  • 著者名/発表者名: Tadashi Kondo
  • 学会等名: The 2018 Upper Extremity Tumor Treatment and Hand Surgery Advanced Technique Workshop.
  • 国際学会 / 招待講演