研究実績の概要 |
本研究では,妊娠高血圧症候群の胎盤を用いてRNA-Seqによるトランスクリプトーム解析を行い,転写産物の発現定量のみならず,これまでの手法では明らかとなっていない新規転写産物を網羅的に検討することを目的としている。これまで、重症妊娠高血圧腎症 (PE) 群:8例,対照妊婦として合併症のない正常血圧妊婦 (NL) 群:8例および子宮内胎児発育不全 FGR) 群:8例の計24例の胎盤を帝王切開時にサンプリングした。 RNAを抽出し,ライブラリを作製後にシーケンスを行い,得られたリードをゲノムにマッピングし解析を行った。 はじめに,Quality check後に解析した57,773遺伝子に対して群間比較を行ったところ,NL群とPE群において,Fold Change > 2,P-value < 0.05かつFDR p-value <0.25を満たすのは168遺伝子であった。一方,NL群とFGR群において,同条件を満たすのは1,314遺伝子であった。このうち,PE群とFGR群で共通していたのが,37遺伝子であり,31遺伝子が増加し,6遺伝子が低下していた。PE群でのみ差を認めたのが131遺伝子であり,102遺伝子が増加し,29遺伝子が低下していた。FGR群でのみ差を認めたのが1,277遺伝子であり,900遺伝子が増加し,377遺伝子が低下していた。 次に,選択的スプライシングバリアントについてNL群とPE群の検索を行ったところ、skipped exon, alternative 5'splice site, alternative 3'splice site, mutually exclusive exonsでは有意な差を見いだせなかったが、retained intronで2.22%の遺伝子で異なるsplicing eventsが確認された。今後、このイントロン保持による生物学的な効果と疾患の関連について検討する予定である。
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