| 研究課題/領域番号 |
16K11132
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| 研究機関 | 新潟大学 |
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研究代表者 |
加嶋 克則 新潟大学, 医歯学総合病院, 特任教授 (50345500)
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| 研究分担者 |
吉原 弘祐 新潟大学, 医歯学系, 助教 (40547535)
榎本 隆之 新潟大学, 医歯学系, 教授 (90283754)
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| 研究期間 (年度) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| キーワード | 子宮内膜症 |
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| 研究実績の概要 |
分子生物学的特徴を明らかにするために、子宮内膜症関連卵巣類内膜癌症例の正常子宮内膜、内膜症、異型内膜症、内膜症―癌移行部、卵巣癌細胞をレーザーマイクロダイセクションでサンプリング後、DNA及びRNAを抽出し、全エクソンシークエンス・RNAシークエンスを行い、ゲノム及びトランスクリプトームデータを取得している。遺伝子発現データを用いて、Hierarchical clustering、NMF consensus clusteringを行い、正常子宮内膜、子宮内膜症、卵巣類内膜癌における発現パターンの類似性・相違性を順次、検証している。また、変異解析、コピー数解析の結果を離散数に変換した変異プロファイル／コピー数プロファイルを作成し、上記のClustering手法に当てはめ、各データにおける類似性、相違性を遺伝子変異レベル、コピー数変化レベルで順次、検証している。さらに、遺伝子発現データ、コピー数データ、遺伝子変異データをまとめてPARADIGMにあてはめることにより、正常内膜・子宮内膜症・卵巣類内膜癌で有意に活性化／不活性化しているパスウェイ、さらに、PARADIGMにより出力された各パスウェイのactivitiesを指標として、正常内膜・子宮内膜症・卵巣類内膜癌に共通して活性化／不活性化しているパスウェイを順次、抽出している。同一症例内の正常子宮内膜、子宮内膜症、卵巣類内膜癌の網羅的遺伝子変異プロファイルを用いて、腫瘍の進化プロセスを明らかにする事により、子宮内膜症から卵巣類内膜癌への進展メカニズムの解明を試みている。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
4: 遅れている
理由
同一症例内の正常子宮内膜、子宮内膜症、卵巣類内膜癌の全エクソンシークエンスデータより遺伝子変異及びコピー数変化プロファイルを作成し、比較検討することによって、各組織での分子生物学的共通性／相違性の同定を試みている。また、同一症例内の正常子宮内膜、子宮内膜症、卵巣類内膜癌のRNAシークエンスデータより網羅的遺伝子発現プロファイルを作成し、クラスター解析法を用いて正常子宮内膜、子宮内膜症、卵巣類内膜癌の遺伝子発現プロファイルの類似性を明らかにしている。また、各組織のRNAシークエンスデータよりlong non-coding RNA (lnc RNA)プロファイルを作成し、内膜症癌化の原因となりうる機能性lnc RNAを同定を試みているが解析に時間を要している。
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| 今後の研究の推進方策 |
引き続き、同一症例内の正常子宮内膜、子宮内膜症、卵巣類内膜癌のRNAシークエンスデータより網羅的遺伝子発現プロファイルを作成し、クラスター解析法を用いて正常子宮内膜、子宮内膜症、卵巣類内膜癌の遺伝子発現プロファイルの類似性を明らかにする。また、各組織のRNAシークエンスデータよりlong non-coding RNA (lnc RNA)プロファイルを作成し、内膜症癌化の原因となりうる機能性lnc RNAを同定する。同一症例内の正常子宮内膜、子宮内膜症、卵巣類内膜癌の網羅的遺伝子変異プロファイルを用いて、腫瘍の進化プロセスを明らかにする事により、子宮内膜症から卵巣類内膜癌への進展メカニズムを解明する。さらに、子宮内膜症上皮不死化細胞株に同定された遺伝子異常を導入し、in vitro/vivoでの機能解析を行い、統合解析により得られた候補遺伝子の内膜症癌化メカニズムへの関与を明らかにする。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
予定していた学会発表を延期したため。
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