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2018 年度 実績報告書

口腔の健康に寄与する口腔細菌叢の機能解明を目指した未同定主要細菌の分離同定

研究課題

研究課題/領域番号 16K11861
研究機関九州大学

研究代表者

柴田 幸江  九州大学, 歯学研究院, 助教 (30274476)

研究分担者 山下 喜久  九州大学, 歯学研究院, 教授 (20192403)
研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
キーワード口腔連鎖球菌 / 唾液細菌叢 / 分離同定
研究実績の概要

本年度は昨年度に引き続き、新たに同意を得られた九州大学歯学部学生30名の口腔診査ならびに唾液採取を実施し、前回と同様の方法で唾液細菌叢の解析を行った。昨年度に実施した学生30名分と合わせて合計60名分の16S rRNA遺伝子のV1-V2領域の配列について97%の相同性に基づき類似の配列を群分けすることで、 生物学的には種レベルと同等の分類となる Operation Taxonomic Unit (OTU)を構築し、各OTUの代表配列をHuman Oral Microbiome Database (HOMD) のデータと最も近似する細菌種に割り振ることでそれぞれのOTUが該当する細菌種を推定して、学生被験者60名の唾液の細菌構成を決定した。その中には5種類の菌種名が確定していないStreptococcus属 (HMT-423、HMT-431、HMT-058、HMT-070、HMT-056) が存在した。この結果は昨年と同様であり、菌種名が確定していない新たなStreptococcus属の発見には至らなかった。これらの平均構成比率はそれぞれ8.5%、2.6%、0.2%、0.03%、0.03%、個人の最高構成比率はそれぞれ25.9%、6.4%、1.5%、0.5%、0.4%であった。HOMDのデータベースは随時更新されており、最新版のVersion 15.1ではHMT-431はStreptococcus infantis、HMT-058はStreptococcus oralis subsp. dentisaniと確定されており、未だ菌種未確定のStreptococcus属は7菌種である。
さらに、菌種名が確定していないHMTの16S rRNA遺伝子配列はミティス菌群とより相同性が高いことから、医局員の唾液からStreptococcus属を釣菌する際には寒天培地上のコロニーの形態で鑑別可能なサリバリウス菌群を除外した。5名の医局員から51個のコロニーを単離培養し、16S rRNA遺伝子の塩基配列を決定したところ、未確定Streptococcus属HMT-423とHMT-064が分離同定された。

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公開日: 2019-12-27  

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