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2016 年度 実施状況報告書

ナノトラックを用いたキネシンとATPの同時1分子蛍光計測

研究課題

研究課題/領域番号 16K13644
研究機関京都大学

研究代表者

横川 隆司  京都大学, 工学研究科, 准教授 (10411216)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
キーワードマイクロ・ナノデバイス / 分子モーター / 生物物理 / ナノバイオ / 1分子計測(SMD)
研究実績の概要

平成28年度は,LZMW(ナノトラック)幅の最適化をFDTD法による電場解析により実施した.円形のZMWに対して励起光を導入した際の解析結果を参考に解析をおこなったところ,偏光が平行な場合にのみ10倍程度の増強が得られると計算された.また,トラック幅が狭い方が電場の閉じ込め効果は大きく,LZMW上方に存在するバルク溶液の励起を抑えられ,一方で励起強度は幅160 nm程度で最大となることを確認した.この閉じ込め効果と励起強度の相関を考慮しながら,幅100~200 nm程度のトラックを製作した.電子線描画の際のレジストの膜厚を3000-5000 rpmの回転数,ドーズを70-400 uC/cm2の範囲で条件検討し,3000 rpm, 300 uC/cm2が最適であることを見出した.さらに,これまでのベクタースキャンを用いた描画装置から,Character Projection(CP)方式の描画装置に移行することで,描画のハイスループット化を図った.
LZMW内への微小管-キネシンアッセイ系構築のため,幅100~200 nmのトラック内に微小管を導入する方法を検討した.ガラス表面にキネシンを固定し微小管運動アッセイにより導入し,グルタルアルデヒドを用いて固定した.処理後に再度ATPを導入しても微小管の運動が見られないことから,LZMW内のキネシンはATPase活性を有しないことを確認した.また,固定した微小管上を動くQ-dotキネシン(Q-dot 525)を確認しており,今後は1分子計測の検討をおこなう予定である.

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

平成28年度においては,当初予定していた電場解析とLZMWの製作をすべて実施できその成果が得られている.さらに,LZMW内でのタンパク質アッセイ系の検討も始めており,平成29年度に予定していた課題の一部に取り組むことができている.

今後の研究の推進方策

平成28年度に試行した微小管の導入・固定,およびQ-dotラベルしたキネシンの運動観察において,キネシンのステップ計測とATPの同時観察を目指す.さらに,LZMWの計測技術がフィラメント状のタンパク質全般に使えることを実証する.

次年度使用額が生じた理由

LZMWの電場解析に時間がかかったため,タンパク質アッセイの頻度が低く試薬の消費量が少なかったことにより物品費があまりかからなかったことが,次年度使用額が生じた理由である.

次年度使用額の使用計画

タンパク質アッセイの頻度が上がる予定であり,物品費に使用する予定である.

  • 研究成果

    (11件)

すべて 2017 2016 その他

すべて 学会発表 (10件) (うち国際学会 4件、 招待講演 3件) 備考 (1件)

  • [学会発表] Linear Zero Mode Waveguides for the Study of Chemo-Mechanical Coupling Mechanism of Kinesin2017

    • 著者名/発表者名
      K. Fujimoto, Y. Morita, R. Iino, M. Tomishige, H. Shintaku, H. Kotera, and R. Yokokawa
    • 学会等名
      The 30th IEEE International Conference on Micro Electro Mechanical Systems (MEMS 2017)
    • 発表場所
      Las Vegas, USA
    • 年月日
      2017-01-23 – 2017-01-26
    • 国際学会
  • [学会発表] Micro/nano fabrications for engineering applications and biophysical studies of motor proteins2016

    • 著者名/発表者名
      R. Yokokawa
    • 学会等名
      International Conference on BioSensors, BioElectronics, BioMedical Devices, BioMEMS/NEMS & Applications (Bio4Apps 2016)
    • 発表場所
      Gold Coast, Australia
    • 年月日
      2016-12-14 – 2016-12-16
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] LZMWを利用した高濃度蛍光ATP存在下でのキネシン運動とATP結合の同時蛍光1分子観察2016

    • 著者名/発表者名
      藤本 和也, 森田 有貴, 新宅 博文, 飯野 亮太, 富重 道雄, 小寺 秀俊, 横川 隆司
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      2016-11-25 – 2016-11-27
  • [学会発表] Single-Molecule Fluorescence Imaging of Kinesin Using Linear Zero-Mode Waveguides2016

    • 著者名/発表者名
      Y. Morita, K. Fujimoto, R. Iino, M. Tomishige, H. Shintaku, H. Kotera, R. Yokokawa
    • 学会等名
      IEEE Sensors 2017
    • 発表場所
      Orlando, USA
    • 年月日
      2016-10-30 – 2016-11-02
    • 国際学会
  • [学会発表] LZMWを用いたキネシンによるATP加水分解サイクルの可視化2016

    • 著者名/発表者名
      藤本 和也, 森田 有貴, 新宅 博文, 飯野 亮太, 富重 道雄, 小寺 秀俊, 横川 隆司
    • 学会等名
      第33回「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム
    • 発表場所
      平戸
    • 年月日
      2016-10-24 – 2016-10-26
  • [学会発表] Linear Zero Mode WaveguideによるキネシンのATP加水分解サイクル1分子計測2016

    • 著者名/発表者名
      藤本 和也, 森田 有貴, 新宅 博文, 飯野 亮太, 富重 道雄, 小寺 秀俊, 横川 隆司
    • 学会等名
      第67回コロイドと界面化学討論会
    • 発表場所
      旭川
    • 年月日
      2016-09-22 – 2016-09-24
  • [学会発表] R14Aキネシンによるナノトラックへの微小管の固定法とその評価2016

    • 著者名/発表者名
      森田 有貴, 藤本 和也, 飯野 亮太, 富重 道雄, 新宅 博文, 小寺 秀俊, 横川 隆司
    • 学会等名
      化学とマイクロ・ナノシステム学会 第34回研究会
    • 発表場所
      千葉
    • 年月日
      2016-09-06 – 2016-09-07
  • [学会発表] キネシン1分子観察系構築に向けたLZMWへの微小管の固定2016

    • 著者名/発表者名
      森田 有貴, 藤本 和也, 飯野 亮太, 富重 道雄, 新宅 博文, 小寺 秀俊, 横川 隆司
    • 学会等名
      平成28年度電気学会 センサ・マイクロマシン部門総合研究会 バイオ・マイクロシステム研究会
    • 発表場所
      金沢
    • 年月日
      2016-06-29 – 2016-06-30
  • [学会発表] 微小流体デバイスのタンパク質・細胞応用2016

    • 著者名/発表者名
      横川隆司
    • 学会等名
      精密工学会「第4回IoT製造研究会」
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2016-06-24
    • 招待講演
  • [学会発表] Microfluidic devices for biophysical studies and engineering applications of motor proteins2016

    • 著者名/発表者名
      R. Yokokawa
    • 学会等名
      OIST Mini Symposium; Science and Technology at the Interface of Bio-Nano-Systems: Challenges and Opportunities
    • 発表場所
      Onna, Japan
    • 年月日
      2016-04-25 – 2016-04-27
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考] 横川 隆司の個人ページ

    • URL

      http://www.ksys.me.kyoto-u.ac.jp/ry/

URL: 

公開日: 2019-12-27  

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