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2018 年度 実績報告書

葉緑体核様体ネットワークのダイナミクスを止揚する

研究課題

研究課題/領域番号 16K14768
研究機関京都大学

研究代表者

西村 芳樹  京都大学, 理学研究科, 助教 (70444099)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
キーワード葉緑体DNA / 葉緑体核様体 / マイクロ流体デバイス / ライブイメージング
研究実績の概要

細胞呼吸や光合成の中枢として機能するミトコンドリア(以下mt)や葉緑体(以下cp)は独自のゲノムをもつ。これらmt/cpゲノムはDNA-タンパク質複合体(核様体)を形成している。mt/cp核様体は、mt/cpDNAの折り畳み、複製、組換え、修復、遺伝子発現や遺伝などの機能ユニットとして重要であると提唱されてきたが、その動態制御については殆ど知見がなかった。本研究ではマイクロ流体プラットフォームを基盤とするライブイメージング技術によってcp核様体の動態を詳細に捉えるとともに、cp核様体の形態異常を示す変異体群の順遺伝学的解析およびRNAseq解析をおこなうことで、葉緑体の染色体ともいうべきcp核様体の動
態制御のメカニズムを、遺伝子レベルで明らかにすることを目指した。
葉緑体核様体の形態異常変異体のひとつであるmonokaryotic chloroplast (moc)1の解析においては、その原因遺伝子の特定と機能解析をおこなった結果、葉緑体におけるホリデイジャンクション解離酵素の発見につながった。この成果はKobayashi et al., Science 2017として発表した。
また葉緑体核様体の動態をマイクロ流体デバイスによって捉えるプロジェクトについては、G1期では球状構造体として観察される葉緑体核様体が、葉緑体分裂
にともなって徐々に解体され、葉緑体全体にひろがるネットワーク状構造に変化していく様子を、ライブイメージングによって初めてとらえることに成功し、葉緑体核様体が柔軟なネットワークであることを明らかにした。

  • 研究成果

    (21件)

すべて 2019 2018 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (14件) (うち国際学会 5件、 招待講演 3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Chloroplast nucleoids as a transformable network revealed by live imaging with a microfluidic device2018

    • 著者名/発表者名
      Kamimura Yoshitaka、Tanaka Hitomi、Kobayashi Yusuke、Shikanai Toshiharu、Nishimura Yoshiki
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 1:47 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1038/s42003-018-0055-1

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Isolation and Characterization of Chlamydomonas Autophagy-Related Mutants in Nutrient-Deficient Conditions2018

    • 著者名/発表者名
      Kajikawa Masataka、Yamauchi Marika、Shinkawa Haruka、Tanaka Manabu、Hatano Kyoko、Nishimura Yoshiki、Kato Misako、Fukuzawa Hideya
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 60 ページ: 126~138

    • DOI

      10.1093/pcp/pcy193

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of Holliday junction resolvases crucial for the chloroplast nucleoid morphology and segregation2018

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi Yusuke、Misumi Osami、Nishimura Yoshiki
    • 雑誌名

      PLANT MORPHOLOGY

      巻: 30 ページ: 73~81

    • DOI

      10.5685/plmorphol.30.73

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 葉緑体DNAの分配を司るホリデイジャンクション解離酵素の発見2018

    • 著者名/発表者名
      西村芳樹
    • 雑誌名

      バイオサイエンスとインダストリー

      巻: 76(5) ページ: 404

  • [雑誌論文] 葉緑体核様体の進化と構造のダイナミクス2018

    • 著者名/発表者名
      小林優介、三角修己、西村芳樹
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 56(10) ページ: 651-658

  • [雑誌論文] ゲノム編集の時代における「緑の酵母」クラミドモナスの復権2018

    • 著者名/発表者名
      浜地貴志・西村芳樹
    • 雑誌名

      生物工学

      巻: 96(8) ページ: 475

  • [学会発表] 葉緑体核様体のかたちを司るDNAリガーゼの同定2019

    • 著者名/発表者名
      西村芳樹、小林優介、浜地貴志、鹿内利治
    • 学会等名
      第60回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] 核様体局在のHMGBタンパク質がDNA結合ドメインを2つもつ利点2019

    • 著者名/発表者名
      田草川真理, 小林優介, 深尾陽一朗, 日高久美, 遠藤政幸, 杉山弘, 宮川勇, 鹿内利治, 三角修己, 西村芳樹
    • 学会等名
      第60回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] Chloroplast chromosomes on the move - Exploring the dynamics of chloroplast nucleoids -2018

    • 著者名/発表者名
      Yoshiki Nishimura
    • 学会等名
      理研/ERATO/CSRSセミナー
    • 招待講演
  • [学会発表] 葉緑体核様体ネットワークの動態制御機構2018

    • 著者名/発表者名
      西村 芳樹,浜地 貴志,小林 優介,鹿内 利治
    • 学会等名
      日本植物学会第82回大会
  • [学会発表] Dynamic network structure of chloroplast nucleoids.2018

    • 著者名/発表者名
      Yoshiki Nishimura, Yusuke Kobayashi, Yoshitaka Kamimura, Osami Misumi, Toshiharu Shikanai
    • 学会等名
      1st Asia-Oceania International Congress on Photosynthesis.
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 葉緑体核様体のダイナミクスと進化2018

    • 著者名/発表者名
      西村芳樹
    • 学会等名
      SIC研究部セミナー
    • 招待講演
  • [学会発表] Dynamic transformable network of chloroplast nucleoids2018

    • 著者名/発表者名
      Yoshiki Nishimura, Yusuke Kobayashi, Yoshitaka Kamimura, Osami Misumi, Toshiharu Shikanai
    • 学会等名
      International symposium on photosynthesis and chloroplast biogenesis.
    • 国際学会
  • [学会発表] Dynamic Network Structure of Chloroplast Nucleoids.2018

    • 著者名/発表者名
      Yoshiki Nishimura, Yusuke Kobayashi, Yoshitaka Kamimura, Osami Misumi, Toshiharu Shikanai, Mari Takusagawa, Yusuke Kobayashi, Yoichiro Fukao, Isamu Miyakawa, Toshiharu Shikanai.
    • 学会等名
      18th International Conference on the Cell and Molecular Biology of Chlamydomonas
    • 国際学会
  • [学会発表] ボルボックス系列異型配偶ユードリナにおける配偶子誘導要因の解析2018

    • 著者名/発表者名
      豊岡 博子,浜地 貴志,西村 芳樹,宮城島 進也,箕浦 高子,野崎 久義
    • 学会等名
      日本植物学会第82回大会
  • [学会発表] 母性遺伝メカニズムの解明に向けたクラミドモナス有性生殖のゲノム編集アプローチ2018

    • 著者名/発表者名
      浜地 貴志,山岡 尚平,鹿内 利治,西村 芳樹
    • 学会等名
      日本植物学会第82回大会
  • [学会発表] 雌雄異株種・同株種ボルボックスの性染色体領域・相同領域における比較ゲノム解析2018

    • 著者名/発表者名
      山本 荷葉子,浜地 貴志,豊岡 博子,新垣 陽子,野口 英樹,豊田 敦,水口 洋平,野崎 久義
    • 学会等名
      日本植物学会第82回大会
  • [学会発表] Biological analysis of plastid nucleoid-associated HMG-box protein in Chlamydomonas reinhardtii.2018

    • 著者名/発表者名
      Mari Takusagawa, Yusuke Kobayashi, Yoichiro Fukao, Isamu Miyakawa, Toshiharu Shikanai, Osami Misumi, and Yoshiki Nishimura.
    • 学会等名
      International symposium on photosynthesis and chloroplast biogenesis.
    • 国際学会
  • [学会発表] Organelle nucleoid-associated HMG-box proteins may have been evolved independently through tandem domain duplications.2018

    • 著者名/発表者名
      Mari Takusagawa, Yusuke Kobayashi, Yoichiro Fukao, Isamu Miyakawa, Toshiharu Shikanai, Osami Misumi, and Yoshiki Nishimura
    • 学会等名
      第14回植物縦横無尽の会
  • [学会発表] Organelle nucleoid-associated HMG-box proteins may have been evolved independently through tandem domain duplications.2018

    • 著者名/発表者名
      Mari Takusagawa, Yusuke Kobayashi, Yoichiro Fukao, Isamu Miyakawa, Toshiharu Shikanai, Osami Misumi, and Yoshiki Nishimura.
    • 学会等名
      Gordon Research Conference, Mitochondria and Chloroplasts.
    • 国際学会
  • [備考] 京都大学大学院 理学研究科 植物分子遺伝学研究室

    • URL

      http://www.bot.kyoto-u.ac.jp/j/5_iden.html

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公開日: 2019-12-27  

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