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2016 年度 実施状況報告書

エピゲノム制御を介した生体内エネルギー状態に応じた遺伝子発現調節機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 16K14919
研究機関東京大学

研究代表者

井上 順  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授 (70323962)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
キーワードエピゲノム / マイクロアレイ
研究実績の概要

本研究の目的は、生体内エネルギー状態に応じた遺伝子発現の制御機構を理解することにあり、特に、エピゲノムレベルでの制御の可能性を検討する。具体的には、摂食時に発現が上昇する遺伝子に関して、転写因子の活性制御だけでは説明のつかない遺伝子に着目し、ヒストンアセチル化やメチル化等のヒストンコードやDNAメチル化状態について解析を行う。はじめにマイクロアレイを用いて網羅的な遺伝子発現解析を行い、その結果を用いてエピゲノムレベルでの解析を進める。さらに、見出したエピゲノム制御と病態との関連についても解析を行う。はじめにマイクロアレイを用いて、摂食状態に応じたそれぞれの遺伝子発現のパターンをクラス分けする。これにより着目する遺伝子を選別する。着目した遺伝子についてエピゲノムレベルでの解析を行う。本年度は、再摂食時に発現が持続的に変動する遺伝子の網羅的探索をマイクロアレイを用いて解析した。得られた結果を分類し、以下の基準に当てはまる遺伝子を選別した。(A)再摂食24、48時間において遺伝子発現が大きく上昇している遺伝子(B)再摂食24、48時間において遺伝子発現が大きく低下している遺伝子(C)自由摂食群と比較して遺伝し発現が大きく上昇している遺伝子(D)自由摂食群と比較して遺伝し発現が大きく低下している遺伝子
さらに、同じサンプルを用いてリアルタイムPCRを行い、マイクロアレイの結果の正確性を確認したところ、その正確性が確認できた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

目標通りに遺伝子の分類を行うことができた。

今後の研究の推進方策

当初の研究計画の流れに従い、研究を推進していく。

次年度使用額が生じた理由

リアルタイムPCR用のプライマー設計に時間がかかり、関連試薬の購入が遅れたため。

次年度使用額の使用計画

設計完了の目処はたっているので、順次購入する予定である。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2017 2016

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Heat Shock Protein 90 Modulates Lipid Homeostasis by Regulating the Stability and Function of Sterol Regulatory Element-Binding Protein (SREBP) and SREBP Cleavage-Activating Protein.2017

    • 著者名/発表者名
      Kuan, Y-C., Hashidume, T., Shibata, T., Uchida, K., Shimizu, M., Inoue, J., and Sato, R.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 292 ページ: 3106-3028

    • DOI

      10.1074/jbc.M116.767277.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] BCL11B gene heterozygosity causes weight loss accompanied by increased energy consumption, but not defective adipogenesis, in mice.2017

    • 著者名/発表者名
      Inoue, J., Ihara, Y., Tsukamoto, D., Yasumoto, K., Hashidume, T., Kamimura, K., Hirano, S., Shimizu, M., Kominami, R., and Sato, R.
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem.

      巻: 81 ページ: 922-930

    • DOI

      10.1080/09168451.2016.1274642.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of BCL11B as a regulator of adipogenesis.2016

    • 著者名/発表者名
      Inoue, J., Ihara, Y., Tsukamoto, D., Yasumoto, K., Hashidume, T., Kamimura, K., Nakai, Y., Hirano, S., Shimizu, M., Kominami, R., and Sato, R.
    • 雑誌名

      Sci. Rep.

      巻: 6 ページ: 32750

    • DOI

      10.1038/srep32750.

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Kaempferol stimulates gene expression of low-density lipoprotein receptor through activation of Sp1 in cultured hepatocytes.2016

    • 著者名/発表者名
      Ochiai, A., Miyata, S., Iwase, M., Shimizu, M., Inoue, J., and Sato, R.
    • 雑誌名

      Sci. Rep.

      巻: 6 ページ: 24940

    • DOI

      10.1038/srep24940.

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 抑制性転化因子BCL11Bによる脂肪細胞分化および脂肪蓄積制御の解析2017

    • 著者名/発表者名
      井上順
    • 学会等名
      2017年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      京都女子大(京都府京都市)
    • 年月日
      2017-03-17 – 2017-03-20

URL: 

公開日: 2018-01-16  

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