研究課題/領域番号 |
16K15400
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研究機関 | 福井大学 |
研究代表者 |
飯田 礼子 福井大学, 学術研究院医学系部門, 准教授 (40139788)
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研究期間 (年度) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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キーワード | 法医学 / 個人識別 |
研究実績の概要 |
1.身体的特徴との相関が予測されるのコピー数解析法の確立 1)PubMedを利用して、身長との相関が予想される2つのCNV (LTBP1およびETV-6)を過去の文献から選出した。それぞれのCNVについて、①目的配列、 ②単一コピー遺伝子(ZNF80) および ③目的配列と単一コピー遺伝子のハイブリッド を組み込んだプラスミドベクターを作製し、これらプラスミドベクターの希釈列を用いて定量的PCRを行った。 2)目的配列および単一コピー遺伝子のそれぞれについて検量線を作成したところ、単一コピー遺伝子ZNF80と目的CNVの増幅効率に大きな相違は無く、適切な正規化と正確な判定が可能と考えられた。また、プラスミド混合物を用いて行った模擬分析においても、正確なコピー数を算出することが可能であった。したがって、当初の目的であった簡便なCNVコピー数解析法を確立することができた。 2.CNVコピー数と身長の相関性の解析 島根大学より供与を受けた日本人119名のDNAを用いて、各遺伝子のCNV型判定を行った。コピー数と身長の間に逆相関の傾向が男女ともに認められたが、分散分析における有意差は無く、より大きな集団での再検討が必要と思われた。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
当初平成28年度に予定していた計画を概ね達成した。しかし、CNVコピー数と身長の間に逆相関の傾向が認められたものの、有意差は無かったことから実用化のためにはサンプル数を増やす、他のCNVについて解析するなど、さらなる検討が必要と考えられた。
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今後の研究の推進方策 |
1. 今年度に確立した方法を用いて、引き続き身長、体重などとの相関が予測される遺伝子のCNV解析および相関解析を実施する。
2.同じDNAサンプルを用いて、ヒト用にデザインされたTaqManコピー数分析キットによるCNV解析を行い、今回開発した定量的PCR法との比較・検討を行う。
3. 相関が高いと認められたCNVの組み合わせによるマルチマーカーシステムの構築を試みる。
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次年度使用額が生じた理由 |
試薬や器具類をキャンペーンの利用により購入したため差額が生じた。
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次年度使用額の使用計画 |
H29年度助成金の物品費と合わせて、試薬等の消耗品の購入に使用する。
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