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2017 年度 実施状況報告書

動脈硬化進行と共に変化するsmall RNAワールドのネットワーク統合解析

研究課題

研究課題/領域番号 16K15438
研究機関東京大学

研究代表者

神吉 康晴  東京大学, アイソトープ総合センター, 助教 (00534869)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
キーワードsmall RNA / 動脈硬化 / 血管内皮細胞 / 接着因子 / ヒストン脱メチル化酵素
研究実績の概要

高齢化社会を迎えた現在、心筋梗塞、脳梗塞、閉塞性動脈硬化症などの血管の老化に伴う疾患のメカニズムを解明することは急務である。こうした疾患は、血中を流れる単球が血管内皮細胞の壁に接着因子を介して結合するところから病態が発症、進行すると考えられている。申請者はこれまでに、動脈硬化の形成に重要な血管内皮細胞接着因子Vascular Cell Adhesion Molecule-1 (VCAM-1)がInterleukin-4 (IL-4)やTumor Necrosis Factor-alpha (TNF-a) によって持続的に誘導されること、その際に重要な新規エンハンサー領域が存在すること、を報告してきた (Tozawa H, Kanki Y et,al 20 11 MCB、Papantonis A, Kanki Y et al 2012 EMBO J)。
本研究では、特定のmiRNAが動脈硬化の発症と関与している仮説を立て、その下流のパスウェイを調べた。2年目にあたる平成29年度は、初年度に見出したmiRの標的となる遺伝子を同定した。その結果、同定されたのは2つのヒストン脱メチル化酵素であり、これらが接着因子のエピゲノム修飾を変化させることで、接着因子の発現を誘導していることを見出した。更に、この2つのヒストン脱メチル化酵素の結合する領域を調べるために、ChIP-seqを行った。結果、炎症性刺激が血管内皮細胞に及んだ際に惹起される遺伝子発現誘導に深く寄与していることが明らかとなった。
これらの成果は、特定のエピジェネティクス因子が動脈硬化の発症に寄与しているという世界で初めての知見を提示することとなった。先進国における血管疾患の重要性を鑑みるに、今回明らかにしたメカニズムは基礎分子生物学的にも臨床医学的にも意義の高いものである。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

当初の研究計画において、2年目は初年度に見出したmiRNAの標的となる遺伝子を同定し、その動脈硬化に対する役割を明らかにすることが目的であった。現時点で、2つのヒストン脱メチル化酵素を標的として見出しており、更に、その結合部位に関しても次世代シークエンサーで同定できていることから、概ね研究は順調に進行していると考えられる。
miRNAの標的となる遺伝子に関しては、RISC複合体のコアタンパク質であるAGO2に対する抗体を用いたRNA免疫沈降実験によって明らかにした。このやり方は、従来のin sillicoのデータベースからの予想と組み合わせることで、より正確に文脈依存的なmiRNAの標的遺伝子を同定することが出来ると考えられる。
また、2つのヒストン脱メチル化酵素の動脈硬化に対する役割については、in vitroではあるが、siRNAを用いたノックダウン実験によって、単球接着に寄与していることも見出した。
上記の点を鑑みるに、平成29年度に関しては、当初の計画以上に進展していると考えられる。

今後の研究の推進方策

今回同定した2つのヒストン脱メチル化酵素が単球接着に寄与していることは、既にin vitroの単球接着アッセイによって確認されている。そこで、最終年度はこれら2つの酵素が実際にマウス個体での動脈硬化の発症や進展に寄与しているかどうかの検討を行う。
また、それとは別に分子生物学的な詳細なメカニズム解析も行う。これまでに、炎症性刺激であるTNF-aを血管内皮細胞に添加すると、NF-kB (p65) パスウェイが駆動され、接着因子の発現をオンにすることが知られている。本研究で見出した2つのヒストン脱メチル化酵素が、このNF-kBの結合サイトとどのような相関があるのか、また、これによって形成されるスーパーエンハンサーや染色体構造とどのような関係があるのか、についてChIP-seq、Hi-Cなどを用いた解析を行う。
これまで、スーパーエンハンサーや染色体構造に関しては、細胞分化やがん細胞で詳細に検討されてきたが、本研究で明らかにしようとしているような、終末分化した細胞での知見はほとんどない。これら実験を行うことで、慢性疾患の発症の起点となるエピジェネティクス変化の機構の一端を明らかにすることが期待される。

  • 研究成果

    (9件)

すべて 2018 2017

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Genome-wide analysis revealed that DZNep reduces tubulointerstitial fibrosis via down-regulation of pro-fibrotic genes2018

    • 著者名/発表者名
      Mimura Imari、Hirakawa Yosuke、Kanki Yasuharu、Nakaki Ryo、Suzuki Yutaka、Tanaka Tetsuhiro、Aburatani Hiroyuki、Nangaku Masaomi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 8 ページ: 3779

    • DOI

      10.1038/s41598-018-22180-5

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Identification of Cardiomyocyte-Fated Progenitors from Human-Induced Pluripotent Stem Cells Marked with CD822018

    • 著者名/発表者名
      Takeda Masafumi、Kanki Yasuharu、Masumoto Hidetoshi、Funakoshi Shunsuke、Hatani Takeshi、Fukushima Hiroyuki、Izumi-Taguchi Akashi、Matsui Yusuke、Shimamura Teppei、Yoshida Yoshinori、Yamashita Jun K.
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 22 ページ: 546~556

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2017.12.057

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Novel lnc RNA regulated by HIF-1 inhibits apoptotic cell death in the renal tubular epithelial cells under hypoxia2017

    • 著者名/発表者名
      Mimura Imari、Hirakawa Yosuke、Kanki Yasuharu、Kushida Natsuki、Nakaki Ryo、Suzuki Yutaka、Tanaka Tetsuhiro、Aburatani Hiroyuki、Nangaku Masaomi
    • 雑誌名

      Physiological Reports

      巻: 5 ページ: e13203~e13203

    • DOI

      10.14814/phy2.13203

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dynamically and epigenetically coordinated GATA/ETS/SOX transcription factor expression is indispensable for endothelial cell differentiation2017

    • 著者名/発表者名
      Kanki Yasuharu、Nakaki Ryo、Shimamura Teppei、Matsunaga Taichi、Yamamizu Kohei、Katayama Shiori、Suehiro Jun-ichi、Osawa Tsuyoshi、Aburatani Hiroyuki、Kodama Tatsuhiko、Wada Youichiro、Yamashita Jun K.、Minami Takashi
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 45 ページ: 4344~4358

    • DOI

      10.1093/nar/gkx159

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] ヒストン修飾酵素による動脈硬化関連遺伝子発現制御解析2018

    • 著者名/発表者名
      神吉康晴
    • 学会等名
      第4回血管生物若手研究会
  • [学会発表] Single particle analysis by cryo-electron microscopy2017

    • 著者名/発表者名
      Yasuharu Kanki, Sagar Chittori, Doreen Matthies, Prashant Rao, Alan A. Merk, Sriram Subramaniam
    • 学会等名
      ConBio2017
    • 招待講演
  • [学会発表] microRNA-histone modification netwok in TNFa-stimulated inflammatory endothelium2017

    • 著者名/発表者名
      東島 佳毅、神吉 康晴、井上 剛、南学 正臣、古川 哲史、和田 洋一郎
    • 学会等名
      ConBio2017
  • [学会発表] Lysine Demethylase 6A And 7A Regulated By MicroRNA-3679-5p Mediates TNF-α-induced Inflammatory Signaling In Vascular Endothelium.2017

    • 著者名/発表者名
      Yoshiki HIGASHIJIMA,Tsuyoshi INOUE, Masaomi NANGAKU, Youichiro WADA, Tetsushi FURUKAWA,Yasuharu KANKI
    • 学会等名
      American Heart Association 2017
    • 国際学会
  • [図書] 実験医学2017年8月号2017

    • 著者名/発表者名
      神吉康晴
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      羊土社

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公開日: 2018-12-17  

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