全エクソンシーケンス（EXOME）による過剰歯原因遺伝子変異の同定

2017 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 16K15843
• 研究機関: 昭和大学
• 研究代表者: 山口 徹太郎 昭和大学, 歯学部, 准教授 (40384193)
• 研究分担者: 高橋 正皓 昭和大学, 歯学部, 助教 (10736713)
• 研究期間 (年度): 2016-04-01 – 2018-03-31
• キーワード: ゲノム / 過剰歯 / 全エクソンシーケンス

研究実績の概要

過剰歯は、顎顔面領域に見られる頻度の高い疾患の一つである。家族性を認める報告があるとともに、鎖骨頭蓋異骨症など好発する遺伝性疾患が存在することから遺伝的関与は間違いないものの、その原因遺伝子は明らかになっていない。一方、近年“Exome sequencing（全エクソンシーケンス）”により、家族性稀少疾患の原因遺伝子同定の成功例が報告されている。“Exome”とはヒトゲノムにおけるすべてのエクソン領域を示し、その配列に含まれる変異が疾患原因の約85％を説明すると推定されている。本申請課題の目的は次世代シーケンサーによる全エクソンシーケンスにより過剰歯、特に上顎正中埋伏過剰歯の家族性を呈する申請者所属機関で見出された4家系から候補遺伝子を抽出するのに加え、別の約48罹患者からその原因遺伝子変異を同定する。上顎正中過剰埋伏歯は、パノラマX線写真またはオクルーザルX線写真により診断した。上顎正中過剰埋伏歯を有する日本人を対象とした。罹患者2名を含む2家系、兄弟間のみで罹患者を認める1家系、姉妹間のみで罹患者を認める1家系について全エクソンシーケンスを実施した。本研究は、昭和大学ならびに関連機関の倫理委員会により承認を得て実施した。日本人罹患者における上顎正中過剰埋伏歯の形成に関与する候補遺伝子を抽出した。3家系内で共通して変異が存在した遺伝子にはSSPOのみであった。2家系内で共通して変異が存在した遺伝子にはAIM1L、AGRN、ATXN1、CDH26など23遺伝子を同定した。全エクソンシーケンスは埋伏歯の疾患変異の同定に有用であると考えられた。

研究成果

• [国際共同研究] Pusan National University(韓国)
  • 国名: 韓国
  • 外国機関名: Pusan National University
• [国際共同研究] Suez Canal University(エジプト)
  • 国名: エジプト
  • 外国機関名: Suez Canal University
• [雑誌論文] Growth hormone receptor gene variant and three dimensional mandibular morphology (2017)
  • 著者名/発表者名: Nakawaki T, Yamaguchi T, Isa M, Kawaguchi A, Tomita D, Hikita Y, Suzuki-Tomoyasu Y, Adel M, Ishida H, Maki K, Kimura R
  • 雑誌名: Angle Orthod 巻: 87 ページ: 68-73
  • DOI: doi: 10.2319/02316-154.1.
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Whole-exome sequencing analysis of supernumerary teeth in Japanese individuals (2017)
  • 著者名/発表者名: Takahashi M, Hosomichi K, Yamaguchi T, Yano K, Funatsu T, Adel M, Haga S, Maki K, Tajima A
  • 雑誌名: Hum Genome Var 巻: 4 ページ: 16046
  • DOI: doi:10.1038/hgv.2016.46
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] The Contribution of FGFR1 polymorphisms to the human craniofacial variation in Japanese and Korean populations. (2017)
  • 著者名/発表者名: Adel M, Yamaguchi T, Tomita D, Nakawaki T, Kim YI, Hikita Y, Haga S, Takahashi M, Nadim MA, Kawaguchi A, Isa M, El-kenany WH, El-Kadi AA, Park SB, Ishida H, Maki K, Kimura R
  • 雑誌名: Plos One 巻: 12 ページ: e0170645
  • DOI: doi:10.1371/journal.pone.0170645
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Comprehensive genetic exploration of selective tooth agenesis of mandibular incisors by exome sequencing (2017)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi T, Hosomichi K, Yano K, Kim YI, Nakaoka H, Kimura R, Otsuka H, Nonaka N, Haga S, Takahashi M, Shirota T, Yamada A, Kamijo R, Park SB, Nakamura M, Maki K, Inoue I
  • 雑誌名: Hum Genome Var 巻: 4 ページ: 17005
  • DOI: doi:10.1038/hgv.2017.5
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Assessment of the root apex position of impacted maxillary canines on panoramic films (2017)
  • 著者名/発表者名: Kim SH, Son WS, Yamaguchi T, Maki K, Kim SS, Park SB, Kim YI
  • 雑誌名: Am J Orthod Dentofacial Orthop 巻: 152 ページ: 489-493
  • DOI: doi: 10.1016/j.ajodo.2017.01.027.
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] IRF6 variants affect nasolabial morphology in East Asian population (2017)
  • 著者名/発表者名: Tomita D, Yamaguchi T, Nakawaki T, Hikita Y, Adel M, Kim YI, Haga S, Takahashi M, Kawaguchi A, Isa M, Park SB, Ishida H, Maki K, Kimura R
  • 雑誌名: Arch Oral Biol 巻: 85 ページ: 142-147
  • DOI: doi: 10.1016/j.archoralbio.2017.10.005.
  • 査読あり / 国際共著
• [学会発表] 成長ホルモン受容体（GHR）遺伝子多型と三次元的に解析した下顎骨形態との関連 (2017)
  • 著者名/発表者名: 中脇貴俊、山口徹太郎、冨田大介、疋田悠、鈴木洋子、Mohamed Adel、方山光朱、木村亮介、槇宏太郎
  • 学会等名: 第27回日本顎変形症学会
• [学会発表] Williams症候群の5歳から24歳の治療経過の一例 (2017)
  • 著者名/発表者名: 山口徹太郎、代田達夫、芳賀秀郷、中島美里、降旗真由、高橋正皓、長濱諒、相原のぞみ、槇宏太郎
  • 学会等名: 第27回日本顎変形症学会
• [学会発表] 口唇口蓋裂患者の骨成熟度評価のための統計的形状解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 山口徹太郎、芳賀秀郷、中島美里、降旗真由、高橋正皓、長濱諒、相原のぞみ、槇宏太郎
  • 学会等名: 第27回日本顎変形症学会