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2017 年度 研究成果報告書

大規模シミュレーションとデータベース解析に基づく蛋白質立体構造予測改良法の開発

研究課題

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研究課題/領域番号 16K16142
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 生命・健康・医療情報学
研究機関東北大学

研究代表者

城田 松之  東北大学, 医学系研究科, 助教 (00549462)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
キーワード蛋白質構造 / 構造予測 / RNA-seq
研究成果の概要

アミノ酸配列からの蛋白質立体構造の予測において構造モデルの精度を向上させることはそのモデルの分子機能の解明や創薬などへの応用可能性を広げる重要な課題である。本研究では既知の蛋白質構造を網羅的に活用することで構造予測改良につなげるデータベースと手法の作成を行った。合わせて、ヒトの蛋白質をターゲットとして、既存の構造とのアラインメントを作成し、構造予測の改良に役立てられるように整備した。さらに、蛋白質立体構造へのマイクロエクソンによるアミノ酸残基挿入やG蛋白質共役型受容体における膜貫通ドメインのアラインメントと変異の統計解析を行って、構造予測の改良を適用する基盤を構築した。

自由記述の分野

バイオインフォマティクス

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公開日: 2019-03-29  

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