2019 年度研究成果報告書

lncRNAを中心とした生体分子間相互作用ネットワークの予測と機能推定法の開発

研究課題

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研究課題/領域番号	16K16143
研究種目	若手研究(B)
配分区分	基金
研究分野	生命・健康・医療情報学
研究機関	東京大学
研究代表者	岩切淳一東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 助教 (40770160)
研究期間 (年度)	2016-04-01 – 2020-03-31
キーワード	長鎖ノンコーディングRNA / lncRNA / RNA-RNA相互作用 / 核内構造体
研究成果の概要	本研究では、lncRNAの機能を推定するための情報基盤として、lncRNAの分子間相互作用予測を塩基配列およびRNA-seqの大規模な実験データから高精度に予測できる仕組みを構築し、ヒトおよびマウスのlncRNAの相互作用予測結果を網羅したWebサーバーを開発した。このWebサーバーを用いることで、いくつかのヒトlncRNAについて、lncRNA-RNA相互作用が核内構造体形成に関与していることが示唆される結果が得られた。
自由記述の分野	RNA計算生物学
研究成果の学術的意義や社会的意義	ヒトの生体内には数万種類にも及ぶ機能未知の長鎖ノンコーディングRNA（lncRNA）が様々な体組織で特異的に発現し、複雑な分子間相互作用のネットワークを形成し、多様な生体制御を実現していると考えられている。本研究では、分子間相互作用の観点からlncRNAの機能を明らかにするために、lncRNAの分子間相互作用を配列および実験データから高精度に予測し、ヒトおよびマウスの全てのlncRNAの相互作用を網羅したWebサーバー（http://rtools.cbrc.jp/LncRRIsearch/）として公開した。これにより、lncRNAの機能解析研究を加速することが期待される。