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2017 年度 実施状況報告書

ペプチドアレイ定量に基づいた未踏ペプチドリガンド配列の分子進化的探索

研究課題

研究課題/領域番号 16K16644
研究機関公益財団法人川崎市産業振興財団(ナノ医療イノベーションセンター)

研究代表者

上野 真吾  公益財団法人川崎市産業振興財団(ナノ医療イノベーションセンター), ナノ医療イノベーションセンター, 副主幹研究員 (30594650)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
キーワードペプチドリガンド / 無細胞合成 / マイクロアレイ
研究実績の概要

ファージディスプレイ等の進化分子工学技術による親和性ペプチドの探索は、膨大な分子多様性を持つペプチド配列空間から親和性ペプチドを発見する手段を提供してきた。しかしながら、結合能を評価基準とする既存技術は、生理活性を有するリガンドの探索には不十分である。
本研究では、無細胞翻訳系を用いたペプチドの基板上並列合成法により作製する分子進化用ペプチドアレイを用いた、生理活性ペプチドリガンドのスクリーニング技術を提案する。基板上にペプチドライブラリー(表現型分子)とそれをコードするDNA(遺伝子型分子)とを同一スポットにアレイ化し、それらペプチドの生理活性をマイクロアレイのフォーマットに則って定量評価した後、活性の高いペプチドをコードするDNAを基板上から物理的に回収しシーケンシングすることで、生理活性ペプチドを効率よく発見することができる分子進化技術の開発を目指す。
平成29年度は、分子進化用ペプチドアレイ作製技術の要素技術として、ペプチド連結酵素Sortaseによる無細胞合成ペプチドの固相上固定化手法を開発した。SortaseおよびSortaseの基質ペプチド配列LPETGを融合したタンパク質を再構成型無細胞タンパク質合成液によって合成した。その際、Sortaseの基質ペプチド配列であるオリゴグリシンを修飾した固相担体を共存させておくことで、無細胞合成された分子進化対象タンパク質が固相担体上にペプチド連結反応を介して共有結合により固定化されることを確認し、分子進化用ペプチドライブラリーマイクロアレイ作製を可能とする要素技術を構築した。また、マイクロアレイ上でペプチドによる酵素阻害活性等の生理活性を測定する際に、酵素反応の開始をコントロールする必要があるが、光照射とケージド基質を用いることで酵素反応を制御する手法を考案し論文投稿した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

ペプチドアレイを用いた生理活性ペプチド探索実験を行うために必要な、分子進化用ペプチドアレイの作製技術、運用技術の構築・改良は順調に進んでおり、論文投稿も行った。

今後の研究の推進方策

平成29年度に構築したSortaseを用いたペプチドアレイ作製法を基盤技術として、分子進化用ペプチドアレイ作製技術を確立し、生理活性に基づいたペプチド探索のモデル実験を試行する予定である。なお、本研究で得られた知見は、学術誌への投稿や、学会発表等を行うことで社会に還元する。

次年度使用額が生じた理由

次年度使用額が生じた理由: 当初の実験計画では、平成29年度中に生理活性ペプチド探索を目的としたペプチドアレイ作製技術を確立し、モデル探索実験を実施する予定であったが、新たに考案したマイクロアレイ上での酵素反応制御法の開発を優先した。そのためモデル探索実験用の予算を次年度に繰り越した。

次年度使用額の使用計画: 平成29年度に実施するはずであったモデル探索実験で必要となる試薬類の購入費用として利用する予定である。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2018 2017

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 3件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Phototriggered control of enzyme reactions toward high-throughput screening on a microwell array chip2017

    • 著者名/発表者名
      Shingo Ueno, Takanori Ichiki
    • 雑誌名

      Journal of Photopolymer Science and Technology

      巻: 30 ページ: 657-660

    • DOI

      10.2494/photopolymer.30.657

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 高集積マイクロウェルアレイシステムによるネオバイオ分子創出2018

    • 著者名/発表者名
      上野真吾、一木隆範
    • 学会等名
      日本農芸化学会2018年度大会
    • 招待講演
  • [学会発表] ペプチド連結酵素による共有結合を利用したタンパク質その場固定化技術の開発2018

    • 著者名/発表者名
      若井涼、上野真吾、白形優依、一木隆範
    • 学会等名
      第65回応用物理学会春季学術講演会
  • [学会発表] ネオバイオ分子のin vitroセレクションからon chip セレクションへ2017

    • 著者名/発表者名
      上野真吾
    • 学会等名
      2017年度 生命科学系学会合同年次大会
    • 招待講演
  • [学会発表] Spatiotemporal phototriggered control of biochemical reactions for on-chip ultrahigh-throughput screening of enzyme activities2017

    • 著者名/発表者名
      Shingo Ueno, Takanori Ichiki
    • 学会等名
      The 21th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences
    • 国際学会
  • [学会発表] In situ covalent immobilization of protein on a chip by sortase-mediated peptide ligation2017

    • 著者名/発表者名
      Ryo Wakai, Shingo Ueno, Takanori Ichiki
    • 学会等名
      The 21th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences
    • 国際学会
  • [学会発表] Photo-assisted control of the initiation of enzyme reaction2017

    • 著者名/発表者名
      Shingo Ueno, Shusuke Sato, Takanori Ichiki
    • 学会等名
      34rd International Conference of Photopolymer Science and Technology
    • 国際学会
  • [学会発表] 人工生体分子創製を目的とした高集積マイクロウェルアレイシステム2017

    • 著者名/発表者名
      上野真吾、佐藤秀介、塩谷美夏、飯塚怜、ジェーンアンキタ、若井涼、白形優依、船津高志、一木隆範
    • 学会等名
      理研/iCONM/物材機構 医工学ネットワーク
  • [学会発表] マイクロアレイでの分子セレクション技術の開発2017

    • 著者名/発表者名
      上野真吾、佐藤秀介、若井涼、塩谷美夏、一木隆範
    • 学会等名
      2017年度 生命科学系学会合同年次大会
  • [学会発表] Fundamental study for quantitative screening of mutant proteins on a glass-made microwell array chip2017

    • 著者名/発表者名
      Shusuke Sato, Ankita Jain, Hiromi Kuramochi, Shingo Ueno, Takanori Akagi, Takanori Ichiki
    • 学会等名
      第27回日本MRS年次大会
  • [学会発表] Development of quantitative aptamer screening using a microarray chip2017

    • 著者名/発表者名
      Ankita Jain, Shingo Ueno, Shusuke Sato, Takanori Ichiki
    • 学会等名
      第27回日本MRS年次大会
  • [学会発表] In situ covalent immobilization of peptide on glass substrate using transpeptidase sortase2017

    • 著者名/発表者名
      Ryo Wakai, Shingo Ueno, Takanori Ichiki
    • 学会等名
      第27回日本MRS年次大会
  • [学会発表] Effects of surface modification of reactor materials on cell-free synthesis2017

    • 著者名/発表者名
      Yui Shirakata, Shingo Ueno, Takanori Ichiki
    • 学会等名
      第27回日本MRS年次大会

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公開日: 2018-12-17  

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