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2016 年度 実施状況報告書

高速AFMを用いたCaMKIIの多量体構造内における記憶のメカニズム解明

研究課題

研究課題/領域番号 16K18523
研究機関金沢大学

研究代表者

柴田 幹大  金沢大学, 新学術創成研究機構, 准教授 (80631027)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
キーワードタンパク質 / 神経科学 / プロテインキナーゼ / 走査型プローブ顕微鏡 / 原子間力顕微鏡 / 高速原子間力顕微鏡 / バイオイメージング / ナノサイエンス
研究実績の概要

CaMKIIは脳の神経細胞に豊富に存在し、様々な薬理学実験や遺伝子欠損マウス等の実験から、“記憶分子”と考えられている。CaMKIIは12量体を形成し、高頻度刺激を積算(記憶)することができるため、多量体構造の中に“記憶の分子メカニズム”が隠されていると考えられてきたが、それを実証する手法がこれまでなかった。本研究では、高速原子間力顕微鏡(AFM)を用いて、12量体中の個々のCaMKIIの振る舞いをリアルタイムで直接可視化し、CaMKIIがどのような分子メカニズムで信号を積算(記憶)できるのかを明らかにする。本年度は、全長CaMKIIαとハブドメインのみを発現したCaMKIIαの2種類に対し、高速AFM観察を適用した。その結果、ハブドメインのみを発現したCaMKIIαでは、7つのサブユニットが対称リング構造を形成し、そのリングが上下に重なった対称ダブルリング14量体構造を形成することを明らかにした。一方、キナーゼドメインまで含む全長CaMKIIαの高速AFM観察では、6つのサブユニットがリング構造を形成し、上下に重なったダブルリング12量体構造を形成することを明らかにした。興味深いことに、全長CaMKIIαは対称リング構造をとらず、リングの一部が欠けた構造をとることが分かった。これは、ハブドメインはサブユニット同士を集合し、対称リング構造を形成しようと働くが、キナーゼドメインにより、その対称性は破られるという多量体構造におけるアロステリック効果の存在を強く示唆する。この一部が欠けた非対称リング構造は、ハブドメインとキナーゼドメインの間にあるカルモジュリン結合サイトを露出し、カルシウム/カルモジュリンが容易にアクセスできるよう最適化されているように見える。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

ハブドメインのみを発現したCaMKIIαの高速AFM観察により、AFM画像に現れる球状構造が、どちらのドメインに由来するのかを明らかにすることができた。また、高速AFM観察条件、特に観察バッファーの塩濃度を詳細に検討することで、AFM基板とCaMKIIとの吸着をコントロールし、キナーゼドメインの揺らぎを観察することができた。さらに、研究当初は予想もしていなかった、キナーゼドメインの存在が及ぼす多量体構造のアロステリック効果を発見することができた。

今後の研究の推進方策

次年度は、カルシウム/カルモジュリン結合に伴うCaMKIIαの構造変化を可視化し、さらに、CaMKIIαよりもハブドメインとキナーゼドメインを繋ぐループが短いCaMKIIhβ7に対しても高速AFM観察を行い、ループの長さの違いが、どのように高速AFM画像に現れるのかを明らかにする。これらの結果を元に、 カルシウム/カルモジュリンの結合に伴う12量体内の協同的効果を検証する。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2017 2016

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 1件、 招待講演 8件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] A natural light-driven inward proton pump2016

    • 著者名/発表者名
      Keiichi Inoue, Shota Ito, Yoshitaka Kato, Yurika Nomura, Mikihiro Shibata, Takayuki Uchihashi, Satoshi P. Tsunoda and Hideki Kandori
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 7 ページ: 13415

    • DOI

      10.1038/ncomms13415

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Nanoscale Visualization of Membrane Proteins by High-Speed Atomic Force Microscopy2017

    • 著者名/発表者名
      Mikihiro Shibata and Takayuki Uchihashi
    • 学会等名
      日本化学会第97回春季年会
    • 発表場所
      慶應義塾大学 日吉キャンパス
    • 年月日
      2017-03-16 – 2017-03-19
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 高速原子間力顕微鏡を用いたカルシウム・カルモジュリン依存性プロテインキナーゼIIのダイナミクス観察2017

    • 著者名/発表者名
      柴田幹大、村越秀治、内橋貴之
    • 学会等名
      平成28年度生物物理学会中部支部講演会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2017-03-06
  • [学会発表] 高速AFMを用いたナノバイオイメージング2017

    • 著者名/発表者名
      柴田幹大
    • 学会等名
      理学談話会
    • 発表場所
      金沢大学
    • 年月日
      2017-02-23
    • 招待講演
  • [学会発表] 高速AFMによる生きた細胞のナノスケール観察2017

    • 著者名/発表者名
      柴田幹大
    • 学会等名
      第1回生体界面研究会若手の会
    • 発表場所
      金沢大学
    • 年月日
      2017-02-09
    • 招待講演
  • [学会発表] 高速原子間力顕微鏡によるナノバイオイメージング2017

    • 著者名/発表者名
      柴田幹大
    • 学会等名
      第2回新学術創成研究機構シンポジウム
    • 発表場所
      金沢大学
    • 年月日
      2017-01-26
    • 招待講演
  • [学会発表] 高速AFMを用いたCRISPR/Cas9のDNA切断作動機構の解明2016

    • 著者名/発表者名
      柴田幹大, 西増弘志, 古寺哲幸, 平野清一, 濡木理, 内橋貴之
    • 学会等名
      日本生体エネルギー研究会第42回討論会
    • 発表場所
      名古屋工業大学
    • 年月日
      2016-12-19 – 2016-12-21
  • [学会発表] Visualization of protein molecules in action by high-speed atomic force microscopy.2016

    • 著者名/発表者名
      Mikihiro Shibata, Noriyuki Kodera, Takayuki Uchihashi and Toshio Ando
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場
    • 年月日
      2016-11-25 – 2016-11-27
    • 招待講演
  • [学会発表] Nanoscale imaging of living cells by high-speed AFM.2016

    • 著者名/発表者名
      Mikihiro Shibata
    • 学会等名
      OIIB Retreat 2016
    • 発表場所
      三河湾リゾートリンクス
    • 年月日
      2016-11-21 – 2016-11-22
    • 招待講演
  • [学会発表] 高速原子間力顕微鏡によるCRISPR-Cas9のDNA切断作動メカニズムの解明2016

    • 著者名/発表者名
      柴田幹大, 西増弘志, 古寺哲幸, 平野清一, 濡木理, 内橋貴之
    • 学会等名
      新学術領域「柔らかな分子系」第4回公開シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋工業大学
    • 年月日
      2016-10-27 – 2016-10-28
  • [学会発表] Nanoscale visualization of morphological dynamics of living neurons by high-speed atomic force microscopy.2016

    • 著者名/発表者名
      Mikihiro Shibata, Takayuki Uchihashi and Toshio Ando
    • 学会等名
      第89回日本生化学会大会
    • 発表場所
      東北大学
    • 年月日
      2016-09-25 – 2016-09-27
    • 招待講演
  • [学会発表] High-speed atomic force microscopy for nano-scale imaging in live cells.2016

    • 著者名/発表者名
      Mikihiro Shibata
    • 学会等名
      OptoBioTechnology Symposium on “Membrane Protein Dynamics”
    • 発表場所
      名古屋工業大学
    • 年月日
      2016-07-12
    • 招待講演
  • [学会発表] カルシウム/カルモジュリン依存性プロテインキナーゼIIの高速原子間力顕微鏡観察2016

    • 著者名/発表者名
      柴田幹大、村越秀治、内橋貴之
    • 学会等名
      新学術領域「柔らかな分子系」第5回全体合宿会議
    • 発表場所
      あてま高原リゾート ホテルベルナティオ(新潟県, 十日町)
    • 年月日
      2016-05-30 – 2016-06-01
  • [産業財産権] 走査型プローブ顕微鏡2016

    • 発明者名
      内橋貴之、柴田幹大、古寺哲幸
    • 権利者名
      内橋貴之、柴田幹大、古寺哲幸
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      特願2016-234584
    • 出願年月日
      2016-12-01

URL: 

公開日: 2018-01-16  

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