霊長類におけるゲノム・メタゲノム相関とその進化的意義の解明

2018 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 16K18630
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 早川 卓志 京都大学, 霊長類研究所, 特定助教 (00758493)
• 研究期間 (年度): 2016-04-01 – 2019-03-31
• キーワード: 霊長類 / ゲノム / メタゲノム / 腸内細菌叢 / 次世代シークエンサー

研究実績の概要

研究の最終年度として、これまでに採取した哺乳類のゲノム試料や、細菌叢試料の次世代シークエンサーでの分析をおおむね完了し、表現型との関連について考察した。特に飼育下チンパンジーの腸内細菌叢多様性に関する分析が完了した。ニホンザルを対象とした野生霊長類の腸内細菌叢を次世代シークエンサーをもちいて解析するメソドロジーに関する論文と、テングザルに前胃共生している菌叢の環境応答に関する論文を国際学術誌において出版した。

研究成果

• [雑誌論文] Improving the standards for gut microbiome analysis of fecal samples: insights from the field biology of Japanese macaques on Yakushima Island (2018)
  • 著者名/発表者名: Takashi Hayakawa, Akiko Sawada, Akifumi S. Tanabe, Shinji Fukuda, Takushi Kishida, Yosuke Kurihara, Kei Matsushima, Jie Liu, Etienne‑Francois Akomo‑Okoue, Waleska Gravena, Makoto Kashima, Mariko Suzuki, Kohmei Kadowaki, Takafumi Suzumura, Eiji Inoue, Hideki Sugiura, Goro Hanya, Kiyokazu Agata
  • 雑誌名: Primates 巻: 59 ページ: 423-436
  • DOI: 10.1007/s10329-018-0671-x
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Adaptation and conservation insights from the koala genome (2018)
  • 著者名/発表者名: Rebecca N. Johnson et al.
  • 雑誌名: Nature Genetics 巻: 50 ページ: 1102-1111
  • DOI: 10.1038/s41588-018-0153-5
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] First report of foregut microbial community in proboscis monkeys: are diverse forests a reservoir for diverse microbiomes? (2018)
  • 著者名/発表者名: Takashi Hayakawa, Senthilvel K.S.S. Nathan, Danica J. Stark, Diana A. Ramirez Saldivar, Rosa Sipangkui, Benoit Goossens, Augustine Tuuga, Marcus Clauss, Akiko Sawada, Shinji Fukuda, Hiroo Imai, Ikki Matsuda
  • 雑誌名: Environmental Microbiology Reports 巻: 10 ページ: 655-662
  • DOI: 10.1111/1758-2229.12677
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Functional decline of sweet taste sensitivity of colobine monkeys (2018)
  • 著者名/発表者名: Emiko Nishi, Nami Suzuki-Hashido, Takashi Hayakawa, Yamato Tsuji, Bambang Suryobroto, Hiroo Imai
  • 雑誌名: Primates 巻: 59 ページ: 523-530
  • DOI: 10.1007/s10329-018-0679-2
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Next-Generation Sequencing in Primate Molecular Ecology (2018)
  • 著者名/発表者名: HAYAKAWA Takashi
  • 雑誌名: Primate Research 巻: 34 ページ: 65～78
  • DOI: 10.2354/psj.34.004
  • 査読あり
• [学会発表] Natural gum feeding to captive marmosets: diet preference and gut microbiome (2019)
  • 著者名/発表者名: Takashi Hayakawa et al.
  • 学会等名: 第63回プリマーテス研究会
• [学会発表] Life slowly, life in the dark: insight from slow loris genome (2019)
  • 著者名/発表者名: Takashi Hayakawa, Shoji Tatsumoto, Takushi Kishida, Hikoyu Suzuki, Hiroe Ishikawa, Masato Nikaido, Yasuhiro Go
  • 学会等名: The 11 International Symposium on Primatology and Wildlife Science
  • 国際学会
• [学会発表] ドゥクラングール乳児の腸内細菌叢の適応 (2018)
  • 著者名/発表者名: 早川卓志、澤田晶子、川口芳矢、鈴木健大、小林智男、福田真嗣、松田一希
  • 学会等名: 第34回日本霊長類学会大会
• [学会発表] 霊長類の苦味受容体遺伝子ファミリー進化の再検討 (2018)
  • 著者名/発表者名: 早川卓志、橋戸南美
  • 学会等名: 日本進化学会第20回大会
• [図書] 霊長類図鑑―サルを知ることはヒトを知ること (2018)
  • 著者名/発表者名: 日本モンキーセンター（編）
  • 総ページ数: 155
  • 出版者: 京都通信社
  • ISBN: 4903473619
• [産業財産権] 菌叢バランス調節組成物及びその応用 (2018)
  • 発明者名: 松島慶、他
  • 権利者名: 公益財団法人日本モンキーセンター、他
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2018-241664