miRNAの中には数塩基の違いしか持たない相同miRNA群からなるファミリーが存在する。その中には癌遺伝子の活性を制御するものがあり、その発現プロファイルの解析は癌診断や治療戦略の策定に重要である。本研究では、ミスマッチ認識タンパク質を利用した高精度の逆転写反応によって相同miRNAを識別する簡易な手法の確立を目的とした。高度好熱菌由来の機能未知タンパク質群の中から、DNA/RNAハイブリッドから成る不対合塩基を認識できるタンパク質を同定した。それらが、誤対合したプライマーからの逆転写反応を特異的に抑制することを明らかにし、高精度逆転写反応に利用可能であることを示した。
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