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正常細胞としてマウス線維芽細胞である NIH3T3 細胞およびC57BL/6J-emb 細胞、悪性度の低いがん細胞としてマウスメラノーマ細胞である B16-F0 細胞およびヒト乳がん細胞である T47D 細胞を使用した。DharmaFECT トランスフェクション試薬を用いて、細胞に siRNA を導入し Pdcd4 ノックダウン細胞を作製した。また、Pdcd4 のノックダウンが、細胞内にて機能的に働いていることを AP-1 転写活性、浸潤能及び遊走能の増強により確認した。
上記の Pdcd4 ノックダウン T47D 細胞より抽出した mRNA をショ糖密度勾配遠心によりフラクションに分画し、非翻訳 mRNA 画分と翻訳 mRNA 画分に分けた。非翻訳 mRNA 画分および翻訳 mRNA 画分を用いて、マイクロアレイ解析を行い、Pdcd4 が翻訳を阻害している遺伝子候補群を得た。Quantitative RT-PCR 法にてマイクロアレイ解析の結果を確認し、p53 遺伝子ファミリーである p73 遺伝子の N 末端の転写活性化ドメインを欠損している ΔNp73 遺伝子を同定した。そこで、Pdcd4 ノックダウン T47D 細胞を用いて ΔNp73 タンパク質発現量を検討したところ、コントロールと比較して 2.5 倍増加した。さらに、MDA-MB-231 ヒト乳がん細胞に Pdcd4 を過剰発現させて T47D 細胞と同様の実験を行ったところ、コントロールと比較して ΔNp73 遺伝子の翻訳及びタンパク質発現量は減少した。
また、C57BL/6J-emb 細胞およびマウスメラノーマ細胞である B16-F0 細胞でもマイクロアレイ解析を行い、セントロメアに局在する CENP-A のシャペロンである Hjurp もPdcd4 の標的分子である可能性が示唆された。
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