消化管がん進展過程におけるエピゲノム異常とnoncodingRNA発現の統合解析

2017 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 16K19352
• 研究機関: 札幌医科大学
• 研究代表者: 新沼 猛 札幌医科大学, 医学部, 助教 (60708113)
• 研究期間 (年度): 2016-04-01 – 2018-03-31
• キーワード: 大腸癌 / lncRNA

研究実績の概要

本研究においてはまず、消化管がん転移に寄与するnoncoding RNAをThe Cancer Geneme Atlas(TCGA)データによるスクリーニングを試みた。TCGAの大腸がんの遺伝子発現データであるCOADREAD exonexpressionを用いて正常大腸より発現が高く、リンパ節転移陽性群で転移陰性群より発現が高いnoncoding RNAのexonを抽出したところ、有意な156 exonが抽出された。その中から複数のexonが存在していた21のnoncoding RNAを解析の対象とした。選択したnoncoding RNAの発現を大腸がん細胞株SW480とそのリンパ節転移より樹立されたSW620正常大腸において解析したところLOC441178とDNAJC3-AS1が正常よりSW480で高く、SW620でさらに発現が上昇しているnoncoding RNA候補として抽出された。その他大腸がん全体で正常より発現が上昇しているnoncoding RNAとしてDUXAP8, DUXAP10が抽出された。大腸癌細胞株を用いてレンチウイルスベクターによりDUXAP10をノックダウンしたところ細胞増殖を有意に抑制し、スクラッチアッセイでは遊走能の抑制が認められた。以上より消化管がん特に大腸がん転移に関与する可能性のあるnoncoding RNAを抽出することができた。cell viability assayならびにwound healing assayの機能解析の結果からDUXAP10は大腸癌において増殖、遊走能に関与するlncRNAと考えられた。DUXAP10については臨床検体での解析やエピゲノム解析中である。DNAJC3AS1などのlncRNAについては順次ノックダウン・過剰発現系による機能解析を行っているところである。

研究成果

• [雑誌論文] Evaluation of Urinary DNA Methylation as a Marker for Recurrent Bladder Cancer: A 2-Center Prospective Study. (2018)
  • 著者名/発表者名: Shindo T, Shimizu T, Nojima M, Niinuma T, Maruyama R, Kitajima H, Kai M, Itoh N, Suzuki H, Masumori N
  • 雑誌名: Urology. 巻: 113 ページ: 71-78
  • DOI: 10.1016/j.urology.2017.11.025.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Epigenetic silencing of SMOC1 in traditional serrated adenoma and colorectal cancer. (2017)
  • 著者名/発表者名: Aoki H, Yamamoto E, Takasawa A, Niinuma T, Yamano HO, Harada T, Matsushita HO, Yoshikawa K, Takagi R, Harada E, Tanaka Y, Yoshida Y, Aoyama T, Eizuka M, Yorozu A, Kitajima H, Kai M, Sawada N, Sugai T, Nakase H, Suzuki H
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 9 ページ: 4707-4721
  • DOI: 10.18632/oncotarget.23523
  • 査読あり
• [雑誌論文] Downregulation of miR-186 is associated with metastatic recurrence of gastrointestinal stromal tumors. (2017)
  • 著者名/発表者名: Niinuma T, Kai M, Kitajima H, Yamamoto E, Harada T, Maruyama R, Nobuoka T, Nishida T, Kanda T, Hasegawa T, Tokino T, Sugai T, Shinomura Y, Nakase H, Suzuki H.
  • 雑誌名: Oncol Lett. 巻: 14 ページ: 5703-5710
  • DOI: 10.3892/ol.2017.6911.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Epigenetic silencing of diacylglycerol kinase gamma in colorectal cancer. (2017)
  • 著者名/発表者名: Kai M, Yamamoto E, Sato A, Yamano HO, Niinuma T, Kitajima H, Harada T, Aoki H, Maruyama R, Toyota M, Hatahira T, Nakase H, Sugai T, Yamashita T, Toyota M, Suzuki H.
  • 雑誌名: Mol Carcinog. 巻: 56 ページ: 1743-1752
  • DOI: 10.1002/mc.22631.
  • 査読あり
• [学会発表] 消化管間質腫瘍においてエピジェネティックに制御される長鎖noncoding RNAの探索 (2017)
  • 著者名/発表者名: 新沼 猛 北嶋 洋志 山本 英一郎 甲斐 正広 仲瀬裕志 時野隆至 今井浩三 鈴木 拓
  • 学会等名: 第76回 日本癌学会学術総会
  • 国際学会
• [学会発表] 消化管間質腫瘍におけるエピジェネティック制御を受けるlncRNAの解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 新沼 猛 北嶋 洋志 甲斐 正広 鈴木 拓
  • 学会等名: 第11回 日本エピジェネティクス研究会
  • 国際学会