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2017 年度 実績報告書

次世代シークエンシングによる造血幹細胞移植後再発腫瘍のHLAアリル欠損解析

研究課題

研究課題/領域番号 16K19588
研究機関東海大学

研究代表者

青山 泰之  東海大学, 医学部, 助教 (50648475)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
キーワードLOH / 同種造血幹細胞移植 / マイクロサテライト解析
研究実績の概要

HLA不一致の同種造血幹細胞移植(Allo-HSCT)後の再発時に,レシピエント固有のHLA消失(LOH: loss of heterozygosty)症例が報告されているが,その機序は明らかにされていない.Allo-HSCTの移植後再発は予後が極めて悪いことで知られており,LOHの機序解明は,再発予防法の開発への重要な情報となると考える.そこで,LOHが腫瘍の免疫応答回避に関与しているという仮説のもと, HLA不一致allo-HSCT後の再発症例に対し,LOHの経時的変化を検証することを目的とした.解析法は,新たなLOH検索法となり得るSS-SBT法を選択した.本法は,従来法のSNPやマイクロサテライト解析(MS)では実現できなかった,LOHを生じたHLAの定性的特定およびLOHクローンの定量的検出が期待できる.
今年度は,HLA一致・不一致移植における再発時のHLA領域LOHがSS-SBT法で検出可能かを検証した.複数再発18症例の移植前および再発時のDNAを用いた.方法は,(1)HLA領域内の8マーカーによるMS解析で,LOH症例を特定し,(2)LOHおよび非LOHの計5症例に対しSS-SBT解析を実施した.
結果,MS解析によりLOHが認められた2症例は,SS-SBT解析においてもLOHが確認され,同時に消失したレシピエント固有アリルを特定した.HLA一致症例においては,ヘテロにおけるアリルリード数の比率に偏りが認められ,片側アリルがLOHを生じた可能性が示唆された.また,LOH有無の特定率は,MS解析では33%であるのに対し,SS-SBT法では100%であった。
以上により,本法がAllo-HSCTのHLA不一致のみならず一致症例においても新規LOH解析ツールとして有用であることが明らかになった.本手法は,従来法に比べ,より高確率でLOHの検出が可能である.

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公開日: 2018-12-17  

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