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2018 年度 実績報告書

頭頸部癌におけるリキッドバイオプシーによるエピジェネティック解析

研究課題

研究課題/領域番号 16K20239
研究機関浜松医科大学

研究代表者

遠藤 志織  浜松医科大学, 医学部附属病院, 診療助教 (10625205)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
キーワードリキッドバイオプシー / リアルタイムPCR / 中咽頭癌 / HPV
研究実績の概要

研究初年度は、頭頸部癌症例におけるリキッドバイオプシー(ctDNA, CTC)からのDNAを使ってエピジェネティクス解析を行う準備を行っている。最初のプレリミナリ-な実験として健常人からの血液サンプルから血漿を分離し、そこに含まれているctDNAを回収しDNA量を計測した。2名の正常人では、一般的な吸光度計でDNAは計測できなかったがPCRではACTBによる反応で1名でポジティブな反応を得ることができた。研究2年度は、HPV関連中咽頭癌患者のリキッドバイオプシーサンプルを5名の患者さんから収集した。低侵襲かつリアルタイムに個々の癌をモニタリングすることが可能であり、また癌の時空間的なheterogeneity(不均一性)を克服する次世代の分子診断法として今後重要になると考え、臨床応用に向けての研究を行った。
最終年は、HPV関連中咽頭癌に特異的なメチル化遺伝子の抽出を行った。次世代シークエンサーを使って候補8遺伝子を抽出しリキッドバイオプシーサンプルを5名20サンプルについて解析を行った。その結果、8遺伝子のうち4遺伝子でリキッドバイオプシーサンプルにてメチル化解析可能であることが明らかになった。この4遺伝子は、HPV関連中咽頭癌患者のリキッドバイオプシーによる定期的なサンプルで再発の有無を評価できる遺伝子である可能性が示唆された。リキッドバイオプシーからのDNAによってHPV関連中咽頭癌患者の予後、追加治療の有無などの評価につなげられるようにデーターの蓄積を行っていく。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2018

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Epigenetic modification of SALL1 as a novel prognostic factor of early T1 and T2 patients with head and neck cancer.2018

    • 著者名/発表者名
      Misawa K, Misawa Y, Imai A, Mochizuki D, Endo S, Mima M, Ishikawa R, Yamatodani T, Kawasaki H and Kanazawa T
    • 雑誌名

      Journal of Cancer

      巻: 9(6) ページ: 941-949

    • DOI

      10.7150/jca.23527

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The neuropeptide genes SST, TAC1, HCRT, NPY, and GAL are powerful epigenetic biomarkers in head and neck cancer: A site-specific analysis2018

    • 著者名/発表者名
      Misawa K, Mima M, Imai A, Mochizuki D, Misawa Y, Endo S, Ishikawa R, Kanazawa T and Mineta H
    • 雑誌名

      Clinical Epigenetics

      巻: 10 ページ: 52

    • DOI

      10.1186/s13148-018-0485-0

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Association of TET3 epigenetic inactivation with head and neck cancer2018

    • 著者名/発表者名
      Misawa K, Imai A, Mochizuki D, Mima M, Endo S, Misawa Y, Kanazawa T and Mineta H
    • 雑誌名

      Oncotarget

      巻: 9(36) ページ: 24480-24493

    • DOI

      10.18632/oncotarget.25333

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 脱メチル化酵素TET遺伝子の解析2018

    • 著者名/発表者名
      三澤 清、今井篤志、望月大極、遠藤志織、美馬勝人、三澤由幾、峯田周幸
    • 学会等名
      第119回日本耳鼻咽喉科学会総会

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公開日: 2019-12-27  

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