可視化メタゲノム解析法の開発

2017 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 16K21144
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 医化学一般; ゲノム医科学
• 研究機関: 東京大学 (2017); 大阪大学 (2016)
• 研究代表者: 按田 瑞恵 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 特任研究員 (60759455)
• 研究期間 (年度): 2016-04-01 – 2018-03-31
• キーワード: 全ゲノム増幅 / FISH / FACS / ロングリードシークエンス / キメラDNA

研究成果の概要

本研究課題では、微生物叢を構成する個々の微生物の探索にFACSを駆使して、標的微生物を可視化、分取し、その核酸を増幅後、次世代シークエンサーで解析する方法論の構築に取り組んだ。全ゲノム増幅産物からのゲノム構築では、キメラ DNAが問題となるために従来ショートリードシークエンサーのみが使用されてきたが、本研究ではロングリードシークエンサーを併用することで、高精度なゲノム構築が可能となることを明らかにした。

自由記述の分野

ゲノム生物学