2018 年度研究成果報告書

次世代シークエンサーを利用したメロン生殖隔離緩和遺伝子piaの解析と育種利用

研究課題

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研究課題/領域番号	16K21227
研究種目	若手研究(B)
配分区分	基金
研究分野	園芸科学遺伝育種科学
研究機関	佐賀大学
研究代表者	松本雄一佐賀大学, 農学部, 講師 (80538265)
研究期間 (年度)	2016-04-01 – 2019-03-31
キーワード	メロン / 生殖隔離
研究成果の概要	RAD-seqの結果467,632,885本のリードが得られ、Stacksを用いた解析により173,886個の遺伝子座が検出され、PI320052とPI364475間に23,929個のSNPが検出された。それらのうちF2分離集団99個体中70個体以上で検出できた1,548個のSNPをマーカーとして用い、pia遺伝子型推定の結果と合わせて解析を行ったところ、12連鎖群から成る1,473個のSNPが座乗する全長26,406cMの連鎖地図が構築された。 piaは連鎖群Hのマーカー112296とマーカー13073の間にそれぞれ10.9cMと8.5cMの距離に位置した。
自由記述の分野	園芸学
研究成果の学術的意義や社会的意義	メロン育種において野生遺伝資源の利用の妨げとなる生殖隔離の克服に向け、生殖隔離緩和遺伝子piaの利用を可能とするための遺伝子座の位置について次世代シーケンサーを用いた調査を行った。その結果遺伝子の位置する染色体の領域について明らかとなり、今後の遺伝子の詳細なメカニズムの解明や実際の品種開発への利用について基礎となる情報が得られた。これらの結果をもとにした、生殖隔離の学術的解明のほかメロンを始めとする様々な品種開発への利用・貢献が期待できる。