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2009 年度 実績報告書

メダカゲノム情報にもとづく脊椎動物染色体再編の比較ゲノム解析

研究課題

研究課題/領域番号 17018016
研究機関名古屋大学

研究代表者

堀 寛  名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (60116663)

研究分担者 三谷 啓志  東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 教授 (70181922)
清水 厚志  慶応大学, 医学部, 助教 (30327655)
金森 章  名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助教 (40324389)
キーワードメダカ / ゲノム / 染色体再編 / 比較ゲノム / BACライブラリー
研究概要

この研究課題では、先の特定研究(ゲノムC)で明らかにされたメダカWGS (whole genome shotgun sequencing)による全ゲノム概要配列の情報を有効利用し、それを基盤にして、魚類を中心にした脊椎動物染色体再編の比較ゲノム解析を行うこと、さらにメダカが脊椎動物のモテル動物の一つとして、マウス同様にヒトの遺伝病のモデルとなりうることを多くのメダカ突然変異体を解析することで証明することが目的である。
本年度においては、昨年度の延長の計画として,性分化に関与する遺伝子の同定とその発現を性分化発生過程で追った。とりわけメダカ生殖腺の初期発生で最も早く発現される転写因子の一つであるfig-alphaに注目した。このfig-alphaが卵細胞成熟に必須のzpc4やzpbの発現を支配している事や、減数分裂を支配する遺伝子scp3の発現と同調していることを明らかにした。さらにfig-alpha遺伝子の発現を支配しているシス配列部分を同定する目的で、代表的な脊椎動物のゲノム比較を行った。フグ、カエル、マウス、ヒトではfig-alpha翻訳領域は保存されているが、保存度の高いシス配列は検出されなかった。配列の相似度はなかったが、この遺伝子のフグfig-alphaの5'領域をもつGFPでその活性をしらべた結果、メダカ卵内でもフグ配列は正常に機能することが判明し、配列の不相似性によらない転写活性領域の共通性が示唆された。
また、メダカ多発性嚢胞腎の変異株pcの責任遺伝子がGli-Similar3 (glis3)であることを橋本との共同研究であきらかにした。これはヒトの多発性嚢胞腎疾患の原因遺伝子の一つであった。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2009

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (1件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Polycystic kidney disease in the medaka (Oryzias latipes) pc mutant caused by a mutation in the Gli-Similar3 (glis3) gene.2009

    • 著者名/発表者名
      Hashimoto H, Hori H, et al.
    • 雑誌名

      Plos One 4(7)

      ページ: E6299

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transgenic medaka enables easy detection of oocytes in live fish.2009

    • 著者名/発表者名
      Kinoshita M, Kanamori A, Hori H, et al.
    • 雑誌名

      Molecular Reproduction and Development 76

      ページ: 202-207

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic differentiation among local populations of medaka fish (Oryzias latipes) evaluated through grid- and deme-based sampling.2009

    • 著者名/発表者名
      Katsumura, T, Mitani, H, et al.
    • 雑誌名

      Gene 443

      ページ: 170-177

    • 査読あり
  • [学会発表] Syntheny and chromosome evolution in the Lepidoptera : Interspecies cross mapping between Papilio polytes and P.alphenor.2009

    • 著者名/発表者名
      Hori H
    • 学会等名
      8^<th> International Workshop on the Molecular Biology and Genetics of the Lepidoptera.
    • 発表場所
      Crete, Greece
    • 年月日
      20090823-20090829
  • [図書] 小型魚類がわかる,研究をささえるモデル生物-実験室いきものガイド(吉川寛・堀寛編)2009

    • 著者名/発表者名
      堀寛
    • 総ページ数
      262
    • 出版者
      化学同人

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公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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